| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| ·脂肪生成机制及候选基因研究 | 第12-18页 |
| ·脂肪生成机制 | 第12-13页 |
| ·影响脂肪沉积的因素 | 第13-15页 |
| ·脂肪沉积候选基因的研究 | 第15-18页 |
| ·miRNA的研究进展 | 第18-23页 |
| ·miRNA的发现 | 第19-21页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第21页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第21-22页 |
| ·翻译抑制 | 第21-22页 |
| ·mRNA降解 | 第22页 |
| ·转录调控 | 第22页 |
| ·miRNA的检测 | 第22-23页 |
| ·本研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-37页 |
| ·试验材料 | 第24-26页 |
| ·试验动物及样品采集 | 第24页 |
| ·主要数据库 | 第24-25页 |
| ·生物分析软件 | 第25页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·主要仪器 | 第25-26页 |
| ·试验方法 | 第26-37页 |
| ·样品总RNA的提取 | 第26页 |
| ·Total RNA样品检测 | 第26-27页 |
| ·small RNA文库的构建 | 第27-30页 |
| ·3’端接头连接 | 第27-28页 |
| ·5’端接头连接 | 第28页 |
| ·反转录以及扩增反应 | 第28-29页 |
| ·cDNA纯化 | 第29-30页 |
| ·文库质检及上机测序 | 第30页 |
| ·small测序数据分析 | 第30-32页 |
| ·有效数据的获得 | 第31页 |
| ·比对注释 | 第31页 |
| ·样品间差异表达分析 | 第31-32页 |
| ·数字基因表达谱文库构建 | 第32页 |
| ·mRNA的分离 | 第32页 |
| ·mRNA建库及测序 | 第32页 |
| ·数字基因表达谱测序数据分析 | 第32-33页 |
| ·测序数据质量评估及处理 | 第32-33页 |
| ·基因表达定量 | 第33页 |
| ·差异表达miRNA的靶基因预测 | 第33页 |
| ·靶基因的GO注释和KEGG-PATHWAY分析 | 第33-34页 |
| ·差异表达miRNAs的qRT-PCR验证 | 第34-37页 |
| ·肝脏组织总RNA的提取及质量检测 | 第34-35页 |
| ·miRNA反转录 | 第35-36页 |
| ·qRT-PCR | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-54页 |
| ·RNA质量检测 | 第37-39页 |
| ·small RNA测序数据分析 | 第39-43页 |
| ·测序数据总览 | 第39-40页 |
| ·序列长度统计 | 第40页 |
| ·测序原始数据质控 | 第40-41页 |
| ·miRNA的差异表达分析 | 第41-43页 |
| ·数字基因表达谱结果分析 | 第43-49页 |
| ·原始序列质控 | 第43-44页 |
| ·Reads比对数据结果 | 第44-45页 |
| ·Gene比对数据结果 | 第45-46页 |
| ·测序饱和度分析 | 第46-47页 |
| ·显著性差异表达基因的分布散点图 | 第47-48页 |
| ·差异表达基因分析 | 第48-49页 |
| ·差异表达miRNA靶基因与差异显著mRNA关联分析 | 第49-50页 |
| ·靶基因的GO注释和KEGG分析 | 第50-52页 |
| ·差异表达miRNA的qRT-PCR验证 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| ·Solexa测序数据质量的可靠性 | 第54-55页 |
| ·miRNA与其靶基因之间关系的研究及对脂肪沉积的调控 | 第55-57页 |
| 5 结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-69页 |
| 致谢 | 第69页 |