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面向靛蓝生物制备的细胞色素P450 BM-3分子改造

致谢第5-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 文献综述第15-32页
    1.1 靛蓝第15-19页
        1.1.1 靛蓝的性质第15页
        1.1.2 靛蓝的用途第15页
        1.1.3 靛蓝的制备方法第15-19页
    1.2 酶分子的体外改造第19-22页
        1.2.1 定向进化第19-20页
        1.2.2 半理性改造第20-21页
        1.2.3 理性设计第21-22页
    1.3 细胞色素P450 BM-3的研究第22-31页
        1.3.1 细胞色素P450酶系第22页
        1.3.2 P450 BM-3的结构及催化机制第22-25页
        1.3.3 结构与功能研究第25-29页
        1.3.4 面向靛蓝生产的P450酶的分子改造第29-31页
    1.4 课题的研究目标及内容第31-32页
        1.4.1 研究目标第31页
        1.4.2 技术路线图第31页
        1.4.3 研究内容第31-32页
第二章 初筛培养基的改进及乳糖促进P450 BM-3可溶性表达的研究第32-44页
    2.1 引言第32-33页
    2.2 实验材料第33-35页
        2.2.1 菌种与质粒第33-34页
        2.2.2 试剂第34页
        2.2.3 培养基第34页
        2.2.4 主要仪器设备第34-35页
    2.3 实验方法第35-37页
        2.3.1 大肠杆菌感受态细胞制备第35页
        2.3.2 质粒的转化第35页
        2.3.3 IPTG诱导P450 BM-3表达条件第35页
        2.3.4 乳糖诱导P450 BM-3表达条件的优化第35-36页
        2.3.5 初筛方法的改进第36页
        2.3.6 P450 BM-3粗酶液的制备及纯化第36页
        2.3.7 P450 BM-3浓度测定第36页
        2.3.8 蛋白质聚丙烯酰胺凝胶电泳第36-37页
        2.3.9 摇瓶中乳糖与IPTG诱导效果的比较第37页
    2.4 结果与讨论第37-43页
        2.4.1 乳糖最佳诱导条件的确定第37-39页
        2.4.2 初筛方法的改进结果第39-41页
        2.4.3 摇瓶培养中乳糖与IPTG诱导情况的比较第41-43页
    2.5 本章小结第43-44页
第三章 P450 BM-3的168/435位点突变组合文库的构建及筛选第44-60页
    3.1 引言第44-45页
    3.2 实验材料第45-46页
        3.2.1 菌种与质粒第45页
        3.2.2 试剂第45页
        3.2.3 培养基第45页
        3.2.4 主要仪器设备第45页
        3.2.5 DNA测序及引物合成第45-46页
    3.3 实验方法第46-51页
        3.3.1 质粒提取第46页
        3.3.2 感受态细胞制备第46页
        3.3.3 突变文库的构建第46-49页
        3.3.4 突变文库的筛选第49-50页
        3.3.5 突变酶表达与纯化第50页
        3.3.6 突变酶浓度测定第50页
        3.3.7 突变酶比活力测定第50页
        3.3.8 突变酶动力学参数测定第50页
        3.3.9 突变酶电子耦合率测定第50-51页
        3.3.10 突变酶区域选择性的测定第51页
        3.3.11 突变酶三维结构模建第51页
    3.4 结果与讨论第51-59页
        3.4.1 D168L/E435T定点突变结果分析第51-52页
        3.4.2 大引物法双突变组合的饱和文库的构建与筛选第52-53页
        3.4.3 突变酶催化性能分析第53-54页
        3.4.4 突变酶的动力学参数分析第54-55页
        3.4.5 电子耦合率分析第55-56页
        3.4.6 区域选择性分析第56-58页
        3.4.7 突变酶168位点与435位点协同效应分析第58-59页
    3.5 本章小结第59-60页
第四章 易错文库的构建及筛选第60-71页
    4.1 引言第60页
    4.2 实验材料第60-61页
        4.2.1 菌种与质粒第60页
        4.2.2 试剂第60页
        4.2.3 培养基第60-61页
        4.2.4 主要仪器设备第61页
        4.2.5 DNA测序及引物合成第61页
    4.3 实验方法第61-64页
        4.3.1 质粒提取第61页
        4.3.2 感受态细胞制备第61页
        4.3.3 血红素域易错文库的构建与筛选第61-63页
        4.3.4 V445饱和突变文库的构建与筛选第63页
        4.3.5 突变酶表达与纯化第63页
        4.3.6 突变酶浓度测定第63页
        4.3.7 突变酶比活力测定第63页
        4.3.8 突变酶动力学参数测定第63-64页
        4.3.9 突变酶电子耦合率测定第64页
        4.3.10 突变酶区域选择性测定第64页
        4.3.11 突变酶三维结构模建第64页
    4.4 结果与讨论第64-70页
        4.4.1 易错文库PCR体系中Mn~(2+)浓度优化第64-66页
        4.4.2 易错文库的筛选结果与讨论第66页
        4.4.3 V445位点的饱和突变第66-68页
        4.4.4 突变酶V445A的诱导表达结果第68页
        4.4.5 突变酶催化性能分析第68-69页
        4.4.6 电子耦合率与区域选择性第69页
        4.4.7 突变酶V445A结构与功能分析第69-70页
    4.5 本章小结第70-71页
第五章 突变酶D168L/E435T/V445A的酶学性质研究第71-78页
    5.1 引言第71页
    5.2 实验材料第71-72页
        5.2.1 菌种与质粒第71页
        5.2.2 试剂第71页
        5.2.3 培养基第71页
        5.2.4 主要仪器设备第71页
        5.2.5 DNA测序及引物合成第71-72页
    5.3 实验方法第72-73页
        5.3.1 质粒提取第72页
        5.3.2 感受态细胞制备第72页
        5.3.3 突变酶D168L/E435T/V445A的构建第72页
        5.3.4 突变酶表达与纯化第72页
        5.3.5 突变酶浓度测定第72页
        5.3.6 突变酶比活力测定第72页
        5.3.7 突变酶动力学参数测定第72页
        5.3.8 突变酶电子耦合率测定第72页
        5.3.9 突变酶区域选择性测定第72-73页
        5.3.10 突变酶三维结构模建第73页
    5.4 结果与讨论第73-77页
        5.4.1 定点突变结果分析第73页
        5.4.2 突变酶催化性能分析第73-74页
        5.4.3 突变酶动力学参数分析第74-75页
        5.4.4 突变酶电子耦合效率的分析第75页
        5.4.5 突变酶催化吲哚区域选择性的分析第75-76页
        5.4.6 突变酶D168L/E435T/V445A结构与功能分析第76-77页
    5.5 本章小结第77-78页
第六章 结论与展望第78-82页
    6.1 总结第78-79页
    6.2 展望第79-82页
参考文献第82-95页
攻读博士学位期间的科研成果第95页

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