三种鸻形目鸟类线粒体全基因组结构及其分子系统学研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-20页 |
| 1 鸟类线粒体基因组结构及特征 | 第9-10页 |
| 2 鸟类分子系统发育研究 | 第10-15页 |
| 2.1 鸟类分子系统发育的研究进展 | 第10-13页 |
| 2.2 系统发育的研究方法 | 第13-14页 |
| 2.3 系统发育分析常用软件 | 第14-15页 |
| 3 鸻形目鸟类研究概述 | 第15-20页 |
| 3.1 鸻形目鸟类系统发育研究进展 | 第15-18页 |
| 3.2 鸻形目鸟类分类及系统发育关注的主要问题 | 第18-20页 |
| 第二章 鸻形目三种鸟类线粒体基因组结构 | 第20-51页 |
| 1 引言 | 第20页 |
| 2 实验材料 | 第20-22页 |
| 2.1 样品来源 | 第20-21页 |
| 2.2 主要仪器 | 第21页 |
| 2.3 主要试剂和药品 | 第21-22页 |
| 3 实验方法 | 第22-26页 |
| 3.1 总DNA的提取与检测 | 第22-23页 |
| 3.2 引物的设计与合成 | 第23-24页 |
| 3.3 PCR扩增与检测 | 第24-25页 |
| 3.4 序列测定及分析 | 第25-26页 |
| 4 结果 | 第26-48页 |
| 4.1 三种鸻形目鸟类线粒体DNA结构组成及特征 | 第26-33页 |
| 4.2 三种鸻形目鸟类线粒体蛋白质编码基因 | 第33-36页 |
| 4.3 三种鸻形目鸟类线粒体tRNA基因 | 第36-43页 |
| 4.4 三种鸻形目鸟类线粒体rRNA基因 | 第43页 |
| 4.5 D-Loop区 | 第43页 |
| 4.6 三种鸻形目鸟类线粒体编码基因密码子 | 第43-48页 |
| 5 讨论 | 第48-51页 |
| 5.1 鸻形目鸟类线粒体全基因组结构与顺序 | 第48页 |
| 5.2 鸻形目鸟类线粒体DNA基因碱基组成 | 第48-49页 |
| 5.3 鸻形目鸟类线粒体蛋白质编码基因的比较 | 第49-51页 |
| 第三章 鸻形目部分种系统发育关系研究 | 第51-70页 |
| 1 引言 | 第51页 |
| 2 数据与分析方法 | 第51-55页 |
| 2.1 数据来源 | 第51-52页 |
| 2.2 数据分析方法 | 第52-55页 |
| 3 结果 | 第55-66页 |
| 3.1 基于最大简约法系统发育树 | 第55-58页 |
| 3.2 基于最大似然法系统发育树 | 第58-60页 |
| 3.3 基于邻接法系统发育树 | 第60-63页 |
| 3.4 基于最小演化长度法系统发育树 | 第63-66页 |
| 4 讨论 | 第66-70页 |
| 4.1 不同数据集构建的系统发育树比较 | 第66-67页 |
| 4.2 不同系统发育树的比较 | 第67-68页 |
| 4.3 鸻形目鸟类的系统关系 | 第68-70页 |
| 第四章 总结与展望 | 第70-72页 |
| 1 本研究的主要结果 | 第70页 |
| 2 本研究的创新点 | 第70-71页 |
| 3 研究展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第78-79页 |
| 攻读硕士期间科研情况 | 第79-80页 |
| 硕士期间获奖情况 | 第80页 |
