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牛RXRα基因组织表达、多态性及其与生长性状的关联分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第11-22页
   ·中国五个地方黄牛品种介绍第12-14页
     ·南阳牛第12页
     ·秦川牛第12-13页
     ·郏县红牛第13页
     ·鲁西牛第13-14页
   ·分子遗传标记在肉牛育种中的应用第14-17页
     ·RFLP 分析技术第14页
     ·DNA 指纹分析技术第14-15页
     ·RAPD 分析技术第15页
     ·AFLP 分析技术第15页
     ·分子标记在肉牛育种中的应用第15-17页
   ·荧光定量 PCR 技术研究进展及应用第17-19页
     ·荧光定量 PCR 技术的原理第17页
     ·荧光定量 PCR 主要检测方法及其特点第17-19页
     ·荧光定量 PCR 的定量方法第19页
     ·实时荧光定量 PCR 的应用第19页
   ·RXRα基因研究进展第19-22页
     ·小鼠 RXRα基因研究进展第20-21页
     ·大鼠 RXRα基因研究进展第21页
     ·猪 RXRα基因研究进展第21-22页
第二章 材料与方法第22-30页
   ·试验材料第22页
     ·试验动物第22页
     ·生产数据第22页
   ·主要仪器设备与试剂第22-23页
   ·试验方法第23-29页
     ·总 RNA 提取第23页
     ·牛血样全基因组 DNA 提取第23页
     ·RNA 浓度和质量测定第23页
     ·提取的 DNA 质量检测第23页
     ·cDNA 合成第23页
     ·构建 DNA 池第23页
     ·引物设计与合成第23-25页
     ·引物的稀释第25页
     ·PCR 反应条件优化及扩增第25-26页
     ·混合 DNA 池测序-多态位点检测第26页
     ·PCR 扩增产物的酶切分析第26-29页
     ·测序第29页
   ·试验结果的统计分析第29页
   ·生物信息学分析第29-30页
第三章 生物信息学分析第30-34页
   ·牛 RXRα基因编码区基本信息分析第30页
   ·牛 RXRα蛋白的氨基酸基本分析及理化性质第30-32页
     ·牛 RXRα蛋白的氨基酸基本分析第30-31页
     ·牛 RXRα蛋白的疏水区第31-32页
   ·牛 RXRα蛋白的跨膜区和信号肽分析第32页
     ·RXRα蛋白的跨膜区分析第32页
     ·RXRα蛋白的信号肽分析第32页
   ·牛 RXRα蛋白的二级结构第32-33页
   ·牛 RXRα蛋白的高级结构第33-34页
第四章 结果与分析第34-55页
   ·郏县红牛 RXRα基因组织表达谱分析第34页
   ·牛血液基因组 DNA 的检测第34-35页
   ·牛 RXRα基因 SNPs 检测第35-43页
     ·RXRα基因各基因座 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测第35-37页
     ·牛 RXRα基因各基因座黄牛混合 DNA 池测序结果分析第37-39页
     ·牛 RXRα基因的 PCR-RFLP 分析第39-43页
   ·牛 RXRα基因突变位点的遗传学分析第43-47页
     ·牛 RXRα基因 T12856A 位点的群体遗传学分析第43-44页
     ·牛 RXRα基因 G24539A 位点的群体遗传学分析第44页
     ·牛 RXRα基因 T27919A 位点的群体遗传学分析第44-45页
     ·牛 RXRα基因 T28139C 位点的群体遗传学分析第45-46页
     ·牛 RXRα基因 G28142A 位点的群体遗传学分析第46-47页
   ·RXRα基因多态性与黄牛品种主要生长性状关联分析第47-52页
     ·牛 RXRα基因 T12856A 位点多态性与生长性状的关联分析第47-48页
     ·牛 RXRα基因 G24539A 位点多态性与生长性状的关联分析第48-49页
     ·牛 RXRα基因 T27919A 位点多态性与生长性状的关联分析第49-50页
     ·牛 RXRα基因 T28139C 位点多态性与生长性状的关联分析第50-51页
     ·牛 RXRα基因 G28142A 位点多态性与生长性状的关联分析第51-52页
   ·黄牛 RXRα基因多态位点的连锁分析第52页
   ·黄牛 RXRα基因多态位点的单倍型分析第52-53页
   ·RXRα基因不同 SNPs 间的组合与黄牛生长性状的关联分析第53-55页
第五章 讨论第55-59页
   ·组织表达谱的分析第55页
   ·牛 RXRα基因遗传变异位点的分析第55-56页
   ·黄牛 RXRα基因多态位点的群体遗传学分析第56页
   ·黄牛 RXRα基因多态位点的连锁不平衡分析第56页
   ·黄牛 RXRα基因单倍型在不同品种间的分布差异第56-57页
   ·牛 RXRα基因的遗传效应分析第57-59页
第六章 结论与创新点第59-60页
   ·结论第59页
   ·创新点第59-60页
参考文献第60-66页
致谢第66-67页
附录第67-73页

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