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腹毛目纤毛虫包囊游仆虫休眠的分子机理研究

论文摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 综述第15-33页
    1.1 纤毛虫休眠现象的研究第15-25页
        1.1.1 原生动物概况第15页
        1.1.2 纤毛虫的研究现状第15-17页
        1.1.3 纤毛虫休眠包囊的研究第17-19页
        1.1.4 形成休眠包囊的因素第19-21页
        1.1.5 纤毛虫休眠包囊的种类和成分第21-23页
        1.1.6 纤毛虫休眠现象研究的意义第23-25页
    1.2 实时荧光定量PCR研究进展第25-27页
        1.2.1 实时荧光定量PCR技术第25-26页
        1.2.2 实时荧光定量PCR的定量方法第26-27页
        1.2.3 实时荧光定量PCR的应用第27页
    1.3 蛋白质组学研究进展第27-31页
        1.3.1 蛋白质组学的发展史第27页
        1.3.2 蛋白质组学研究的技术第27-30页
            1.3.2.1 双向电泳技术(2-DE)第28页
            1.3.2.2 质谱技术(MS)第28-30页
                1.3.2.2.1 基质辅助激光解吸质谱(MALDI TOF/MS)第29页
                1.3.2.2.2 多维液相色谱-离子阱串联质谱技术(LC-MS/MS)第29-30页
            1.3.2.3 生物信息学第30页
        1.3.3 蛋白质组学的应用第30-31页
    1.4 本课题的研究目的与意义第31-33页
第二章 包囊游仆虫细胞分化前后差异表达基因的筛选及分析第33-57页
    2.1 材料、仪器和试剂第33-35页
        2.1.1 实验材料的培养第33-34页
        2.1.2 所用仪器设备第34页
        2.1.3 实验试剂与试剂盒第34-35页
    2.2 实验方法第35-39页
        2.2.1 分别收集营养细胞和休眠包囊第35页
            2.2.1.1 营养细胞收集方法第35页
            2.2.1.2 休眠细胞收集方法第35页
        2.2.2 总RNA的提取第35-36页
        2.2.3 总RNA浓度的测定第36页
        2.2.4 cDNA第一链的合成第36-37页
        2.2.5 实时荧光相对定量PCR第37-39页
            2.2.5.1 差异表达基因的相对定量方法第37-38页
            2.2.5.2 内参基因的选择第38页
            2.2.5.3 实时荧光定量PCR反应体系第38页
            2.2.5.4 实时荧光定量PCR反应条件第38-39页
            2.2.5.5 PCR产物测序及序列分析第39页
    2.3 实验结果与分析第39-51页
        2.3.1 总RNA定性定量分析第39页
        2.3.2 实时荧光相对定量PCR第39-51页
            2.3.2.1 引物设计第39-43页
            2.3.2.2 内参基因的选择第43-45页
                2.3.2.2.1 Actin基因扩增曲线第43-44页
                2.3.2.2.2 Actin融解曲线第44-45页
            2.3.2.3 编号W3基因的扩增曲线和融解曲线第45-46页
            2.3.2.4 相对定量分析第46-49页
            2.3.2.5 序列分析第49-51页
    2.4 讨论第51-55页
    2.5 小结第55-57页
第三章 包囊游仆虫休眠包囊和营养细胞全蛋白的双向电泳分析第57-74页
    3.1 材料、仪器和试剂第57-59页
        3.1.1 实验材料的培养第57页
        3.1.2 所用仪器设备第57-58页
        3.1.3 实验试剂第58-59页
    3.2 实验方法第59-62页
        3.2.1 蛋白质的提取第59页
        3.2.2 等电聚焦第59-60页
        3.2.3 胶条平衡及SDS-PAGE电泳第60页
        3.2.4 凝胶染色第60页
        3.2.5 凝胶扫描以及图像分析第60-61页
        3.2.6 蛋白质酶解第61页
        3.2.7 质谱操作第61-62页
    3.3 实验结果与分析第62-71页
        3.3.1 蛋白定量结果第62-63页
        3.3.2 双向电泳分析结果第63-64页
        3.3.3 图像分析结果第64-69页
        3.3.4 质谱鉴定结果第69-71页
    3.4 讨论第71-73页
    3.5 小结第73-74页
第四章 包囊游仆虫休眠包囊壁蛋白的分离鉴定第74-92页
    4.1 材料、仪器和试剂第74-77页
        4.1.1 实验材料的培养第74页
        4.1.2 所用仪器设备第74-75页
        4.1.3 实验试剂第75-77页
            4.1.3.1 SDS-PAGE实验试剂第75-76页
            4.1.3.2 串联质谱实验试剂第76-77页
    4.2 实验方法第77-81页
        4.2.1 收集休眠包囊第78页
        4.2.2 包囊壁蛋白的分离、溶解和脱盐浓缩第78页
        4.2.3 包囊壁蛋白的SDS-PAGE电泳第78-79页
        4.2.4 SDS-PAGE条带的串联质谱(MS/MS)分析第79-81页
            4.2.4.1 胶内酶解及Ziptip脱盐第79-80页
            4.2.4.2 蛋白条带质谱分析第80页
            4.2.4.3 数据库检索(MALDI TOF/MS)第80-81页
    4.3 实验结果与分析第81-89页
        4.3.1 壁蛋白SDS-PAGE图谱第81-82页
        4.3.2 电泳条带的质谱(MALDI TOF/MS)鉴定结果第82-88页
            4.3.2.1 62kDa条带的肽质量指纹图谱第82页
            4.3.2.2 八个条带的串联质谱鉴定结果第82-88页
        4.3.3 条带鉴定结果及分析第88-89页
    4.4 讨论第89-91页
    4.5 小结第91-92页
中英文缩写词对照表第92-93页
参考文献第93-108页
攻读学位期间发表论文第108页
研究生期间参与科研项目第108-109页
致谢第109页

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