| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 英文缩写词表 | 第10-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 转录组学在药用植物中的研究现状 | 第11-15页 |
| 1.1.1 转录组学 | 第11页 |
| 1.1.2 转录组学的研究方法 | 第11-14页 |
| 1.1.3 高通量测序技术在药用植物转录组学研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.2 粘毛黄芩黄酮类化合物的次生代谢研究进展 | 第15-19页 |
| 1.2.1 黄酮类化合物的结构及其分类 | 第15-16页 |
| 1.2.2 黄酮类化合物的药理作用 | 第16-17页 |
| 1.2.3 黄酮类生物合成途径及相关基因的研究 | 第17-19页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 第2章 粘毛黄芩转录组测序及黄酮类化合物合成途径基因的发掘 | 第21-41页 |
| 2.1 前言 | 第21页 |
| 2.2 材料 | 第21-22页 |
| 2.2.1 主要实验仪器设备 | 第21页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第21-22页 |
| 2.3 方法 | 第22-25页 |
| 2.3.1 粘毛黄芩RNA提取 | 第22页 |
| 2.3.2 RNA质量检测 | 第22-23页 |
| 2.3.3 cDNA文库构建 | 第23页 |
| 2.3.4 Illumina测序、短读序组装和注释 | 第23-24页 |
| 2.3.5 预测编码蛋白框CDS | 第24-25页 |
| 2.3.6 SSR检测 | 第25页 |
| 2.4 结果与分析 | 第25-39页 |
| 2.4.1 粘毛黄芩转录组序列拼接与统计 | 第25-26页 |
| 2.4.2 粘毛黄芩转录组的功能注释与功能分类 | 第26-27页 |
| 2.4.3 粘毛黄芩转录组的代谢途径分析 | 第27-31页 |
| 2.4.4 粘毛黄芩转录组功能基因CDS预测结果与分析 | 第31-32页 |
| 2.4.5 粘毛黄芩转录组SSR分析 | 第32-33页 |
| 2.4.6 粘毛黄芩黄酮类生物合成和转运相关的候选基因 | 第33-39页 |
| 2.5 讨论 | 第39-41页 |
| 2.5.1 粘毛黄芩转录组测序与功能注释 | 第39-40页 |
| 2.5.2 粘毛黄芩黄酮类生物合成相关基因的发掘与分析 | 第40-41页 |
| 第3章 粘毛黄芩总黄酮含量的测定及其合成关键基因的表达分析 | 第41-59页 |
| 前言 | 第41页 |
| 第一节 粘毛黄芩不同部位总黄酮含量的测定 | 第41-45页 |
| 3.1.1 材料与仪器 | 第41-42页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第42页 |
| 3.1.3 结果与分析 | 第42-45页 |
| 3.1.4 讨论 | 第45页 |
| 第二节 粘毛黄芩中黄酮类物质合成关键酶基因和转录因子的表达测定 | 第45-59页 |
| 3.2.1 材料与仪器 | 第45页 |
| 3.2.2 RQ-PCR的引物设计 | 第45-46页 |
| 3.2.3 粘毛黄芩各时期根、茎和叶总RNA的提取 | 第46-47页 |
| 3.2.4 cDNA第一链的合成 | 第47-48页 |
| 3.2.5 RT-PCR反应 | 第48-49页 |
| 3.2.6 PCR产物的回收及纯化 | 第49页 |
| 3.2.7 亚克隆与测序 | 第49-51页 |
| 3.2.8 实时荧光定量PCR | 第51页 |
| 3.2.9 结果与分析 | 第51-57页 |
| 3.2.10 讨论 | 第57-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第75页 |
