中文摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-8页 |
第一章 基因与基因组进化研究中的生物信息学 | 第8-13页 |
·生物信息学概述 | 第8页 |
·比较基因组学与进化基因组学 | 第8-10页 |
·比较基因组学与生物进化 | 第9页 |
·进化基因组学与生物进化 | 第9-10页 |
·基因家族进化研究中的若干概念简述 | 第10-13页 |
·基因家族与蛋白质家族 | 第10-11页 |
·系统发生分析与系统发生树 | 第11页 |
·基因或蛋白家族分析方法和步骤 | 第11-12页 |
·基因家族进化研究中存在的问题 | 第12-13页 |
第二章 冷休克结构域蛋白家族研究进展 | 第13-22页 |
·原核生物冷休克蛋白对低温环境的应答 | 第13-14页 |
·真核生物冷休克结构域蛋白的研究 | 第14-20页 |
·无脊椎动物Y-box蛋白的研究 | 第15-16页 |
·脊椎动物Y-box蛋白的研究 | 第16-17页 |
·人类YB-1蛋白对肿瘤发生的影响 | 第17-20页 |
·植物冷休克蛋白对低温环境的应答 | 第20-22页 |
第三章 日本七鳃鳗口腔腺Y-box基因Lyb的克隆 | 第22-30页 |
·材料和方法 | 第22-24页 |
·材料 | 第22页 |
·方法 | 第22-24页 |
·结果 | 第24-28页 |
·日本七鳃鳗总RNA的提取和Y-box基因CSD区域的克隆 | 第24页 |
·3'、5'RACE克隆产物 | 第24-25页 |
·日本七鳃鳗Y-box结合蛋白基因的全长序列 | 第25-26页 |
·蛋白质的功能位点分析 | 第26页 |
·蛋白质序列多重比对和进化树的构建 | 第26-28页 |
·讨论 | 第28-30页 |
第四章 冷休克结构域蛋白超家族的分子进化及其起源机制的探讨 | 第30-43页 |
·数据的获得 | 第30页 |
·分析方法 | 第30-31页 |
·结果 | 第31-42页 |
·Y-box基因家族成员的聚类 | 第31-36页 |
·保守基序motif的分析 | 第36页 |
·Y-box基因3'和5'非翻译区(untranslated region)序列分析 | 第36-38页 |
·Y-box基因家族的内含子系统发育分析 | 第38-42页 |
·Y-box基因家族的进化模型 | 第42-43页 |
第五章 全文小结 | 第43-46页 |
参考文献 | 第46-53页 |
附录 | 第53-66页 |
附录 1:文章中所选物种一览表 | 第53-56页 |
附录 2:基因结构示意图 | 第56-59页 |
附录 3:氨基酸保守序列motif的MEME分析结果示意图 | 第59-64页 |
附录 4:具有CPE功能元件物种的3'UTR序列做的同源比对 | 第64-65页 |
附录 5:具有IRES功能元件物种的3'UTR序列做的同源比对 | 第65-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
研究成果及学术论文 | 第67页 |
个人简历 | 第67-68页 |