| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第11-18页 |
| 1.1 RNA 的转录机制 | 第11页 |
| 1.2 mRNA 剪接的基本模式 | 第11-12页 |
| 1.3 可变剪接的基本形式 | 第12-13页 |
| 1.4 可变剪接的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.5 可变剪接鉴定方法 | 第14-17页 |
| 1.5.1 RT-PCR 法 | 第14页 |
| 1.5.2 生物信息学方法 | 第14-15页 |
| 1.5.3 生物芯片法 | 第15-17页 |
| 1.6 本课题的立体依据及研究内容 | 第17-18页 |
| 2 材料和方法 | 第18-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-20页 |
| 2.1.1 实验样本 | 第18页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.3 相关溶液 | 第19页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.5 软件 | 第20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-37页 |
| 2.2.1 组织总RNA 提取及质检 | 第20-22页 |
| 2.2.2 芯片实验 | 第22-32页 |
| 2.2.2.1 总RNA 纯化 | 第22页 |
| 2.2.2.2 消减总RNA 中的rRNA 及质检 | 第22-25页 |
| 2.2.2.3 反转录合成第一链cDNA | 第25-26页 |
| 2.2.2.4 合成第二链cDNA | 第26-27页 |
| 2.2.2.5 体外转录 | 第27页 |
| 2.2.2.6 cRNA 纯化及定量 | 第27页 |
| 2.2.2.7 反转录合成第一链cDNA | 第27-28页 |
| 2.2.2.8 cDNA 纯化及定量 | 第28-29页 |
| 2.2.2.9 cDNA 样品片断化及质检 | 第29-30页 |
| 2.2.2.10 样品标记 | 第30页 |
| 2.2.2.11 杂交芯片 | 第30-31页 |
| 2.2.2.12 洗涤及染色 | 第31-32页 |
| 2.2.2.12.1 准备染色试剂 | 第31页 |
| 2.2.2.12.2 洗涤工作站工作程序 | 第31-32页 |
| 2.2.2.13 扫描 | 第32页 |
| 2.2.3 数据分析 | 第32-34页 |
| 2.2.3.1 数据标准化处理 | 第32-33页 |
| 2.2.3.2 基因水平表达差异分析 | 第33页 |
| 2.2.3.3 外显子剪接差异分析 | 第33-34页 |
| 2.2.4 RT-PCR 验证 | 第34-37页 |
| 2.2.4.1 反转录合成cDNA 模板 | 第34页 |
| 2.2.4.2 引物 | 第34-35页 |
| 2.2.4.3 PCR 扩增和电泳 | 第35-37页 |
| 3 结果与讨论 | 第37-82页 |
| 3.1 组织总RNA 提取、纯化及RNA 的质量 | 第37-39页 |
| 3.2 芯片实验结果 | 第39-76页 |
| 3.2.1 消减总RNA 中的rRNA 及质检 | 第39-40页 |
| 3.2.2 线性放大及cRNA 定量 | 第40-41页 |
| 3.2.3 反转录合成单链 cDNA 及定量 | 第41-42页 |
| 3.2.4 单链 cDNA 片断化及质检 | 第42-43页 |
| 3.2.5 芯片扫描及数据分析 | 第43-76页 |
| 3.3 RT-PCR 验证 | 第76-78页 |
| 3.4 讨论 | 第78-82页 |
| 参考文献 | 第82-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 研究生阶段发表论文情况 | 第86页 |