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玉米转录因子Opaque2基因的转录调控与19-kDa α-醇溶蛋白基因的DNA甲基化研究

致谢第6-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-13页
第一章 文献综述第14-36页
    1.1 玉米醇溶蛋白第14-25页
        1.1.1 玉米醇溶蛋白的分类及基因分布第14-15页
        1.1.2 玉米醇溶蛋白的表达第15-17页
        1.1.3 玉米醇溶蛋白的表达调控第17-25页
    1.2 DNA的甲基化第25-31页
        1.2.1 DNA甲基化的建立和维持第25页
        1.2.2 DNA甲基化的分类及功能第25-29页
        1.2.3 DNA甲基化的检测方法第29-31页
    1.3 蛋白质组学研究第31-33页
        1.3.1 双向电泳第31-32页
        1.3.2 质谱技术第32页
        1.3.3 同位素标记相对和绝对定量法(iTRAQ)第32页
        1.3.4 植物蛋白质组学的研究第32-33页
    1.4 本课题研究的目的、意义及主要内容第33-36页
        1.4.1 研究目的和意义第33-34页
        1.4.2 本研究的主要内容第34-36页
第二章 玉米Opaque2转录因子结合基因的全基因组分析第36-52页
    2.1 前言第36-37页
    2.2 材料与方法第37-38页
        2.2.1 数据来源第37页
        2.2.2 O2蛋白所结合的基因预测流程第37-38页
        2.2.3 染色体分布及GO(Gene Ontology)分析第38页
        2.2.4 组织表达分析第38页
    2.3 结果与分析第38-49页
        2.3.1 启动子中含TCCACGTAGA模体序列基因的鉴定与分析第38-41页
        2.3.2 启动子中含TCCACGTAGA模体序列基因的GO分析第41-42页
        2.3.3 启动子中含TCCACGTAGA模体序列基因的组织表达分析第42-44页
        2.3.4 启动子中含GATGAPyPuTGPu模体序列的基因鉴定与分析第44页
        2.3.5 启动子中含GATGAPyPuTGPu模体序列基因的GO分析第44-47页
        2.3.6 含GATGAPyPuTGPu模体序列的基因组织表达分析第47-49页
    2.4 讨论第49-51页
    2.5 小结第51-52页
第三章 玉米野生型Opaque2及其突变体的蛋白质组学分析第52-72页
    3.1 前言第52-53页
    3.2 材料和方法第53-57页
        3.2.1 材料第53页
        3.2.2 玉米种子总蛋白的提取及测定第53-54页
        3.2.3 双向电泳第54-56页
        3.2.4 质谱鉴定及数据分析第56-57页
        3.2.5 RT-PCR检测第57页
    3.3 结果与分析第57-67页
        3.3.1 种子总蛋白的双向电泳及质谱鉴定第57-63页
        3.3.2 质谱鉴定结果的GO分析第63-64页
        3.3.3 差异蛋白点的组织表达分析第64-65页
        3.3.4 RT-PCR分析第65-67页
    3.4 讨论第67-69页
        3.4.1 种子中其他形式的贮藏蛋白第67-68页
        3.4.2 O2基因的突变改变了种子中酶活性相关蛋白的表达第68-69页
    3.5 小结第69-72页
第四章 玉米19-kDa α-醇溶蛋白基因的DNA甲基化研究第72-90页
    4.1 前言第72-74页
    4.2 材料和方法第74-77页
        4.2.1 材料第74页
        4.2.2 方法第74-77页
    4.3 结果与分析第77-86页
        4.3.1 19-kDa α-醇溶蛋白基因的启动子呈现DNA甲基化多样性第77-78页
        4.3.2 组织培养能诱导特异位点的DNA甲基化第78-81页
        4.3.3 基因本体的DNA甲基化分析第81-84页
        4.3.4 CCG的甲基化第84-86页
    4.4 讨论第86-88页
        4.4.1 组织培养改变基因的甲基化第86-87页
        4.4.2 中等的基因本体甲基化水平更有利于基因的表达第87页
        4.4.3 mCCG的甲基化受到抑制第87-88页
    4.5 小结第88-90页
第五章 总结与展望第90-92页
    5.1 总结第90-91页
    5.2 展望第91-92页
参考文献第92-108页
附录第108-109页

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