| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 黄芩研究概述 | 第11-12页 |
| 1.1.1 黄芩属研究概况 | 第11页 |
| 1.1.2 黄芩地理分布与资源概况 | 第11-12页 |
| 1.2 黄酮类化合物研究概况 | 第12-16页 |
| 1.2.1 黄芩中的黄酮类化合物 | 第12页 |
| 1.2.2 黄芩黄酮类化合物含量测定方法及其药用价值 | 第12-14页 |
| 1.2.3 黄酮类化合物代谢途径 | 第14页 |
| 1.2.4 黄酮合成途径关键酶基因 | 第14-16页 |
| 1.2.5 参与黄酮类化合物合成的相关转录因子 | 第16页 |
| 1.3 转录组研究概况 | 第16-18页 |
| 1.3.1 转录组概念与高通量测序技术 | 第16-17页 |
| 1.3.2 药用植物的高通量测序 | 第17-18页 |
| 1.4 本文研究的目的与意义 | 第18-19页 |
| 第2章 黄芩转录组测序及数据分析 | 第19-33页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第20页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第20页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 黄芩总RNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 总RNA质量检测 | 第21页 |
| 2.2.3 CDNA文库构建 | 第21-22页 |
| 2.2.4 ILLUMINA测序、短读序拼接 | 第22页 |
| 2.2.5 功能注释 | 第22页 |
| 2.2.6 CDS预测 | 第22页 |
| 2.2.7 SSR检测 | 第22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-31页 |
| 2.3.1 黄芩总RNA提取结果 | 第22-23页 |
| 2.3.2 ILLUMINA测序与拼接分析 | 第23-24页 |
| 2.3.3 黄芩转录组的功能注释与功能分类 | 第24-25页 |
| 2.3.4 黄芩转录组代谢途径分析 | 第25-28页 |
| 2.3.5 黄酮类化合物合成过程中相关基因 | 第28-29页 |
| 2.3.6 黄芩转录组CDS预测 | 第29-30页 |
| 2.3.7 黄芩转录组SSR | 第30-31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-33页 |
| 2.4.1 黄芩转录组测序与功能注释 | 第31页 |
| 2.4.2 黄酮类合成相关基因的发掘 | 第31-32页 |
| 2.4.3 黄芩转录组中SSR位点的分布特征 | 第32-33页 |
| 第3章 黄芩生长期黄酮类化合物含量的测定 | 第33-39页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第33-34页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第33-34页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第34页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第34页 |
| 3.2 实验方法 | 第34-36页 |
| 3.2.1 标品溶液的制备 | 第34页 |
| 3.2.2 标准曲线的制备 | 第34-35页 |
| 3.2.3 样品溶液制备 | 第35页 |
| 3.2.4 精密度实验 | 第35页 |
| 3.2.5 稳定性实验 | 第35-36页 |
| 3.2.6 样品测定 | 第36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-37页 |
| 3.3.1 不同器官中黄酮类化合物的含量 | 第36页 |
| 3.3.2 不同时期根中黄酮类化合物的含量变化 | 第36页 |
| 3.3.3 不同时期茎中黄酮类化合物的含量变化 | 第36-37页 |
| 3.3.4 不同时期叶中黄酮类化合物的含量变化 | 第37页 |
| 3.4 讨论 | 第37-39页 |
| 第4章 黄芩中黄酮类化合物合成关键基因CHS、CHI、F3H基因及BHLH、MYB2转录因子表达分析 | 第39-63页 |
| 4.1 材料与试剂 | 第40-41页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第40页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第40-41页 |
| 4.1.3 实验仪器 | 第41页 |
| 4.2 实验方法 | 第41-45页 |
| 4.2.1 黄芩根、茎、叶RNA提取 | 第41页 |
| 4.2.2 总RNA质量检测 | 第41页 |
| 4.2.3 第一链CDNA的合成 | 第41-42页 |
| 4.2.4 引物设计及合成 | 第42页 |
| 4.2.5 PCR扩增反应 | 第42-43页 |
| 4.2.6 目的条带的回收和纯化 | 第43页 |
| 4.2.7 目的片段与载体的连接 | 第43页 |
| 4.2.8 连接产物的转化 | 第43-44页 |
| 4.2.9 菌液PCR鉴定阳性克隆 | 第44页 |
| 4.2.10 REAL-TIME PCR | 第44-45页 |
| 4.3 结果与分析 | 第45-53页 |
| 4.3.1 黄芩根、茎、叶3个时期RNA提取结果 | 第45页 |
| 4.3.2 黄芩CHS、CHI、F3H基因及BHLH、MYB2转录因子保守区的克隆 | 第45-51页 |
| 4.3.3 REAL-TIME PCR溶解曲线和扩增曲线 | 第51-53页 |
| 4.4 黄芩CHS、CHI、F3H基因及BHLH、MYB2转录因子REAL-TIME PCR表达分析 | 第53-59页 |
| 4.4.1 CHS基因的表达分析 | 第53-54页 |
| 4.4.2 CHI基因的表达分析 | 第54-56页 |
| 4.4.3 F3H基因表达分析 | 第56-57页 |
| 4.4.4 BHLH转录因子的表达分析 | 第57-58页 |
| 4.4.5 MYB2转录因子的表达分析 | 第58-59页 |
| 4.5 讨论 | 第59-63页 |
| 4.5.1 黄芩CHS、CHI基因的表达量与黄酮类化合物之间的累积关系 | 第60页 |
| 4.5.2 黄芩F3H基因表达量与黄酮类化合物之间的累积关系 | 第60-61页 |
| 4.5.3 黄芩BHLH、MYB2转录因子的表达量与CHS、CHI、F3H基因的表达量及黄酮类化合物累积之间的关系 | 第61-63页 |
| 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第77页 |
