巴马小型猪经典SLA-Ⅰ类和Ⅱ类基因克隆及生物信息学分析
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
1. 文献综述 | 第9-25页 |
·微卫星检测综述 | 第9-16页 |
·微卫星的发现和研究简史 | 第9页 |
·微卫星的结构和分布 | 第9-10页 |
·微卫星的类型 | 第10页 |
·微卫星的产生 | 第10-11页 |
·微卫星的功能 | 第11-12页 |
·微卫星标记的原理 | 第12-13页 |
·微卫星标记的优点 | 第13页 |
·微卫星标记的缺点 | 第13页 |
·微卫星标记的应用 | 第13-15页 |
·利用微卫星检测群体遗传结构的成果 | 第15-16页 |
·SLA 基因多态性研究综述 | 第16-25页 |
·MHC 的简介 | 第16-17页 |
·SLA 的发现和研究简史 | 第17页 |
·SLA 复合体在染色体上的位置 | 第17页 |
·SLA 的组成 | 第17-19页 |
·SLA 的分布、表达和功能 | 第19页 |
·SLA 基因的结构 | 第19-20页 |
·SLA 基因的特征 | 第20-21页 |
·SLA 基因分型与检测方法比较 | 第21-22页 |
·SLA 等位基因和单倍型的命名 | 第22-23页 |
·SLA 多态性研究现状 | 第23-25页 |
2. 引言 | 第25-26页 |
3. 实验材料 | 第26-30页 |
·实验动物 | 第26页 |
·实验样本 | 第26-27页 |
·主要试剂 | 第27页 |
·主要仪器 | 第27-28页 |
·微卫星座位 | 第28-29页 |
·引物 | 第29页 |
·分析软件 | 第29-30页 |
4. 实验方法 | 第30-36页 |
·微卫星检测巴马小型猪群体遗传结构 | 第30-32页 |
·基因组 DNA 的提取 | 第30页 |
·DNA 样品的浓度和纯度检测 | 第30页 |
·微卫星标记 PCR 扩增 | 第30-31页 |
·PCR 产物检测 | 第31页 |
·PCR 产物测序分析 | 第31页 |
·微卫星统计分析 | 第31-32页 |
·巴马小型猪 SLA 基因多态性研究 | 第32-36页 |
·RNA 提取 | 第32页 |
·RNA 样品的浓度和纯度检测 | 第32页 |
·RT-PCR | 第32-34页 |
·PCR 产物回收 | 第34页 |
·目的基因的克隆 | 第34-35页 |
·阳性克隆鉴定 | 第35页 |
·双向测序 | 第35页 |
·序列矫正比对 | 第35-36页 |
·新等位基因的发现、命名和提交 | 第36页 |
·等位基因序列分析 | 第36页 |
5.结果与分析 | 第36-61页 |
·利用微卫星检测群体遗传结构结果分析 | 第36-42页 |
·巴马小型猪 DNA 提取检测结果 | 第36-37页 |
·PCR 扩增检测结果 | 第37页 |
·PCR 产物测序检测峰图结果 | 第37-38页 |
·数据分析 | 第38-42页 |
·巴马小型猪 SLA 基因多态性研究结果分析 | 第42-61页 |
·巴马小型猪 RNA 提取检测结果 | 第42页 |
·cDNA 内参检测结果 | 第42页 |
·7 个 SLA 基因座位 PCR 扩增结果 | 第42-43页 |
·PCR 产物回收检测结果 | 第43页 |
·阳性克隆鉴定结果 | 第43-44页 |
·双向测序结果 | 第44页 |
·序列矫正比对结果 | 第44-45页 |
·等位基因的发现、命名和提交 | 第45-49页 |
·等位基因序列分析结果 | 第49-61页 |
6. 讨论 | 第61-65页 |
·微卫星座位的选择 | 第61页 |
·微卫星测序峰图的判读 | 第61页 |
·微卫星检测数据分析结果 | 第61-62页 |
·SLA 基因 PCR 扩增和克隆测序结果 | 第62-63页 |
·SLA 的多态性 | 第63页 |
·SLA 基因等位基因群体分布特征 | 第63-64页 |
·SLA 等位基因同源性分析 | 第64-65页 |
7. 结论 | 第65-67页 |
·微卫星检测 | 第65页 |
·SLA 基因多态性研究及生物信息学的分析 | 第65-67页 |
参考文献 | 第67-73页 |
附录 | 第73-104页 |
致谢 | 第104-105页 |
个人简介 | 第105页 |
在读期间发表论文及成果 | 第105页 |