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基于目标区域捕获芯片及Solexa测序技术的血管紧张素原AGT基因变异与肺血栓栓塞症(PTE)相关性研究

英文缩略词第1-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-12页
前言第12-17页
 参考文献第15-17页
1. 材料与工具第17-19页
   ·仪器第17页
   ·试剂与耗材第17-18页
   ·试剂配制第18页
   ·数据库及软件第18-19页
2. 技术路线与方法第19-29页
   ·对象选取与分组第19-20页
     ·PTE病例组第19-20页
     ·正常对照组第20页
   ·样本采集与质检第20-22页
     ·全血基因组DNA提取第20页
     ·基因组DNA质量检测第20-22页
   ·目标区域捕获第22-24页
     ·DNA文库制备第22-23页
     ·候选基因检索与目标探针设计第23-24页
     ·捕获芯片杂交与洗脱第24页
     ·捕获后文库的扩增与质检第24页
   ·Solexa高通量测序第24-25页
     ·簇生成第24页
     ·测序第24-25页
   ·序列比对、数据统计及变异分析第25-27页
     ·序列比对第25页
     ·数据统计第25-27页
     ·变异分析第27页
   ·AGT位点验证与统计分析第27-29页
     ·PCR-Sanger测序验证第27-28页
     ·生物信息学及统计学分析第28-29页
3. 结果第29-54页
   ·基因组DNA质量检测第29-35页
   ·序列捕获探针设计与定制第35-38页
   ·Solexa测序数据统计第38-40页
   ·变异分析第40-43页
   ·血缘同源性分析第43页
   ·AGT基因SNP变异位点汇总第43-49页
   ·AGT基因rs1926723、rs699和rs4762变异位点验证与分析第49-54页
     ·生物信息学注释第49-50页
     ·PCR-Sanger测序验证第50-52页
     ·基因分型及等位基因分布频率计算与比较第52-53页
     ·连锁不平衡分析与单倍型分析第53-54页
4. 讨论第54-55页
参考文献第55-56页
文献综述第56-76页
 参考文献第72-76页
致谢第76-77页
个人简历第77-78页

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