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寡核苷酸介导的基因定点纠错及其应用于β-地贫基因治疗的研究

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-12页
前言第12-22页
 1.靶向性基因治疗第12-13页
 2.嵌合体修复术第13-16页
 3.嵌合体修复术与β-地贫的基因治疗第16-21页
 4.本研究的课题设计第21-22页
材料与方法第22-41页
 一、材料第22-24页
  1.菌株和质粒第22页
  2.细胞系、脐带血第22页
  3.限制性内切酶及其它酶类第22页
  4.各种转染试剂第22页
  5.寡核苷酸第22-23页
  6.细胞因子及抗体第23页
  7.其它主要试剂及试剂盒第23页
  8.主要仪器第23页
  9.放射性核素第23-24页
 二、实验方法第24-41页
  1.实验流程图第24-25页
  2.质粒的构建第25-28页
   ·聚乙二醇(PEG)回收DNA片段第25页
   ·凝胶回收试剂盒回收DNA片段第25-26页
   ·DNA片段3′凹端的补平第26页
   ·DNA片段3′凸端的削平第26页
   ·载体的脱磷酸化第26页
   ·连接反应第26-27页
   ·感受态大肠杆菌细胞制备第27页
   ·转化第27页
   ·质粒DNA的小量制备第27页
   ·质粒DNA的大量制备第27-28页
   ·荧光测序第28页
  3.哺乳动物细胞系及脐带血CD34~+细胞的分离和培养第28-30页
   ·细胞培养第28页
   ·G418溶液配制第28页
   ·细胞传代及冻存第28-29页
   ·细胞复苏第29页
   ·Hemine诱导K562、HEL细胞分化第29页
   ·从人脐血中分离CD34~+造血干/祖细胞第29页
   ·CD34~+细胞含量检测第29页
   ·CD34~+造血干/祖细胞集落形成实验第29-30页
     ·2.2%甲基纤维素溶液的配制第30页
     ·集落形成分析第30页
  4.细胞转染第30-33页
   ·电穿孔法转染DNA第30页
   ·脂质体介导的基因转染第30-32页
     ·Lipofectamine 2000法转染第30-31页
     ·DOTAP介导的基因转染第31-32页
     ·DIRIE-C介导的基因转染第32页
   ·Gene Jammer介导的基因转染第32-33页
   ·PEI介导的基因转染第33页
  5.利用荧光素酶分析系统测定转染效率第33-34页
   ·转染细胞的裂解第33页
     ·贴壁细胞的裂解第33页
     ·悬浮细胞的裂解第33页
   ·荧光素酶的检测第33-34页
  6.Southern blot分析第34-35页
   ·基因组DNA的提取第34页
   ·Southern印迹分析第34-35页
     ·酶解第34页
     ·电泳第34页
     ·Southern转移第34页
     ·预杂交第34页
     ·DNA探针标记第34-35页
     ·杂交第35页
     ·洗膜及放射自显影第35页
  7.哺乳动物RNA的Northern分析第35-36页
   ·从哺乳动物细胞中分离总RNA第35页
   ·RNA在甲醛变性胶上电泳第35-36页
   ·RNA样品处理第36页
   ·电泳及转膜第36页
   ·探针标记及杂交第36页
  8.PCR扩增待检测片段第36-37页
   ·基因组DNA的提取第36页
     ·从哺乳动物细胞中分离高分子量的基因组DNA第36页
     ·细胞裂解法分离基因组DNA第36页
   ·PCR反应引物的设计及序列第36-37页
  9.限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)分析寡核苷酸的定点突变作用第37-38页
  10.等位基因特异PCR检测寡核苷酸的定点突变作用第38页
  11.定点突变克隆的筛选第38页
  12.半定量RT-PCR检测突变K562、HEL细胞中人γ-珠蛋白基因的表达水平第38-39页
   ·从转染的细胞中提取细胞总RNA第39页
   ·反转录成cDNA第一链第39页
   ·半定量RT-PCR第39页
  13.酸性解链电泳检测经诱导的K562、HEL细胞中的珠蛋白第39-41页
   ·血红蛋白的提取第39页
   ·聚丙烯酰胺凝胶的配制第39-40页
   ·上样、电泳与凝胶处理第40-41页
实验结果第41-69页
 Ⅰ.EGFP荧光报告系统的构建第41-53页
  一、突变EGFP基因(mEGFP)的获得及真核表达质粒的构建第41-45页
   1.用PCR的方法获得突变基因第41页
   2.突变EGFP基因(mEGFP)的序列分析第41页
   3.pmEGFP真核表达载体的构建第41-45页
  二、HeLa-mEGFP细胞株的建立第45-46页
  三、mEGFP基因的定点纠错第46-53页
   1.针对mEGFP基因的点突变的打靶分子的设计第46页
   2.FAM标记的寡核苷酸转染细胞实验第46-48页
   3.RDO介导的基因定点纠错第48页
   4.硫代磷酸酯修饰的单链DNA寡核苷酸介导的基因定点纠错第48-53页
   ·流式分析E3-F5、E6-F5发光细胞的含量第48页
   ·流式分选的发光细胞DNA水平的分析第48-51页
   ·转染时寡核苷酸的量与纠正效率的关系分析第51-53页
 Ⅱ.Gγ基因调控序列的定点突变第53-69页
  1.针对Gγ基因启动子-202 C→G突变的打靶分子的设计第53-54页
  2.脐血CD34~+造血干/祖细胞的分离、体外培养及功能检测第54-57页
   ·免疫磁珠法分离CD34~+造血干/祖细胞第54页
   ·CD34~+造血干/祖细胞的体外培养第54页
   ·造血干/祖细胞集落形成实验第54-57页
  3.FAM标记的寡核苷酸转染细胞实验第57-59页
  4.PCR-RFLP分析寡核苷酸的定点突变作用第59-63页
  5.PCR产物序列分析第63页
  6.硫代磷酸酯修饰的SDO转染的K562细胞Southern杂交分析第63-65页
  7.半定量RT-PCR检测SDO定点突变的K562中γ-基因的表达第65-66页
  8.酸性解链电泳测定珠蛋白含量第66-67页
  9.硫代磷酸酯修饰的SDO转染K562细胞的突变率曲线第67-68页
  10.SDO-49对K562细胞的定点突变作用第68页
  11.定点突变克隆的筛选第68-69页
讨论第69-74页
 一、影响嵌合体修复术定点纠错效率的因素第69-71页
 二、基因定点纠错报告系统的比较第71-72页
 三、嵌合体修复术的应用前景第72-74页
小结第74-75页
参考文献第75-79页
文献综述第79-90页
英文名词及缩写第90-91页
致谢第91-92页
个人简历第92页

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