| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 高温菌与高温酶的筛选 | 第12-14页 |
| 1.1.1 嗜热菌概述与研究现状 | 第12-14页 |
| 1.1.2 热泉生境中高温酶的研究 | 第14页 |
| 1.2 木聚糖和木聚糖酶 | 第14-23页 |
| 1.2.1 木聚糖 | 第14页 |
| 1.2.2 木聚糖酶与来源 | 第14-15页 |
| 1.2.3 木聚糖酶的结构 | 第15-16页 |
| 1.2.4 木聚糖酶的应用 | 第16-20页 |
| 1.2.5 木聚糖酶的研究现状与问题 | 第20-21页 |
| 1.2.6 耐高温木聚糖酶的筛选与研究 | 第21-23页 |
| 1.3 云南腾冲地热区特征及嗜热菌研究现状 | 第23-25页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 Biolog ECO法研究腾冲部分热泉嗜热微生物的代谢特征 | 第26-45页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.1 样点的采集及样点基本信息 | 第26-27页 |
| 2.1.2 Biolog微孔板与主要仪器 | 第27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-30页 |
| 2.2.1 热泉样品悬浮液的制备、接种培养与实时检测 | 第27页 |
| 2.2.2 AWCD值的计算 | 第27-29页 |
| 2.2.3 微生物群落代谢多样性指数分析 | 第29页 |
| 2.2.4 各个样点代谢结构特征的聚类分析 | 第29页 |
| 2.2.5 各个样点代谢结构特征的主成分分析 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-42页 |
| 2.3.1 不同热泉环境微生物群落对全部碳源的利用 | 第30-31页 |
| 2.3.2 不同热泉环境微生物群落对同一类型底物的代谢能力差异分析 | 第31-35页 |
| 2.3.3 各个热泉环境微生物群落对不同类型底物的代谢能力差异分析 | 第35-38页 |
| 2.3.4 不同热泉环境微生物群落代谢功能多样性分析 | 第38-39页 |
| 2.3.5 不同热泉环境微生物功能多样性主成分分析 | 第39-41页 |
| 2.3.6 不同热泉环境微生物群落利用碳源的聚类分析 | 第41-42页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第42-45页 |
| 第三章 部分热泉可培养嗜热原核微生物的分离与鉴定 | 第45-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第45-51页 |
| 3.1.1 热泉样品来源及样点信息 | 第45页 |
| 3.1.2 分离培养基的设计 | 第45-47页 |
| 3.1.3 样品的处理与分离培养 | 第47页 |
| 3.1.4 菌株的分离、纯化与保藏 | 第47页 |
| 3.1.5 纯化菌株基因组DNA的提取 | 第47-48页 |
| 3.1.6 纯化菌株16S rRNA基因的PCR扩增及测序 | 第48-49页 |
| 3.1.7 纯化菌株基于16S rRNA基因序列的系统发育分析 | 第49页 |
| 3.1.8 候选新物种多相分类鉴定 | 第49-51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-63页 |
| 3.2.1 六个腾冲热泉环境嗜热原核微生物分离结果与多样性分析 | 第51-53页 |
| 3.2.2 不同热泉样点嗜热微生物多样性比较分析 | 第53-55页 |
| 3.2.3 不同分离培养基对热泉嗜热原核微生物分离的影响 | 第55-56页 |
| 3.2.4 新物种Laceyella calidiresistens YIM 79486~T sp.nov.的多相分类研究 | 第56-63页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第63-66页 |
| 第四章 富集处理分离、筛选木聚糖酶活性菌株及酶学性质初探 | 第66-87页 |
| 4.1 材料与方法 | 第66-70页 |
| 4.1.1 热泉样品来源及样点信息 | 第66页 |
| 4.1.2 样品富集处理设计与分离培养基 | 第66-67页 |
| 4.1.2.1 样品富集处理1 | 第66-67页 |
| 4.1.2.2 样品S集处理2 | 第67页 |
| 4.1.3 样品的处理与分离培养 | 第67页 |
| 4.1.4 菌株的分离、纯化与保藏 | 第67页 |
| 4.1.5 纯化菌株基因组DNA的提取、PCR扩增、测序和系统发育分析 | 第67页 |
| 4.1.6 木聚糖酶活性菌株的初筛 | 第67-68页 |
| 4.1.7 木聚糖酶活性菌株的复筛 | 第68页 |
| 4.1.8 木聚糖酶活力的测定与计算 | 第68页 |
| 4.1.9 菌株Geobacillus sp.YIM 71344发酵产酶 | 第68-69页 |
| 4.1.10 菌株Geobacillus sp.YIM 71344所产木聚糖酶酶学性质初探 | 第69-70页 |
| 4.2 结果与分析 | 第70-84页 |
| 4.2.1 直接分离得到的嗜热原核微生物中木聚糖酶活性菌株的筛选 | 第70-72页 |
| 4.2.2 富集1处理热泉样品的分离与木聚糖酶活性菌株筛选 | 第72-74页 |
| 4.2.3 富集处理2热泉样品的分离与木聚糖酶活性菌株筛选 | 第74-78页 |
| 4.2.4 热泉样品不同分离方式下木聚糖酶活性菌株筛选比较分析 | 第78-79页 |
| 4.2.5 Geobacillus sp.YIM 71344发酵产酶 | 第79-80页 |
| 4.2.6 Geobacillus sp.YIM 71344所产木聚糖酶酶学性质初探 | 第80-84页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第84-87页 |
| 第五章 两株高温木聚糖酶活性菌株的基因组学分析 | 第87-111页 |
| 5.1 材料与方法 | 第87-92页 |
| 5.1.1 实验菌株的培养和菌体细胞收集 | 第87页 |
| 5.1.2 菌株基因组DNA的提取 | 第87-88页 |
| 5.1.3 菌株Meiothermus sp.YIM 71147和Geobacillus sp.YIM 71344的全基因组测序 | 第88页 |
| 5.1.4 基因组测序数据的生物信息分析 | 第88-92页 |
| 5.2 结果与分析 | 第92-108页 |
| 5.2.1 基因组DNA的提取 | 第92页 |
| 5.2.2 基因组测序数据组装结果评价 | 第92-96页 |
| 5.2.3 基因预测与非编码RNA预测 | 第96-98页 |
| 5.2.4 基因功能注释 | 第98-101页 |
| 5.2.5 YIM71147和YIM 71344基因组分布图 | 第101-102页 |
| 5.2.6 菌株YIM 71147和YIM 71344基因组中木聚糖酶相关基因的信息分析 | 第102-104页 |
| 5.2.7 Meiothermus sp.YIM 71147和Geobacillus sp.YIM 71344基因组中木聚糖酶基因序列的分析 | 第104-108页 |
| 5.3 小结与讨论 | 第108-111页 |
| 第六章 两个热泉环境宏基因组中高温木聚糖酶基因的挖掘 | 第111-130页 |
| 6.1 材料与方法 | 第111-113页 |
| 6.1.1 样品采集与样点信息 | 第111页 |
| 6.1.2 热泉样品中微生物细胞的收集 | 第111页 |
| 6.1.3 热泉环境样品宏基因组DNA的提取 | 第111-112页 |
| 6.1.4 宏基因组测序 | 第112-113页 |
| 6.1.5 宏基因组数据的组装与生物信息分析 | 第113页 |
| 6.1.6 木聚糖酶基因序列的分析 | 第113页 |
| 6.2 结果与分析 | 第113-126页 |
| 6.2.1 金泽和供销社热泉环境样品宏基因组DNA的提取 | 第113-114页 |
| 6.2.2 金泽和供销社热泉宏基因组组装、基因预测和基因注释评价 | 第114-115页 |
| 6.2.3 金泽与供销社热泉中基于功能基因的微生物物种多样性分析 | 第115-116页 |
| 6.2.4 基因功能注释 | 第116-118页 |
| 6.2.5 两个热泉宏基因组中木聚糖酶基因的注释与分析 | 第118-126页 |
| 6.3 小结与讨论 | 第126-130页 |
| 总结与展望 | 第130-134页 |
| 参考文献 | 第134-156页 |
| 博士期间成果 | 第156-161页 |
| 致谢 | 第161-162页 |
