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胞苷酸羟甲基化酶MilA的酶学特性研究及改造

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
目录第7-10页
第一章 文献综述第10-30页
   ·天然产物生物合成中酶分子改造的意义第10-20页
     ·酶催化机理的阐明第10-12页
     ·酶分子改造在生物催化中的应用第12-18页
     ·酶分子改造在代谢工程中的应用第18-20页
   ·酶分子改造中的基本技术第20-23页
     ·酶突变库的构建第21-23页
     ·酶突变库的筛选第23页
   ·米多霉素生物合成与胞苷单磷酸羟甲基化酶第23-28页
     ·米多霉素的生物合成第23-25页
     ·胞苷单磷酸羟甲基化酶MilA 及其核糖底物特异性第25-28页
   ·本研究内容和目的第28-30页
第二章 材料与方法第30-41页
   ·实验材料第30-33页
     ·菌株第30-31页
     ·质粒第31页
     ·培养基和化学试剂第31-32页
     ·本实验所用的PCR 引物第32-33页
   ·实验方法第33-41页
     ·菌种培养及菌种保藏第33页
     ·大肠杆菌质粒DNA 的小量提取第33页
     ·DNA 酶切、酶连及末端去磷酸化第33-34页
     ·DNA 的琼脂糖凝胶电泳第34页
     ·DNA 片段的回收第34页
     ·DNA 的钙转化法第34-35页
     ·DNA 的测序第35页
     ·SDS 聚丙烯酰胺凝胶的配制第35-36页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第36页
     ·考马斯亮蓝染色及脱色第36页
     ·突变菌株的构建第36-38页
     ·融合蛋白的表达第38页
     ·融合蛋白的FPLC 纯化第38页
     ·融合蛋白的重力柱纯化第38-39页
     ·MilA 及其突变株的细胞裂解液的催化反应第39页
     ·MilA 及其突变蛋白的体外催化反应第39-40页
     ·氨基酸序列分析第40页
     ·蛋白质高级结构分析第40-41页
第三章 野生型 MilA 的体外反应和机理验证第41-53页
   ·野生型MilA 与dCMP 的体外反应第41-42页
   ·野生型MilA 对CMP 的底物偏好性第42-44页
   ·野生型MilA 的酶动力学研究第44-49页
     ·底物CMP 和dCMP 标准曲线的绘制第44-46页
     ·反应动力学体系的优化第46-48页
     ·野生型MilA 酶动力学参数的表征第48-49页
   ·H_2~(18)O 喂养MilA 的体外反应第49-52页
   ·本章小结第52-53页
第四章 MilA 及其所在超家族同源蛋白的生物信息学分析第53-63页
   ·MilA 同源蛋白的氨基酸序列比对第54-57页
   ·MilA 同源蛋白的二级结构比对第57-60页
   ·MilA 同源蛋白的三维结构分析第60-62页
   ·本章小结第62-63页
第五章 MilA 突变蛋白的底物特异性研究第63-72页
   ·MilA 突变株的构建第63-65页
   ·MilA 及其突变株细胞裂解液的催化反应第65-67页
   ·MilA 及其突变蛋白的纯化第67-70页
   ·MilA 及其突变蛋白的体外反应第70-71页
   ·本章小结第71-72页
第六章 全文总结第72-74页
   ·主要结论第72-73页
   ·研究展望第73-74页
参考文献第74-81页
致谢第81-82页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第82-85页
附件第85页

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