| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-33页 |
| 1 鸡基因组研究中的分子遗传标记 | 第13-19页 |
| ·RFLP 技术 | 第13-14页 |
| ·微卫星标记技术 | 第14-16页 |
| ·微卫星的特点和类型 | 第14页 |
| ·微卫星位点的保守性 | 第14-15页 |
| ·微卫星标记在家禽上的研究进展 | 第15-16页 |
| ·RAPD 技术和 DNA 指纹 | 第16页 |
| ·SNP | 第16-19页 |
| ·单核苷酸多态性的概念及性质 | 第17页 |
| ·单核苷酸多态性的检测方法 | 第17-19页 |
| 2 E-FABP 研究进展 | 第19-23页 |
| ·FABP 概述 | 第19-21页 |
| ·E-FABP 的结构 | 第21页 |
| ·E-FABP 基因结构和表达调控 | 第21-22页 |
| ·E-FABP 的功能 | 第22页 |
| ·E-FABP 基因与动物的生长和脂肪代谢的关系 | 第22-23页 |
| 3 Ghrelin 研究进展 | 第23-28页 |
| ·Ghrelin 的结构及分布 | 第23-24页 |
| ·Ghrelin 的受体特点及其分布 | 第24-25页 |
| ·Ghrelin 的作用机制 | 第25页 |
| ·Ghrelin 的生理功能 | 第25-28页 |
| ·促进GH 的分泌，调节生长 | 第25-26页 |
| ·增强食欲，调节能量代谢 | 第26页 |
| ·对胃肠功能与胃肠道发育的影响 | 第26-27页 |
| ·对心血管功能和活动能力的影响 | 第27页 |
| ·增强机体免疫力与抗应激能力 | 第27页 |
| ·其他生物学功能 | 第27-28页 |
| 4 基因表达差异的研究方法 | 第28-32页 |
| ·差异显示PCR技术概述 | 第28-29页 |
| ·差异显示 PCR 技术原理 | 第29页 |
| ·差异显示技术的引物设计 | 第29-30页 |
| ·差异显示技术的应用 | 第30-32页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第32-33页 |
| 第二章 京海黄鸡早期生长及差异显示基因的研究 | 第33-71页 |
| 1 前言 | 第33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-44页 |
| ·试验材料来源及饲养管理方法 | 第33-34页 |
| ·数据及样品采集 | 第34-35页 |
| ·一般测定项目 | 第34-35页 |
| ·DDRT-PCR试验鸡选择与组织样采集 | 第35页 |
| ·三种生长曲线模型拟合及其特征数 | 第35-36页 |
| ·典型相关分析(Canonical correlation analysis) | 第36页 |
| ·主成分分析（Principal component analysis） | 第36-37页 |
| ·主成分分析计算步骤 | 第36页 |
| ·主成分的负荷量 | 第36-37页 |
| ·统计分析方法 | 第37页 |
| ·DDRT-PCR 所需仪器设备、溶液及试剂配制和试验方法与步骤 | 第37-44页 |
| ·主要仪器设备 | 第37页 |
| ·溶液及试剂配制 | 第37-40页 |
| ·DDRT-PCR试验方法与步骤 | 第40-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-64页 |
| ·京海黄鸡早期生长描述性统计 | 第44-47页 |
| ·京海黄鸡体重随周龄变化的三种生长曲线拟合 | 第47-53页 |
| ·京海黄鸡体重三种不同生长模型参数估计 | 第47-49页 |
| ·曲线方程估计值与实测值的比较 | 第49-52页 |
| ·三种模型估计值与实测值卡方检验 | 第52-53页 |
| ·典型相关分析结果 | 第53-56页 |
| ·各变量均值、标准差及各变量间相关系数 | 第53-55页 |
| ·各性状间典型相关系数与分析 | 第55页 |
| ·各性状间典型变量的构成及分析 | 第55-56页 |
| ·主成分分析结果 | 第56-60页 |
| ·各主成分特征根、贡献率及特征向量 | 第56页 |
| ·各性状在入选主成分中的负荷量 | 第56-58页 |
| ·性状主成分座标图与聚类分析的比较 | 第58-60页 |
| ·DDRT-PCR结果与分析 | 第60-64页 |
| ·样品总RNA提取 | 第60页 |
| ·mRNA 差异显示结果 | 第60页 |
| ·差异表达片段的克隆与测序 | 第60-62页 |
| ·差异表达片段的序列分析 | 第62页 |
| ·DDRT-PCR结果 | 第62-64页 |
| 4 讨论 | 第64-70页 |
| ·京海黄鸡早期生长速度与变异程度 | 第64页 |
| ·京海黄鸡早期生长曲线拟合 | 第64-65页 |
| ·最适模型问题 | 第64页 |
| ·京海黄鸡生长规律及生长率特点 | 第64-65页 |
| ·京海黄鸡典型性状相关分析 | 第65-67页 |
| ·典型相关本质及应用 | 第65-66页 |
| ·典型相关分析3组性状之间的关系 | 第66-67页 |
| ·京海黄鸡主成分分析 | 第67-68页 |
| ·主成分分析可提供一些综合性状 | 第67-68页 |
| ·主成分选择 | 第68页 |
| ·关于DDRT-PCR结果 | 第68-70页 |
| 5 本章结论 | 第70-71页 |
| 第三章 E-FABP 和 Ghrelin 基因多态性与生长及屠宰性状的关联分析 | 第71-126页 |
| 1 前言 | 第71页 |
| 2 材料与方法 | 第71-77页 |
| ·试验动物 | 第71页 |
| ·主要仪器和药品 | 第71-72页 |
| ·主要试剂及配制 | 第72页 |
| ·试验方法 | 第72-73页 |
| ·鸡血液基因组DNA的提取方法 | 第72-73页 |
| ·DNA 浓度和纯度的检测 | 第73页 |
| ·引物设计、合成与稀释 | 第73-74页 |
| ·引物设计 | 第73-74页 |
| ·引物的合成与稀释 | 第74页 |
| ·最佳 PCR 条件的建立 | 第74-76页 |
| ·最佳PCR扩增体系 | 第74页 |
| ·E-FABP基因和Ghrelin基因引物的最佳PCR扩增条件 | 第74-76页 |
| ·PCR-SSCP 及 PCR-RFLP 分析方法 | 第76-77页 |
| ·PCR-SSCP检测 | 第76页 |
| ·PCR-RFLP检测 | 第76-77页 |
| ·DNA片段的琼脂糖检测、回收及测序 | 第77页 |
| 3 统计分析方法 | 第77-78页 |
| ·遗传学统计分析 | 第77-78页 |
| ·群体基因频率和基因型频率的计算 | 第77-78页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡态检验 | 第78页 |
| ·E-FABP 和 Ghrelin 基因多态性与京海黄鸡生长及屠宰性状关系的研究 | 第78页 |
| 4 分析工具及软件 | 第78页 |
| 5 结果与分析 | 第78-88页 |
| ·基因组 DNA 提取结果 | 第78-79页 |
| ·PCR 扩增产物检测 | 第79-82页 |
| ·E-FABP基因PCR产物检测 | 第79-81页 |
| ·Ghrelin基因PCR产物检测 | 第81-82页 |
| ·测序结果与同源性分析 | 第82-86页 |
| ·E-FABP基因测序结果及同源性比较 | 第82-85页 |
| ·Ghrelin基因测序结果及同源性分析 | 第85-86页 |
| ·E-FABP 和 Ghrelin 基因的遗传学分析 | 第86-88页 |
| ·E-FABP 基因的基因频率和基因型频率及 Hardy-Weinberg 平衡检验 | 第86-87页 |
| ·Ghrelin 基因的基因频率和基因型频率及 Hardy-Weinberg 平衡检验 | 第87-88页 |
| 6 E-FABP 和 Ghrelin 基因多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第88-119页 |
| ·E-FABP 基因多态性位点与生产性能的关系 | 第88-106页 |
| ·引物P1（P99）多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第89-96页 |
| ·引物P95（P98）多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第96-101页 |
| ·引物P74多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第101-106页 |
| ·Ghrelin 基因多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第106-119页 |
| ·引物P1多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第108-114页 |
| ·引物P3多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第114-117页 |
| ·引物P5多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第117-119页 |
| 7 讨论 | 第119-124页 |
| ·试验方法 | 第119-120页 |
| ·E-FABP 和 Ghrelin 基因多态性与群体遗传学分析 | 第120-122页 |
| ·E-FABP 和 Ghrelin 基因多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第122-124页 |
| ·E-FABP基因多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第122-123页 |
| ·Ghrelin基因多态性与生长及屠宰性状的关系 | 第123-124页 |
| 8 本章结论 | 第124-126页 |
| 第四章 京海黄鸡微卫星标记与生长及屠宰性状的关联分析 | 第126-156页 |
| 1 前言 | 第126页 |
| 2 材料与方法 | 第126-129页 |
| ·试验材料 | 第126页 |
| ·微卫星位点信息 | 第126页 |
| ·微卫星多态检测方法 | 第126-128页 |
| ·主要仪器 | 第126页 |
| ·主要试剂及其配制 | 第126-127页 |
| ·京海黄鸡基因组DNA的提取与检测 | 第127页 |
| ·PCR反应体系 | 第127页 |
| ·PCR反应条件 | 第127-128页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 | 第128页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测 | 第128页 |
| ·数据统计分析 | 第128-129页 |
| ·基因频率计算 | 第128页 |
| ·基因杂合度（Heterozygosity，H）和有效等位基因数 | 第128页 |
| ·多态信息含量（Polymorphic Information Content，PIC） | 第128-129页 |
| ·线性模型 | 第129页 |
| ·统计方法 | 第129页 |
| 3 结果与分析 | 第129-153页 |
| ·DNA 提取和 PCR 扩增产物检测 | 第129-130页 |
| ·微卫星位点检测 | 第130页 |
| ·京海黄鸡微卫星位点多态性 | 第130-131页 |
| ·京海黄鸡不同微卫星位点与体重、体尺及屠宰性状的最小二乘分析 | 第131-141页 |
| ·京海黄鸡微卫星位点与体重性状的最小二乘分析 | 第131-136页 |
| ·京海黄鸡微卫星位点与体尺性状的最小二乘分析 | 第136-138页 |
| ·京海黄鸡微卫星位点与屠宰性状的最小二乘分析 | 第138-141页 |
| ·同一微卫星位点不同基因型个体体重、体尺及屠宰性状的比较 | 第141-153页 |
| ·不同基因型个体体重性状的比较 | 第141-149页 |
| ·不同基因型个体体尺性状的比较 | 第149-151页 |
| ·不同基因型个体屠宰性状的比较 | 第151-153页 |
| 4 讨论 | 第153-155页 |
| ·各微卫星位点的群体遗传特性分析 | 第153页 |
| ·微卫星位点不同基因型与体重、体尺及屠宰性状的关联分析 | 第153-154页 |
| ·方差分析方法 | 第154-155页 |
| 5 本章结论 | 第155-156页 |
| 全文结论 | 第156-157页 |
| 参考文献 | 第157-180页 |
| 致谢 | 第180-182页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第182页 |
