| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-6页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 1 绪论 | 第9-28页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·酪氨酸激酶及其作用机制 | 第10-12页 |
| ·酪氨酸激酶的结构 | 第10-11页 |
| ·活化机制 | 第11页 |
| ·激酶的活性构象与非活性构象 | 第11-12页 |
| ·激酶抑制剂 | 第12-20页 |
| ·Ⅰ类抑制剂 | 第16-17页 |
| ·Ⅱ类抑制剂 | 第17-20页 |
| ·药物设计 | 第20-21页 |
| ·计算机辅助药物设计(CADD) | 第21-23页 |
| ·基于受体结构的药物设计方法(SBDD)的过程 | 第22-23页 |
| ·基于配体结构的药物设计方法(LBDD)的过程 | 第23页 |
| ·新化学实体的发现 | 第23-25页 |
| ·虚拟筛选 | 第23-24页 |
| ·化合物组合库 | 第24页 |
| ·全新药物设计 | 第24-25页 |
| ·骨架跃迁 | 第25页 |
| ·反向分子对接 | 第25页 |
| ·新化学实体的早期评价 | 第25-27页 |
| ·药效团 | 第26页 |
| ·ADME | 第26-27页 |
| ·毒性 | 第27页 |
| ·本课题研究内容及选题意义 | 第27-28页 |
| 2 吲哚衍生物类VEGFR-2酪氨酸激酶第Ⅰ类抑制剂的从头设 | 第28-51页 |
| ·从头设计 | 第28-40页 |
| ·LigBuilder v2.0简介 | 第28页 |
| ·LigBuilder v2.0安装 | 第28-29页 |
| ·LigBuilder v2.0使用说明 | 第29-31页 |
| ·LigBuilder v2.0总览 | 第29-30页 |
| ·CAVITY模块 | 第30页 |
| ·BUILD模块 | 第30页 |
| ·功能列表 | 第30-31页 |
| ·分子设计过程 | 第31-40页 |
| ·分析结合口袋 | 第31-35页 |
| ·产生新分子 | 第35-40页 |
| ·分子类药性筛选 | 第40-45页 |
| ·类药性筛选平台FAF-Drugs2简介 | 第40-41页 |
| ·FAF-Drugs2筛选流程 | 第41-43页 |
| ·格式化 | 第41页 |
| ·筛选 | 第41-43页 |
| ·FAF-Drugs2中的描述符、特性和规则 | 第43-44页 |
| ·FAF-Drugs2中的物化性质筛选细则 | 第44-45页 |
| ·类药性筛选 | 第45页 |
| ·分子对接与虚拟筛选 | 第45-50页 |
| ·分子对接简介 | 第45-46页 |
| ·分子对接过程与结果 | 第46-48页 |
| ·分子动力学模拟 | 第48-49页 |
| ·结合模式分析 | 第49-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 3 吲哚衍生物类VEGFR-2酪氨酸激酶双重抑制剂的从头设计-I | 第51-64页 |
| ·分子设计过程 | 第51-54页 |
| ·分析结合口袋 | 第51-53页 |
| ·产生新分子 | 第53-54页 |
| ·准备种子结构 | 第53-54页 |
| ·编辑参数 | 第54页 |
| ·结果 | 第54页 |
| ·分子类药性筛选 | 第54-56页 |
| ·分子对接 | 第56-63页 |
| ·已上市VEGFR-2酪氨酸激酶抑制剂的分子对接 | 第56-57页 |
| ·通过类药性筛选的小分子与非活性构象的对接 | 第57-59页 |
| ·通过类药性筛选的小分子与活性构象的对接 | 第59-63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 4 吲哚衍生物的合成探索 | 第64-72页 |
| ·目标产物逆向合成分析 | 第64-65页 |
| ·合成路线设计 | 第65-67页 |
| ·所用主要仪器和试剂 | 第67-68页 |
| ·仪器 | 第67页 |
| ·试剂 | 第67-68页 |
| ·吲哚-3-甲酸的合成 | 第68-69页 |
| ·吲哚甲醛氧化法 | 第68-69页 |
| ·吲哚甲醛的合成 | 第68页 |
| ·吲哚甲醛的氧化 | 第68-69页 |
| ·三氟乙酸酐法 | 第69页 |
| ·结果与讨论 | 第69页 |
| ·吲哚-3-甲酰氯的合成 | 第69页 |
| ·2-氨基苯并咪唑的合成 | 第69-71页 |
| ·硫脲法 | 第69-70页 |
| ·氰胺法 | 第70页 |
| ·结果与讨论 | 第70-71页 |
| ·N-(1H-苯并咪唑-2-基)-1H-吲哚-3-甲酰胺的合成 | 第71页 |
| ·本章小结 | 第71-72页 |
| 结论与展望 | 第72-73页 |
| 结论 | 第72页 |
| 展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-76页 |
| 附录 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第78-79页 |
