| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 综述 | 第9-20页 |
| ·淀粉简介 | 第9-12页 |
| ·淀粉的结构 | 第9-10页 |
| ·直链淀粉简介 | 第10-11页 |
| ·支链淀粉简介 | 第11-12页 |
| ·淀粉生物合成的相关酶 | 第12-16页 |
| ·颗粒结合型淀粉合成酶GBSS | 第12-14页 |
| ·可溶性淀粉合成酶SSS | 第14-16页 |
| ·淀粉分支酶SBE | 第16页 |
| ·ADP焦磷酸化酶AGPase | 第16页 |
| ·淀粉去分支酶SBE | 第16页 |
| ·其它参与淀粉合成的酶 | 第16页 |
| ·药用野生稻概述 | 第16-18页 |
| ·研究目的及意义 | 第18-20页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第20-27页 |
| ·植物材料的选取 | 第20页 |
| ·实验方法 | 第20-26页 |
| ·植物总RNA的提取和文库的构建 | 第20页 |
| ·反转录cDNA的第一条链 | 第20-21页 |
| ·PCR扩增 | 第21-22页 |
| ·序列测定 | 第22-23页 |
| ·实时荧光定量PCR反应及各项参数 | 第23-25页 |
| ·Real-time反应条件的优化 | 第25-26页 |
| ·实验数据处理 | 第26-27页 |
| ·转录组数据组装及功能注释 | 第26页 |
| ·基因表达差异的计算 | 第26-27页 |
| 第三章 药用野生稻叶转录组测序分析及淀粉合成酶基因家族的识别 | 第27-41页 |
| ·转录组数据统计 | 第27-32页 |
| ·应用BLAST对转录组进行功能注释 | 第28-29页 |
| ·基于GO（Gene Ontology）和InterPro的功能注释 | 第29-30页 |
| ·通过InterPro预测蛋白功能 | 第30页 |
| ·COG功能分类和KEGG代谢途径分类 | 第30-32页 |
| ·淀粉合成酶基因家族的识别 | 第32-41页 |
| ·栽培稻中淀粉合成酶基因家族 | 第32页 |
| ·栽培稻中淀粉合成酶基因的结构 | 第32-34页 |
| ·转录组原始数据进行分析 | 第34页 |
| ·药用野生稻淀粉合成酶基因组成和序列特点 | 第34-37页 |
| ·同源性与谱系关系分析 | 第37-39页 |
| ·讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 淀粉合成酶基因家族基因表达及分析 | 第41-47页 |
| ·RNA纯度和完整性分析 | 第41页 |
| ·淀粉合成酶基因家族相关基因的引物设计 | 第41-42页 |
| ·测序结果 | 第42页 |
| ·淀粉合成酶基因家族定量分析 | 第42-46页 |
| ·实时荧光定量PCR各项参数指标 | 第42-44页 |
| ·淀粉合成酶基因家族在叶子中的的相对表达及分析 | 第44-45页 |
| ·淀粉合成酶基因家族在种子中的的相对表达及分析 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-47页 |
| 附录 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |