| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-15页 |
| 第一部分 前言 | 第15-45页 |
| 1 网翅蝗科研究现状 | 第15-18页 |
| ·网翅蝗科昆虫分类地位 | 第15-16页 |
| ·中国网翅蝗科昆虫分类简介 | 第16页 |
| ·网翅蝗科系统学研究现状 | 第16-18页 |
| 2 动物分子系统学的研究方法和进展 | 第18-30页 |
| ·分子系统学概述 | 第18-19页 |
| ·线粒体基因及其在动物分子系统学中的应用 | 第19-27页 |
| ·动物线粒体基因组成及分子进化 | 第19-22页 |
| ·线粒体基因在动物分子系统学中的应用 | 第22-27页 |
| ·线粒体基因在分子系统学中的应用概述 | 第22页 |
| ·Cytb、COII和16SrRNA的分子进化特征及其应用进展 | 第22-27页 |
| ·核基因及28SrDNA在动物分子系统学中的应用进展 | 第27-30页 |
| ·核基因应用简介 | 第27-28页 |
| ·28SrDNA在动物分子系统学中的应用 | 第28-30页 |
| 3 分子系统发育分析的程序和方法 | 第30-44页 |
| ·取样 | 第30-31页 |
| ·序列比对 | 第31-33页 |
| ·数据探索方法 | 第33-37页 |
| ·系统树构建方法 | 第37-40页 |
| ·关于多源数据集的分析 | 第40-44页 |
| ·多源数据集的概念 | 第40页 |
| ·三种学派的比较 | 第40-42页 |
| ·多源数据集分析方法 | 第42-44页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第44-45页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第45-55页 |
| 1 实验材料 | 第45-46页 |
| ·材料来源 | 第45页 |
| ·仪器和试剂 | 第45-46页 |
| ·实验仪器 | 第45-46页 |
| ·实验试剂 | 第46页 |
| 2 实验方法 | 第46-50页 |
| ·总 DNA的提取 | 第46-49页 |
| ·提取过程所用的试剂 | 第48页 |
| ·提取步骤 | 第48页 |
| ·总 DNA检测 | 第48-49页 |
| ·PCR扩增 | 第49-50页 |
| ·基因和引物的选择 | 第49页 |
| ·PCR扩增体系和扩增条件 | 第49-50页 |
| ·PCR产物纯化及测序 | 第50页 |
| 3. 实验数据的处理和分析 | 第50-55页 |
| ·序列编辑及序列比对 | 第51-52页 |
| ·序列组成分析 | 第52页 |
| ·数据组系统发育信号检测 | 第52-53页 |
| ·碱基替换饱和性分析 | 第52页 |
| ·树长分布分析 | 第52-53页 |
| ·PTP检验 | 第53页 |
| ·不相合长度差异检验(ILD test) | 第53页 |
| ·系统发育分析方法 | 第53-55页 |
| ·MP法建树 | 第53页 |
| ·极大似然法建树 | 第53-54页 |
| ·距离法建树 | 第54页 |
| ·贝叶斯系统发育推论建树 | 第54页 |
| ·不同系统树的 SH检验 | 第54-55页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第55-107页 |
| 1 基因组总 DNA的提取、PCR扩增及序列的测定 | 第55-56页 |
| ·总 DNA提取 | 第55页 |
| ·引物的适用性和目的片段的扩增 | 第55页 |
| ·PCR产物测序 | 第55-56页 |
| 2 实验数据处理和分析 | 第56-76页 |
| ·序列比对结果 | 第56-57页 |
| ·序列组成成分分析 | 第57-59页 |
| ·线粒体 DNA | 第57-58页 |
| ·核28SrDNA | 第58页 |
| ·联合数据集 | 第58页 |
| ·各数据集R值比较 | 第58-59页 |
| ·分类单元间碱基组成频率检验 | 第59页 |
| ·各数据组未校正 P距离 | 第59-68页 |
| ·系统发育信号检测 | 第68-76页 |
| ·碱基替换饱和性分析 | 第68-70页 |
| ·随机树长分布分析 | 第70-74页 |
| ·PTP检验 | 第74-75页 |
| ·可联合性分析 | 第75-76页 |
| 3 系统发育分析 | 第76-105页 |
| ·简约法建树 | 第76-92页 |
| ·Cytb构建 MP树 | 第77-78页 |
| ·CoII构建MP树 | 第78-79页 |
| ·16SrRNA、28SrDNA构建 MP树 | 第79-80页 |
| ·联合数据集构建 MP树 | 第80-82页 |
| ·PBS(Partition Bremer surport)检验 | 第82-83页 |
| ·构建加权 MP树 | 第83-92页 |
| ·最大似然法建树 | 第92-95页 |
| ·距离法建树 | 第95-98页 |
| ·贝叶斯法建树 | 第98-103页 |
| ·不同建树方法的比较 | 第103-105页 |
| ·不同方法单基因建树之间的比较 | 第103-104页 |
| ·基因联合不同建树方法的比较 | 第104-105页 |
| 4 四种方法所建四基因联合树的 SH检验 | 第105页 |
| 5 网翅蝗科部分种类系统发育关系 | 第105-107页 |
| 第四部分 讨论 | 第107-122页 |
| 1 可靠目的基因序列获得的方法 | 第107-108页 |
| 2 数据分析的探讨 | 第108-113页 |
| 3 系统发育构建策略 | 第113-120页 |
| ·分类单元的选择 | 第113-114页 |
| ·性状的取样选择(character sampling) | 第114-115页 |
| ·多源数据集分析策略 | 第115-117页 |
| ·系统发育的建树方法 | 第117-120页 |
| 4 关于网翅蝗科的系统发育问题 | 第120-122页 |
| 第五部分 总结 | 第122-125页 |
| 参考文献 | 第125-143页 |
| 附录1 序列比对结果 | 第143-160页 |
| 附录2 部分序列荧光峰图 | 第160-170页 |
| 致谢 | 第170-171页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第171页 |
