| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 主要符号对照表 | 第9-11页 |
| 第1章 引言 | 第11-21页 |
| ·X射线晶体学 | 第12-15页 |
| ·X射线晶体学的发展历程 | 第12-14页 |
| ·X射线晶体学的原理 | 第14-15页 |
| ·X射线衍射中的相位问题 | 第15-18页 |
| ·相位问题是如何产生 | 第15-16页 |
| ·相位问题的解决方法 | 第16-18页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第18-21页 |
| ·总结蛋白质晶体衍射数据的收集与数据处理 | 第18-19页 |
| ·对不同晶体初始相位的解析以及优化 | 第19-20页 |
| ·如何搭建生物大分子三维结构模型 | 第20-21页 |
| 第2章 蛋白质晶体衍射数据的收集与处理 | 第21-30页 |
| ·X射线光源的发展 | 第21-24页 |
| ·晶体衍射数据收集方法 | 第24-27页 |
| ·数据处理的常用软件 | 第27页 |
| ·数据收集的注意事项 | 第27-29页 |
| ·系统消光与空间群的判断 | 第29-30页 |
| 第3章 分子置换法与实例分析 | 第30-54页 |
| ·分子置换法的原理 | 第30-32页 |
| ·TALE蛋白和DNA复合物晶体结构的解析 | 第32-37页 |
| ·TALE蛋白的发现以及其对DNA的序列特异性识别 | 第32-34页 |
| ·分子置换法对dHax3/DNA复合物结构的解析 | 第34-35页 |
| ·TALE蛋白和DNA相互作用的机制 | 第35-36页 |
| ·TALE蛋白对甲基化DNA和DNA/RNA杂合双链的识别 | 第36-37页 |
| ·Yca1蛋白晶体结构的解析 | 第37-41页 |
| ·Metacaspase Yca1的生物学意义 | 第37页 |
| ·利用低分辨区对Yca1分子置换结果的分析 | 第37-41页 |
| ·RIP蛋白晶体结构的解析 | 第41-43页 |
| ·RIP蛋白的生物学意义 | 第41页 |
| ·Rossetta在RIP1模型构建中的应用 | 第41-43页 |
| ·Lsm1-7 以及Lsm2-8 蛋白晶体结构的解析 | 第43-49页 |
| ·Lsm1-7 在RNA降解通路以及Lsm2-8 在RNA剪切中的作用 | 第43-44页 |
| ·数据收集的过程 | 第44-45页 |
| ·同源结构的NCS平均对Lsm1-7 晶体的相位优化 | 第45-49页 |
| ·GLUT1蛋白晶体结构的解析 | 第49-54页 |
| ·GLUT1在人体葡萄糖转运过程中的重要意义 | 第49-50页 |
| ·GLUT1的数据收集与模型修正 | 第50-54页 |
| 第4章 单波长反常散射法与实例分析 | 第54-84页 |
| ·单波长反常散射原理简介 | 第54-56页 |
| ·UVR8蛋白晶体结构的解析 | 第56-60页 |
| ·UVR8在植物感受UV-B紫外光中的作用 | 第56-57页 |
| ·UVR8的数据收集与结构解析 | 第57-60页 |
| ·NelC蛋白晶体结构的解析 | 第60-65页 |
| ·NelC的生物学意义 | 第60-61页 |
| ·电子密度的分子置换与NleC蛋白晶体结构的解析 | 第61-65页 |
| ·XylE蛋白晶体结构的解析 | 第65-70页 |
| ·XylE是GLUT1-4 在细菌中的同源蛋白 | 第65-66页 |
| ·XylE的数据收集与结构解析 | 第66-70页 |
| ·PPR蛋白晶体结构的解析 | 第70-74页 |
| ·PPR对RNA的特异性识别 | 第70页 |
| ·PPR单体及其与RNA复合物的数据收集与结构解析 | 第70-74页 |
| ·DpNCT蛋白晶体结构的解析 | 第74-84页 |
| ·DpNCT与 γ-分泌酶 | 第74-75页 |
| ·DpNCT的数据收集与结构解析 | 第75-81页 |
| ·γ-分泌酶结构模型的构建 | 第81-84页 |
| 第5章 多波长反常散射与实例分析 | 第84-98页 |
| ·多波长反常散射的原理 | 第84-85页 |
| ·TAL效应蛋白单体结构的解析 | 第85-91页 |
| ·TALE蛋白的数据收集 | 第85-87页 |
| ·内部螺旋对称性与TALE蛋白的结构解析 | 第87-91页 |
| ·PSH蛋白晶体结构的解析 | 第91-98页 |
| ·PSH是Presenilin在古细菌中的同源蛋白 | 第91-92页 |
| ·交叉晶体平均在PSH晶体相位优化中的应用 | 第92-98页 |
| 第6章 蛋白质三维模型的构建与分析 | 第98-102页 |
| ·蛋白质结构模型搭建 | 第98页 |
| ·如何判断氨基酸的顺序 | 第98-101页 |
| ·模型搭建的评测标准 | 第101-102页 |
| 第7章 讨论与总结 | 第102-107页 |
| ·本文的总结 | 第102页 |
| ·对分子置换法的讨论和总结 | 第102-103页 |
| ·对单波长反常散射法的讨论和总结 | 第103-104页 |
| ·对多波长反常散射法的讨论和总结 | 第104-106页 |
| ·对模型构建的讨论和总结 | 第106页 |
| ·本文的创新之处 | 第106页 |
| ·对X射线晶体学的展望 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-113页 |
| 附录 相关研究蛋白数据收集与结构修正的统计表格 | 第113-128页 |
| 致谢 | 第128-130页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第130-132页 |
