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菠萝蜜蔗糖合成酶(AhSS2)基因全长序列的克隆及多态性分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 文献综述第11-20页
    1.1 果实中糖成分第12页
    1.2 果实糖代谢第12-16页
        1.2.1 蔗糖的生物合成及分解第12-15页
            1.2.1.1 蔗糖合成酶(Sucrose synthase,SS)第12-13页
            1.2.1.2 磷酸蔗糖合成酶(Sucrose phosphate synthase,SPS)第13-14页
            1.2.1.3 转化酶(Invertase,Ivr)第14-15页
        1.2.2 淀粉的生物分解第15-16页
    1.3 RACE技术第16-18页
        1.3.1 RACE原理第16-17页
        1.3.2 RACE技术优缺点第17页
        1.3.3 RACE技术的改进第17-18页
    1.4 菠萝蜜蔗糖合成酶相关基因的克隆第18-20页
2 菠萝蜜蔗糖合成酶AhSS2基因的全长克隆及生物信息学分析第20-34页
    2.1 实验材料第20页
    2.2 实验仪器第20页
    2.3 实验方法第20-26页
        2.3.1 菠萝蜜果实RNA的提取第20-21页
        2.3.2 RNA质量和浓度的检测第21页
        2.3.3 引物的设计第21页
        2.3.4 cDNA的合成第21-22页
        2.3.5 菠萝蜜AhSS2基因 3,RACE快速扩增第22-23页
        2.3.6 菠萝蜜AhSS2基因 5,RACE快速扩增第23页
        2.3.7 PCR扩增产物的回收纯化第23页
        2.3.8 感受态细胞的制备第23-24页
        2.3.9 pMD-19T载体连接反应第24页
        2.3.10 载体转化反应第24-25页
        2.3.11 菠萝蜜AhSS2基因全长的获取第25-26页
    2.4 结果与分析第26-34页
        2.4.1 菠萝蜜果实RNA的提取第26页
        2.4.2 菠萝蜜AhSS2基因 3,末端扩增第26页
        2.4.3 菠萝蜜AhSS2基因 5,末端扩增第26页
        2.4.4 菠萝蜜AhSS2基因的cDNA序列分析第26-27页
        2.4.5 菠萝蜜AhSS2基因的全长序列分析第27页
        2.4.6 菠萝蜜蔗糖合成酶AhSS2基因的核苷酸相似性分析第27页
        2.4.7 菠萝蜜蔗糖合成酶AhSS2基因的核苷酸分子进化树的构建第27页
        2.4.8 菠萝蜜蔗糖合成酶AhSS2基因的氨基酸相似性分析第27-28页
        2.4.9 菠萝蜜蔗糖合成酶AhSS2基因的氨基酸分子进化树的构建第28-29页
        2.4.10 编码蛋白的理化性质分析第29页
        2.4.11 编码蛋白的结构域分析第29页
        2.4.12 编码蛋白的功能位点分析第29-30页
        2.4.13 编码蛋白的疏水性分析第30页
        2.4.14 编码蛋白的信号肽分析第30-31页
        2.4.15 编码蛋白的跨膜区分析第31页
        2.4.16 编码蛋白的二级结构分析第31-32页
        2.4.17 编码蛋白的三级结构分析第32-34页
3 蔗糖合成酶基因部分序列的多态性分析第34-48页
    3.1 实验材料第34页
    3.2 实验仪器第34页
    3.3 实验方法第34-37页
        3.3.1 菠萝蜜叶片DNA的提取第34-35页
        3.3.2 DNA质量和浓度的检测第35-36页
        3.3.3 引物的设计第36页
        3.3.4 蔗糖合成酶外显子及内含子序列的扩增第36-37页
        3.3.5 PCR产物的回收纯化、载体连接及克隆等第37页
    3.4 结果与分析第37-48页
        3.4.1 菠萝蜜叶片DNA的提取第37页
        3.4.2 DNA快速扩增第37页
        3.4.3 菠萝蜜蔗糖合成酶基因的种质间外显子序列多态性分析第37-40页
        3.4.4 基于菠萝蜜蔗糖合成酶基因外显子种质聚类分析第40-44页
        3.4.5 菠萝蜜蔗糖合成酶基因的种质间内含子序列多态性分析第44-46页
        3.4.6 基于菠萝蜜蔗糖合成酶基因内含子种质聚类分析第46-48页
4 讨论第48-51页
    4.1 菠萝蜜AhSS2基因的cDNA全长克隆第48页
    4.2 菠萝蜜AhSS2基因的起源与进化第48-49页
    4.3 菠萝蜜种质间外显子的多态性分析第49页
        4.3.1 外显子序列多态性在遗传多样性分析中的应用第49页
        4.3.2 外显子序列多态性对酶功能的影响第49页
    4.4 菠萝蜜种质间内含子序列的多态性分析第49-51页
5 结论第51-53页
参考文献第53-61页
致谢第61-62页
作者简介第62-63页
导师简介第63页

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