桃EST-SSR引物开发及其在部分蔷薇科物种中的通用性研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略词 | 第8-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-21页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| ·分子标记技术与SSR | 第12-13页 |
| ·SSR引物开发方法 | 第13-16页 |
| ·实验挖掘法 | 第14-15页 |
| ·软件挖掘法 | 第15-16页 |
| ·研究进展 | 第16-19页 |
| ·桃SSR引物开发现状 | 第16-18页 |
| ·蔷薇科EST序列研究进展 | 第18-19页 |
| ·本研究目的、意义及创新点 | 第19-20页 |
| ·本研究目的 | 第19-20页 |
| ·本研究意义 | 第20页 |
| ·技术路线 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-28页 |
| ·材料、试剂与设备 | 第21-23页 |
| ·实验材料 | 第21-22页 |
| ·主要试剂 | 第22-23页 |
| ·主要设备与耗材 | 第23页 |
| ·实验方法 | 第23-28页 |
| ·DNA准备 | 第23-24页 |
| ·ESTs数据获得与处理 | 第24页 |
| ·EST-SSR位点查找与引物设计 | 第24-25页 |
| ·二核苷酸EST-SSR引物的PCR验证 | 第25-27页 |
| ·EST-SSR引物在蔷薇科植物中的通用性检验 | 第27-28页 |
| ·聚类分析 | 第28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-42页 |
| ·EST-SSRs规模 | 第28-29页 |
| ·ESTs规模 | 第28页 |
| ·EST-SSRs规模 | 第28-29页 |
| ·EST-SSRs类型与分布频率 | 第29-31页 |
| ·基序长度(Motif size) | 第29页 |
| ·基序组成(Motif forms) | 第29-30页 |
| ·重复次数(Repeat numbers) | 第30-31页 |
| ·EST-SSR引物 | 第31-34页 |
| ·引物设计 | 第31-32页 |
| ·引物抽选 | 第32-34页 |
| ·引物验证 | 第34-37页 |
| ·DNA质量检测 | 第34页 |
| ·等位基因与杂合度 | 第34-37页 |
| ·重复次数区间比较 | 第37页 |
| ·桃EST-SSR引物在蔷薇科的通用性分析 | 第37-42页 |
| ·通用性矩阵与缺失分布 | 第37-40页 |
| ·等位基因与杂合度 | 第40-41页 |
| ·聚类分析 | 第41-42页 |
| 4 讨论与结论 | 第42-46页 |
| ·EST-SSR类型和分布频率 | 第42-43页 |
| ·SSR引物开发效率和扩增 | 第43-44页 |
| ·通用性分析 | 第44-45页 |
| ·聚类分析 | 第45页 |
| ·重要结论 | 第45-46页 |
| 5 展望 | 第46-47页 |
| 6 本研究创新点 | 第47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 硕士阶段发表论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
