| 中文摘要 | 第4-6页 |
| 英文摘要 | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究课题的背景和意义 | 第10-11页 |
| 1.2 当前研究状况及存在的问题 | 第11-14页 |
| 第二章 基于高通量测序技术的小RNA研究 | 第14-38页 |
| 2.1 基于SOLiD平台构建小RNA分析流程 | 第14-16页 |
| 2.1.1 引论 | 第14页 |
| 2.1.2 流程简介 | 第14-16页 |
| 2.2 基于熵的miRNA异构体分析 | 第16-23页 |
| 2.2.1 引论 | 第16-17页 |
| 2.2.2 材料与方法 | 第17-19页 |
| 2.2.2.1 数据来源 | 第17页 |
| 2.2.2.2 熵的计算 | 第17-19页 |
| 2.2.2.3 功能富集分析 | 第19页 |
| 2.2.3 结果 | 第19-22页 |
| 2.2.3.1 MIH值概述 | 第19-20页 |
| 2.2.3.2 相关性分析 | 第20-21页 |
| 2.2.3.3 功能富集分析 | 第21-22页 |
| 2.2.4 讨论 | 第22-23页 |
| 2.2.5 小结 | 第23页 |
| 2.3 基于熵的阿尔茨海默症miRNA 5’端异构体表达失调检测 | 第23-38页 |
| 2.3.1 引论 | 第23-24页 |
| 2.3.2 材料与方法 | 第24-26页 |
| 2.3.2.1 数据来源与miRNA分析 | 第24页 |
| 2.3.2.2 5’端异构的计算 | 第24-25页 |
| 2.3.2.3 统计检测与评估 | 第25页 |
| 2.3.2.4 isomiR异构体种子序列分析 | 第25-26页 |
| 2.3.2.5 miRNA的差异表达分析 | 第26页 |
| 2.3.3 结果 | 第26-36页 |
| 2.3.3.1 基于熵得到的MIH5值概述 | 第26-27页 |
| 2.3.3.2 5’端isomiR中第二频率的种子序列潜在的功能分析 | 第27-34页 |
| 2.3.3.3 基于5’端异构体的秩和检验方法与基于表达量差异的方法之间的比较 | 第34-36页 |
| 2.3.4 讨论 | 第36页 |
| 2.3.5 小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基于高通量测序技术的长链非编码RNA研究 | 第38-56页 |
| 3.1 转录组测序数据分析与lncRNA的识别 | 第38-41页 |
| 3.1.1 引论 | 第38页 |
| 3.1.2 转录组数据的收集与处理 | 第38-39页 |
| 3.1.3 检测差异表达的转录本 | 第39-40页 |
| 3.1.4 小结 | 第40-41页 |
| 3.2 高通量测序技术下微生物群落鉴定的优化 | 第41-56页 |
| 3.2.1 引论 | 第41页 |
| 3.2.2 材料与方法 | 第41-43页 |
| 3.2.3 结果 | 第43-53页 |
| 3.2.3.1 选取的21个属中特异性片段及保守位点分析 | 第43-47页 |
| 3.2.3.2 超变区间高比率属特异性片段的分布 | 第47-49页 |
| 3.2.3.3 不同的片段长度下属特异性分析 | 第49-53页 |
| 3.2.4 讨论 | 第53-54页 |
| 3.2.5 小结 | 第54-56页 |
| 第四章 非编码RNA的起源探讨 | 第56-77页 |
| 4.1 关于miRNA的起源探讨 | 第56-63页 |
| 4.1.1 引言 | 第56-57页 |
| 4.1.2 材料和方法 | 第57-59页 |
| 4.1.3 结果与讨论 | 第59-63页 |
| 4.2 从miRNA的保守种子序列进一步探讨miRNA的起源 | 第63-68页 |
| 4.2.1 引论 | 第63页 |
| 4.2.2 材料和方法 | 第63-65页 |
| 4.2.3 结果与讨论 | 第65-67页 |
| 4.2.3.1 全基因组种子序列预测概述 | 第65页 |
| 4.2.3.2 种子序列预测结果的可靠性分析 | 第65-66页 |
| 4.2.3.3 种子序列的保守型信息 | 第66页 |
| 4.2.3.4 靶基因功能注释 | 第66-67页 |
| 4.2.4 小结 | 第67-68页 |
| 4.3 关于功能性非编码RNA的起源探讨 | 第68-77页 |
| 4.3.1 引论 | 第68页 |
| 4.3.2 材料与方法 | 第68-69页 |
| 4.3.3 基因组链内对称偏性分析 | 第69-73页 |
| 4.3.4 链内对称偏性的增加与功能性非编码RNA的关系探讨 | 第73-76页 |
| 4.3.5 小结 | 第76-77页 |
| 第五章 总结与展望 | 第77-79页 |
| 5.1 总结 | 第77页 |
| 5.2 展望 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-92页 |
| 附录 | 第92-118页 |
| 在学期间发表的论文 | 第118-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
