| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 符号说明 | 第14-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-48页 |
| ·表观遗传修饰 | 第18-21页 |
| ·DNA甲基化修饰的过程及检测方法 | 第18-19页 |
| ·胞嘧啶的甲基化修饰和异染色质及转录抑制有关 | 第19页 |
| ·胞嘧啶在基因组中分布不均并且分量较低 | 第19-20页 |
| ·与染色体的复制有关 | 第20页 |
| ·DNA甲基化的去除可以通过剪切m-5C残基来完成 | 第20页 |
| ·对环境因子的长期适应性 | 第20-21页 |
| ·DNA骨架的磷硫酰化修饰 | 第21-38页 |
| ·硫修饰DNA电泳过程中的降解现象(Dnd现象) | 第22-28页 |
| ·硫修饰DNA的遗传学和分子生物学 | 第28-30页 |
| ·硫修饰DNA的结构确定 | 第30-33页 |
| ·硫修饰在自然界中广泛的分布 | 第33-37页 |
| ·NA磷硫酰化修饰的生物学意义 | 第37-38页 |
| ·细菌对光氧化压力的响应 | 第38-41页 |
| ·I型ROS | 第39-40页 |
| ·II型ROS | 第40-41页 |
| ·DNA的氧化损伤 | 第41-46页 |
| ·本研究内容和目的 | 第46-48页 |
| ·本研究基础 | 第46页 |
| ·本研究内容和目的 | 第46-48页 |
| 第二章 材料与方法 | 第48-60页 |
| ·实验材料 | 第48-52页 |
| ·菌株(表 2-1) | 第48页 |
| ·质粒(表 2-2) | 第48-49页 |
| ·培养基和化学试剂 | 第49-51页 |
| ·底物和标准品的化学合成 | 第51-52页 |
| ·实验方法 | 第52-60页 |
| 第三章 磷硫酰化二核苷体外氧化切割方法的建立 | 第60-71页 |
| ·前沿 | 第60-61页 |
| ·结果与分析 | 第61-68页 |
| ·磷硫酰化二乙酯和PAA-TAE的反应 | 第61-62页 |
| ·磷硫酰化二核苷dGSA和PAA-TAE的反应 | 第62-63页 |
| ·R和S构象的磷硫酰化二核苷与PAA-TAE激活液的反应 | 第63-64页 |
| ·不同种类的磷硫酰化二核苷的模拟实验 | 第64-66页 |
| ·PAA与其他缓冲液的复配作用 | 第66-68页 |
| ·本章小结 | 第68-71页 |
| 第四章 磷硫酰化DNA电泳过程中降解的机制 | 第71-108页 |
| ·前言 | 第71-72页 |
| ·结果与分析 | 第72-106页 |
| ·纯水中dG~SA和PAA的氧化切割反应 | 第72-74页 |
| ·PAA和Tris溶液的复配对dG~SA切割作用 | 第74-75页 |
| ·PAA和乙酸溶液的复配对dG~SA氧化切割作用 | 第75-76页 |
| ·dG~SA可以通过两步反应进行裂解 | 第76-79页 |
| ·dG~SA被PAA处理后化合物 2 的结构预测 | 第79-85页 |
| ·dG~SA经PAA处理后各个组分的结构预测 | 第85-87页 |
| ·PAA处理dG~SA后产物的结构确证 | 第87-94页 |
| ·磷硫酰化酯键中硫的去向 | 第94-100页 |
| ·氢膦酸二核苷在pH7.0 条件下可以被氧化成正常的二核苷 | 第100-103页 |
| ·磷硫酰化DNA降解过程解析 | 第103-106页 |
| ·本章小结 | 第106-108页 |
| 第五章 过氧化氢对磷硫酰化DNA的氧化作用 | 第108-117页 |
| ·前言 | 第108-109页 |
| ·结果与分析 | 第109-115页 |
| ·过氧化氢可以将pH8.0 Tris-HCl缓冲液中的dG~SA氧化到正常二核苷dG~OA | 第109-111页 |
| ·水溶液中的dG~SA和过氧化氢反应 | 第111-112页 |
| ·dG~SA在不同的溶液中被过氧化氢氧化 | 第112-113页 |
| ·dG~SA在不同pH的溶液中被过氧化氢氧化 | 第113-115页 |
| ·本章小结 | 第115-117页 |
| 第六章 细菌中的磷硫酰化DNA作为抗氧化剂保护DNA | 第117-141页 |
| ·前言 | 第117-118页 |
| ·结果与分析 | 第118-137页 |
| ·低浓度过氧化氢可以dG~SA生成正常二核苷dG~OA | 第118-121页 |
| ·过氧化氢可以被磷硫酰化二核苷消耗 | 第121-123页 |
| ·不同浓度PAA可以将dG~SA氧化到不同的氧化切割模式 | 第123-125页 |
| ·10 μM过氧乙酸可以氧化dG~SA到正常二核苷dG~OA | 第125-127页 |
| ·磷硫酰化DNA菌株能够抵抗一定量的过氧化氢 | 第127-131页 |
| ·过氧化氢处理后的沙门氏菌基因组DNA变化 | 第131-133页 |
| ·磷硫酰化DNA在沙门氏菌体内被过氧化氢脱硫 | 第133-135页 |
| ·磷硫酰化DNA赋予大肠杆菌抵抗过氧化氢能力 | 第135-137页 |
| ·本章小结 | 第137-141页 |
| 第七章 沙门氏菌Dnd B蛋白功能初探 | 第141-166页 |
| ·前言 | 第141-142页 |
| ·结果与分析 | 第142-165页 |
| ·沙门氏菌Dnd B蛋白的一些生物信息学分析 | 第142-143页 |
| ·沙门氏菌Dnd B蛋白在大肠杆菌异源宿主中的表达及纯化 | 第143-147页 |
| ·异源表达的沙门氏菌Dnd B蛋白确证 | 第147-148页 |
| ·Dnd B蛋白的PCS纳米粒度分析 | 第148-149页 |
| ·Dnd B蛋白具有结合cccDNA的活性 | 第149-153页 |
| ·Dnd B蛋白能够结合PCR产物 | 第153-155页 |
| ·Dnd B蛋白能够结合RNA分子 | 第155-157页 |
| ·通过CD光谱检测能够引起Dnd B响应的辅因子 | 第157-159页 |
| ·辅因子加入后Dnd B蛋白对cccDNA的作用 | 第159-165页 |
| ·本章小结 | 第165-166页 |
| 第八章 本研究工作总结和展望 | 第166-173页 |
| ·本研究工作总结 | 第166-169页 |
| ·主要创新点 | 第169页 |
| ·本研究工作展望 | 第169-173页 |
| 参考文献 | 第173-184页 |
| 致谢 | 第184-188页 |
| 攻读学位期间发表学术论文 | 第188-189页 |
| 博士学位论文答辩决议书 | 第189-191页 |
