稻曲病侵染过程以及水稻响应稻曲菌侵染的转录组变化
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-35页 |
| 1. 稻曲病研究概况 | 第12-22页 |
| ·稻曲病的基本特征及危害 | 第12-16页 |
| ·稻曲病的侵染途径研究进展 | 第16-19页 |
| ·稻曲病的分子生物学研究进展 | 第19-22页 |
| 2. 转录组研究进展 | 第22-29页 |
| ·基于生物芯片的转录组研究 | 第23-25页 |
| ·基于测序的转录组研究 | 第25-29页 |
| 3. 植物天然免疫系统概况 | 第29-35页 |
| ·植物天然免疫系统的复杂性 | 第29-32页 |
| ·以PTI为主的免疫系统 | 第32-33页 |
| ·以ETI为主的免疫系统 | 第33-35页 |
| 第二章 稻曲菌侵染水稻过程研究 | 第35-60页 |
| 1. 材料和方法 | 第35-42页 |
| ·材料 | 第35-36页 |
| ·稻曲菌分离及分子鉴定 | 第36-37页 |
| ·稻曲菌接种体制备 | 第37-38页 |
| ·稻曲菌对水稻接种 | 第38页 |
| ·扫描电子显微镜观察 | 第38-39页 |
| ·碳水化合物含量测定 | 第39-40页 |
| ·RNA提取及荧光定量PCR | 第40-42页 |
| 2. 结果与分析 | 第42-53页 |
| ·稻曲菌收集、分离及接种鉴定 | 第42-45页 |
| ·稻曲菌侵染水稻观察 | 第45-53页 |
| 3. 讨论 | 第53-60页 |
| ·气象因子对稻曲病发病的影响 | 第54-55页 |
| ·稻曲病的组织侵染特征 | 第55-56页 |
| ·稻曲菌对水稻小穗的侵染以及侵染时期的选择 | 第56-60页 |
| 第三章 水稻响应稻曲菌侵染的转录组分析 | 第60-105页 |
| 1. 材料和方法 | 第60-65页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·RNA提取、反转录及荧光定量PCR | 第60-61页 |
| ·数字表达谱分析 | 第61页 |
| ·水稻其他生物和非生物胁迫数据整理 | 第61-62页 |
| ·GO enrich分析及基因时空表达模式分析 | 第62页 |
| ·核心调控序列顺式作用元件分析 | 第62-63页 |
| ·基因互作网络预测 | 第63页 |
| ·多种生物学和非生物学胁迫处理 | 第63-65页 |
| 2. 结果与分析 | 第65-102页 |
| ·数字表达谱(DGE)数据分析及整合 | 第65-73页 |
| ·稻曲菌特异调控基因筛选 | 第73-75页 |
| ·稻曲病侵染水稻阶段保守性调控元件分析 | 第75-78页 |
| ·稻曲菌特异调控基因的GO enrich分析 | 第78-90页 |
| ·稻曲菌侵染时上下调蛋白修饰类之间的差异性分析 | 第90-93页 |
| ·稻曲菌特异调控基因的蛋白互作网络的分析 | 第93-96页 |
| ·稻曲菌侵染初期水稻高调控基因分析 | 第96-102页 |
| 3 讨论 | 第102-105页 |
| ·数字表达谱数据的分析 | 第102页 |
| ·水稻应对稻曲菌侵入的调控网络分析 | 第102-105页 |
| 第四章 讨论 | 第105-108页 |
| ·稻曲菌侵染过程的特殊性 | 第105-106页 |
| ·稻曲菌侵染对水稻防御网络的调控 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-123页 |
| 附录Ⅰ 本实验所用引物 | 第123-125页 |
| 附录Ⅱ 博士在读期间发表的论文 | 第125-126页 |
| 致谢 | 第126页 |
