| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-20页 |
| 1 景观遗传学概述 | 第10-15页 |
| ·定义 | 第10-11页 |
| ·与相近学科的比较 | 第11页 |
| ·景观遗传学的研究内容 | 第11-12页 |
| ·景观遗传学的研究方法 | 第12-14页 |
| ·景观遗传学的研究进展 | 第14-15页 |
| 2 湖北钉螺研究进展 | 第15-18页 |
| ·我国湖北钉螺分布类型 | 第15-16页 |
| ·湖北钉螺全线粒体基因组研究概况 | 第16-17页 |
| ·湖北钉螺群体遗传变异研究 | 第17-18页 |
| 3 本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 湖北钉螺基因组五种抽提方法比较研究 | 第20-30页 |
| ·材料与方法 | 第20-24页 |
| ·实验材料及来源 | 第20页 |
| ·主要仪器、试剂及耗材 | 第20-21页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第21-23页 |
| ·基因组DNA电泳检测 | 第23页 |
| ·用分光光度计测样品的OD值和浓度 | 第23页 |
| ·PCR扩增COⅡ基因并凝胶电泳检测 | 第23-24页 |
| ·PCR产物拷贝数的测定 | 第24页 |
| ·结果 | 第24-26页 |
| ·各种抽提方法所需要的时间及其成本 | 第24页 |
| ·钉螺基因组DNA的琼脂糖电泳检测 | 第24-25页 |
| ·PCR产物检测结果 | 第25-26页 |
| ·不同方法各样本的PCR拷贝数浓度相对值 | 第26页 |
| ·分析与讨论 | 第26-30页 |
| 第三章 基于线粒体基因组全序列的湖北钉螺起源分化研究及线粒体DNA分子标记的筛选 | 第30-52页 |
| ·材料与方法 | 第31-35页 |
| ·材料 | 第31-32页 |
| ·主要仪器、试剂及耗材 | 第32页 |
| ·方法 | 第32页 |
| ·mtDNA扩增及测序 | 第32-34页 |
| ·序列拼接和组装 | 第34页 |
| ·生物信息学分析 | 第34-35页 |
| ·分类准确率的计算 | 第35页 |
| ·拓扑距离的计算 | 第35页 |
| ·结果 | 第35-47页 |
| ·线粒体DNA的长片段扩增 | 第35-36页 |
| ·基于线粒体基因组全序列的系统发育分析 | 第36-40页 |
| ·线粒体DNA分子标记系统发育效率分析 | 第40-47页 |
| ·分析与讨论 | 第47-52页 |
| 第四章 基于MTDNA分子标记的湖北钉螺群体遗传学研究中取样策略分析 | 第52-62页 |
| ·材料与方法 | 第52-54页 |
| ·实验材料 | 第52-53页 |
| ·主要仪器、试剂及耗材 | 第53页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第53-54页 |
| ·PCR扩增及测序 | 第54页 |
| ·序列分析 | 第54页 |
| ·结果 | 第54-59页 |
| ·PCR扩增和测序结果 | 第54-55页 |
| ·ND3基因序列分析 | 第55-56页 |
| ·基因序列多态性与样本量关系 | 第56-58页 |
| ·基因多态性与地理分布的关系 | 第58-59页 |
| ·分析与讨论 | 第59-62页 |
| 第五章 应用MTDNA-ND3、MTDNA-COⅡ基因序列研究湖北钉螺不同景观群体遗传结构 | 第62-88页 |
| ·材料与方法 | 第62-65页 |
| ·实验材料及来源 | 第62-63页 |
| ·主要仪器、试剂及耗材 | 第63页 |
| ·湖北钉螺基因组DNA的提取 | 第63-64页 |
| ·mtDNA-ND3和COⅡ基因扩增 | 第64页 |
| ·扩增产物检查 | 第64页 |
| ·序列纯化及测定 | 第64-65页 |
| ·数据分析 | 第65页 |
| ·结果 | 第65-85页 |
| ·ND3和COⅡ基因的PCR扩增和测序结果 | 第65-67页 |
| ·各群体中获得2个基因的个体数目 | 第67-68页 |
| ·ND3基因和COⅡ基因序列各景观群体单倍型的分布 | 第68-73页 |
| ·基因的群体遗传分析 | 第73-81页 |
| ·双参数距离分析 | 第81-82页 |
| ·系统发育树 | 第82-84页 |
| ·单倍型网络图 | 第84-85页 |
| ·分析与讨论 | 第85-88页 |
| 第六章 小结 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-98页 |
| 附录:主要仪器和试剂 | 第98-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第102页 |
