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未知病毒快速检测方法的建立及应用

摘要第1-8页
前言第8-9页
第一章 快速检测鉴定未知病毒方法的建立第9-25页
   ·样品的处理与富集第9-10页
   ·非特异性扩增第10-11页
     ·多重置换扩增第10页
     ·变性寡核苷酸引物PCR第10页
     ·引物延伸预扩增PCR第10页
     ·Omniplex全基因组扩增第10-11页
   ·序列非依赖检测方法第11-12页
     ·代表性差异分析(RDA)和抑制消减杂交技术(SSH)第11页
     ·序列非依赖的单引物扩增(SISPA)第11页
     ·随机PCR第11页
     ·表达cDNA文库第11-12页
     ·高通量测序第12页
   ·材料第12-15页
     ·样品来源第12页
     ·质粒与菌种第12页
     ·主要试剂第12-13页
       ·试剂盒第12页
       ·PCR扩增所用Taq酶第12-13页
       ·DNA Maker第13页
       ·抗生素第13页
       ·细菌培养基主要成分第13页
       ·生化试剂第13页
     ·试验用具第13页
     ·仪器设备第13页
     ·试剂配制第13-15页
       ·琼脂糖电泳和凝胶加样缓冲液第14页
       ·其它常用试剂和缓冲液第14页
       ·细菌培养基第14-15页
   ·方法第15-20页
     ·Virus-Discovery-cDNA-RAPD(VIDISCR)引物的设计第15-16页
     ·标本的前处理第16页
     ·未知病毒DNA(或RNA)抽提第16-17页
     ·RT-PCR第17-18页
     ·凝胶电泳的结果观察第18页
     ·PCR产物纯化第18-19页
     ·连接pMD18-T载体第19页
     ·转化第19页
     ·阳性菌落的筛选与克隆第19页
     ·菌液鉴定第19-20页
     ·测序鉴定序列比对及系统发育分析第20页
   ·结果第20-23页
     ·采用VIDISCR方法对猴空泡病毒(SV40)和猴副流感病毒(SV5)检出结果第20-23页
     ·其他插入序列的比对结果第23页
     ·Virus-Discovery-cDNA-RAPD(VIDISCR)反应系统的建立第23页
   ·讨论第23-25页
第二章 采用VIDISCR方法对云南边境白纹伊蚊蚊体样品的检测第25-33页
   ·盖塔病毒分离概况第25-26页
   ·盖塔病毒的生物学特性第26-27页
     ·盖塔蛋白非结构区第26-27页
     ·盖塔病毒结构区第27页
   ·盖塔病毒nsP3特征第27页
   ·主要媒介生物第27页
   ·材料和方法第27-28页
     ·材料第27-28页
       ·白蚊伊蚊匀浆第27-28页
       ·传代接种部位及剂量第28页
     ·方法第28页
   ·结果第28-31页
     ·随机引物对白蚊伊蚊RT-PCR扩增出的结果第28-29页
     ·盖塔病毒NS3基因序列第29-30页
     ·盖塔病毒NS3基因同源性及系统发育树分析结果第30-31页
   ·讨论第31-33页
第三章 采用VIDISCR方法对云南边境蝙蝠样品的检测第33-43页
   ·呼肠孤病毒的生物学特性第34页
   ·呼肠孤病毒的宿主第34页
   ·呼肠孤病毒的病原性第34页
   ·材料和方法第34-35页
     ·材料第34-35页
       ·蝙蝠样品处理第35页
     ·方法第35页
   ·结果第35-42页
     ·VIDISCR对蝙蝠样品CY3-4的检测结果第35-36页
     ·蝙蝠样品CY3-4基因序列、同源性及系统树分析第36-39页
     ·VIDISCR对蝙蝠样品CY72-74检测的结果第39-42页
       ·随机引物对蝙蝠样品CY72-74RT-PCR扩增的结果第39-40页
       ·呼肠孤病毒M2部分基因序列第40-41页
       ·呼肠孤病毒M2部分基因同源性及系统发育树分析结果第41-42页
   ·讨论第42-43页
全文结论第43-44页
参考文献第44-48页
Abstract第48-50页
致谢第50页

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