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2016年昆明市肠道病毒EV71分离株全基因序列分析

缩略词表第7-8页
中文摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
前言第11-16页
    1. HFMD流行概况第11-16页
        1.1 世界范围流行情况第11-12页
        1.2 国内近年来流行概况第12-13页
        1.3 手足口病传播模式、易感人群、传播途径及流行特征第13-14页
        1.4 手足口病病原学特征第14-16页
材料与方法第16-29页
    1. 材料第16-18页
        1.1 样本来源第16页
        1.2 细胞株第16页
        1.3 仪器、试剂及耗材第16-18页
            1.3.1 仪器第16-17页
            1.3.2 试剂第17页
            1.3.3 耗材第17页
            1.3.4 部分试剂配置第17-18页
    2. 方法第18-29页
        2.1 标本的采集第18页
        2.2 咽拭子EV71分子检测第18-22页
            2.2.1 RNA提取第18-19页
            2.2.2 一步法逆转录PCR第19-20页
            2.2.3 EV71-VP1的PCR扩增第20-21页
            2.2.4 电泳检测第21-22页
            2.2.5 测序分析第22页
        2.3 毒株细胞扩培第22-24页
            2.3.1 细胞复苏第22-23页
            2.3.2 病毒接种和观察第23页
            2.3.3 病毒的纯化第23-24页
        2.4 病毒全基因组扩增及分析第24-29页
            2.4.1 病毒RNA的提取第24-26页
            2.4.2 全基因扩增第26-28页
            2.4.3 全基因的生物信息学分析第28-29页
结果第29-54页
    1 毒株鉴定及咽拭子EV71病毒阳性情况第29-30页
    2 病毒分离结果第30页
    3 病毒全基因组扩增结果第30-31页
    4 昆明KM01-KM10毒株序列测定与成分分析第31-35页
        4.1 KM01-KM10序列测定及拼接第31-32页
        4.2 昆明KM01-KM10毒株的核苷酸分析第32-33页
        4.3 昆明KM01-KM10毒株氨基酸组成的分析第33-35页
    5 昆明KM01-KM10毒株与现有分型序列的核苷酸同源性比较第35-40页
        5.1 全核苷酸序列同源性比较第35-36页
        5.2 5'UTR核苷酸序列同源性比较第36页
        5.3 VP1区核苷酸序列同源性比较第36-37页
        5.4 VP4区核苷酸序列同源性比较第37-38页
        5.5 P1区核苷酸序列同源性比较第38-39页
        5.6 P2和P3区核苷酸序列同源性比较第39-40页
    6 昆明KM01-KM10毒株氨基酸序列同源性比较第40-43页
        6.1 氨基酸全长同源性比较第40页
        6.2 VP1区段的氨基酸同源性比较第40-41页
        6.3 VP4区段的氨基酸同源性比较第41-42页
        6.4 P1区氨基酸同源性比较第42-43页
        6.5 P2+P3区氨基酸同源性比较第43页
    7 昆明KM01-KM10毒株核苷酸系统进化树分析第43-49页
    8 重组分析第49-54页
讨论第54-58页
结论第58-59页
参考文献第59-64页
论文综述 肠道病毒EV71感染致中枢神经系统损伤的发病机制及治疗的研究进展第64-78页
    参考文献第73-78页
攻读学位期间获得的学术成果第78-79页
致谢第79页

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