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葡萄bZIP转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及VvbZIP45/VvbZIP08(AREB/ABF类)基因的功能研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
缩略词(Abbreviations)第14-15页
第一章 文献综述第15-29页
 1 引言第15页
 2 植物转录因子的研究概况第15-17页
   ·植物转录因子的数量及基因家族第15-16页
   ·葡萄转录因子的数量和基因家族第16-17页
 3 bZIP转录因子家族的研究进展第17-24页
   ·bZIP转录因子的结构第18-19页
   ·bZIP转录因子的绑定特性第19页
   ·bZIP转录因子的生物学功能第19-24页
 4 AREB/ABF类转录因子的调控网络第24-25页
 5 bZIP转录因子的全基因组鉴定第25-26页
 6 本研究的目的及意义第26-29页
第二章 葡萄bZIP基因家族的全基因组分析及表达模式研究第29-65页
 1 引言第30-32页
 2 材料和方法第32-40页
   ·葡萄中bZIP转录因子的全基因组鉴定第32-34页
   ·VvbZIP家族的进化分析和保守motifs的鉴定第34页
   ·VvbZIP基因的结构、染色体定位和基因加倍分析第34-35页
   ·植物材料处理和准备第35页
   ·RNA提取、引物设计和定量RT-PCR第35-40页
 3 结果与分析第40-61页
   ·葡萄bZIP基因家族的全基因组鉴定第40-42页
   ·葡萄bZIP基因家族的系谱发生分析及亚家族分类第42-43页
   ·葡萄bZIP基因家族的分类和扩增模式分析第43-44页
   ·葡萄bZIP基因的结构第44-48页
   ·葡萄bZIP转录因子蛋白保守结构域的分析第48-51页
   ·葡萄bZIP转录因子绑定特异性的预测第51-54页
   ·葡萄bZIP基因在组织/器官不同发育阶段的表达分析第54-57页
   ·在葡萄各种组织发育中差异表达的bZIP基因分析第57-58页
   ·葡萄bZIP基因组织特异性表达的荧光定量PCR验证第58-60页
   ·葡萄bZIP基因在干旱和高温胁迫处理下的表达情况第60-61页
 4 讨论第61-65页
   ·葡萄bZIP基因家族的分布和共线性分析反映出葡萄基因组的进化印迹第61-62页
   ·葡萄和拟南芥中具有共线性关系的同源基因第62-63页
   ·bZIP基因在响应干旱和高温胁迫中的两种机制第63-65页
第三章 bZIP转录因子无内含子亚家族(C亚家族)的进化和表达分析第65-93页
 1 引言第66-67页
 2 材料与方法第67-69页
   ·植物基因组信息第67页
   ·植物bZIP基因家族的全基因组鉴定第67-68页
   ·进化树构建第68页
   ·bZIP基因在基因组中的共线性(Synteny)分析第68页
   ·Microarray表达数据分析第68页
   ·qRT-PCR分析的材料处理及数据处理第68-69页
 3 结果与分析第69-90页
   ·植物bZIP转录因子家族的鉴定第69-70页
   ·植物bZIP转录因子家族的系谱发生分析第70-72页
   ·植物bZIP基因在各亚家族中的分布情况第72-73页
   ·无内含子bZIP基因在各亚家族中的分布情况第73-75页
   ·亚家族C的基因结构和共线性分析第75-76页
   ·葡萄bZIP基因家族亚家族C的染色体分布第76-77页
   ·亚家族C基因的蛋白长度第77-78页
   ·bZIP亚家族C基因的表达分析第78-90页
 4 讨论第90-93页
第四章 葡萄VvAREB1(VvbZIP45)基因的克隆及功能分析第93-119页
 1 引言第94-95页
 2 材料与方法第95-103页
   ·植物材料第95页
   ·载体和菌株第95-96页
   ·培养基第96-97页
   ·仪器、耗材和试剂第97页
   ·方法第97-103页
 3 结果与分析第103-117页
   ·基因的克隆与序列分析第103-108页
   ·VvAREB1超表达载体的构建第108-109页
   ·转基因拟南芥的鉴定第109-110页
   ·转VvAREB1后的拟南芥对ABA的响应第110-111页
   ·转VvAREB1后的拟南芥对盐胁迫的响应第111-112页
   ·转VvAREB1后的拟南芥对干旱处理的抗性分析第112-113页
   ·转VvAREB1后的拟南芥对干燥处理的抗性分析第113-114页
   ·转VvAREB1基因对拟南芥AREB/ABF类转录因子下游基因表达的影响第114-117页
 4 讨论第117-119页
第五章 葡萄VvbZIP45/VvbZIP08(旁系同源基因对)启动子的克隆及表达特性分析第119-135页
 1 引言第120-121页
 2 材料与方法第121-123页
   ·植物材料第121页
   ·引物及相关试剂第121-122页
   ·载体及菌株第122页
   ·方法第122-123页
 3 结果与分析第123-133页
   ·VvbZIP45/VvbZIP08基因的进化背景分析第123-124页
   ·VvbZIP45/VvbZIP08基因启动子的克隆和序列分析第124-128页
   ·VvbZIP45/VvbZIP08启动子的植物表达载体构建第128页
   ·VvbZIP45/VvbZIP08启动子表达模式分析第128-133页
 4 讨论第133-135页
全文结论第135-137页
主要创新点第137-139页
参考文献第139-149页
附录第149-167页
博士期间发表的研究论文第167-169页
致谢第169页

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