| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第16-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-34页 |
| 1.1 研究背景 | 第20-30页 |
| 1.1.1 幽门螺杆菌的概述 | 第20页 |
| 1.1.2 幽门螺杆菌致病机制的研究现状 | 第20-25页 |
| 1.1.3 幽门螺杆菌感染与肿瘤微环境 | 第25-26页 |
| 1.1.4 幽门螺杆菌感染与非编码RNAs | 第26-30页 |
| 1.2 研究目的和内容 | 第30-31页 |
| 1.2.1 研究目的 | 第30页 |
| 1.2.2 研究内容 | 第30-31页 |
| 1.3 技术路线 | 第31-33页 |
| 1.4 研究意义 | 第33-34页 |
| 第二章 幽门螺杆菌感染相关非编码RNAs的筛选 | 第34-64页 |
| 2.1 材料 | 第34-39页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第34页 |
| 2.1.2 细胞株 | 第34页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第34-35页 |
| 2.1.4 相关试剂及溶液的配制 | 第35-38页 |
| 2.1.5 主要仪器及设备 | 第38-39页 |
| 2.2 方法 | 第39-46页 |
| 2.2.1 H.pylori的培养与鉴定 | 第39页 |
| 2.2.2 细胞的培养 | 第39-40页 |
| 2.2.3 共培养细胞模型的构建 | 第40页 |
| 2.2.4 细胞总蛋白的提取 | 第40-41页 |
| 2.2.5 Western blot检测细胞促炎因子的表达 | 第41-42页 |
| 2.2.6 ELISA检测细胞上清中促炎因子的表达 | 第42-43页 |
| 2.2.7 细胞总RNA的提取与质量鉴定 | 第43-44页 |
| 2.2.8 基因芯片的检测 | 第44-45页 |
| 2.2.9 生物信息学分析 | 第45-46页 |
| 2.3 结果 | 第46-61页 |
| 2.3.1 H.pylori的分离培养与鉴定 | 第46-47页 |
| 2.3.2 共培养模型的建立 | 第47-48页 |
| 2.3.3 基因芯片的检测 | 第48-51页 |
| 2.3.4 生物信息学分析 | 第51-61页 |
| 2.4 讨论 | 第61-64页 |
| 第三章 幽门螺杆菌感染相关非编码RNAs的验证与鉴定 | 第64-92页 |
| 3.1 材料 | 第64-67页 |
| 3.1.1 菌株和质粒 | 第64页 |
| 3.1.2 细胞株 | 第64-65页 |
| 3.1.3 临床标本的筛选与收集 | 第65页 |
| 3.1.4 主要试剂 | 第65-66页 |
| 3.1.5 相关试剂及溶液的配制 | 第66-67页 |
| 3.1.6 主要仪器及设备 | 第67页 |
| 3.2 方法 | 第67-75页 |
| 3.2.1 H.pylori的培养与鉴定 | 第67-68页 |
| 3.2.2 细胞的培养 | 第68页 |
| 3.2.3 H.pylori与细胞共培养 | 第68页 |
| 3.2.4 细胞总RNA的提取与质量鉴定 | 第68页 |
| 3.2.5 临床标本的总RNA的提取与质量鉴定 | 第68页 |
| 3.2.6 RNA的逆转录 | 第68-70页 |
| 3.2.7 差异表达ncRNAs的验证 | 第70-73页 |
| 3.2.8 差异表达ncRNAs的鉴定 | 第73-75页 |
| 3.2.9 统计学分析 | 第75页 |
| 3.3 结果 | 第75-89页 |
| 3.3.1 差异表达ncRNAs的表达验证 | 第75-78页 |
| 3.3.2 不同感染模型中差异ncRNAs的表达验证 | 第78-82页 |
| 3.3.3 临床胃黏膜标本差异ncRNAs的验证 | 第82-83页 |
| 3.3.4 差异ncRNAs与H.pylori感染胃黏膜病理相关性分析 | 第83-86页 |
| 3.3.5 差异lncRNAs的鉴定 | 第86-89页 |
| 3.4 讨论 | 第89-92页 |
| 第四章 Hsa-mir-29a在幽门螺杆菌感染致病中的功能研究 | 第92-102页 |
| 4.1 材料 | 第92-94页 |
| 4.1.1 菌株和细胞株 | 第92页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第92-93页 |
| 4.1.3 相关试剂及溶液的配制 | 第93页 |
| 4.1.4 主要仪器和耗材 | 第93-94页 |
| 4.2 方法 | 第94-95页 |
| 4.2.1 细胞培养 | 第94页 |
| 4.2.2 细菌和细胞共培养 | 第94页 |
| 4.2.3 MiRNA-模拟物/抑制剂的转染 | 第94-95页 |
| 4.2.4 细胞总RNA的提取和逆转录反应 | 第95页 |
| 4.2.5 QRT-PCR验证miRNA表达水平 | 第95页 |
| 4.2.6 Western blot检测相关指标的表达 | 第95页 |
| 4.2.7 统计学分析 | 第95页 |
| 4.3 结果 | 第95-99页 |
| 4.3.1 不同MOI感染模型中hsa-mir-29a-3p的表达 | 第95-96页 |
| 4.3.2 Hsa-mir-29a-3p过表达和沉默效果验证 | 第96页 |
| 4.3.3 Hsa-mir-29a-3p在胃黏膜细胞中的生物学功能 | 第96-99页 |
| 4.4 讨论 | 第99-102页 |
| 第五章 Hsa-mir-29a在幽门螺杆菌感染致病中的机制研究 | 第102-122页 |
| 5.1 材料 | 第102-105页 |
| 5.1.1 菌株和质粒 | 第102-103页 |
| 5.1.2 细胞株 | 第103页 |
| 5.1.3 主要试剂 | 第103-104页 |
| 5.1.4 相关试剂及溶液的配制 | 第104-105页 |
| 5.1.5 主要仪器和设备 | 第105页 |
| 5.2 方法 | 第105-113页 |
| 5.2.1 靶基因的预测 | 第105页 |
| 5.2.2 靶位点荧光素酶报告载体的构建 | 第105-110页 |
| 5.2.3 细胞培养 | 第110页 |
| 5.2.4 报告载体与miRNA-模拟物/抑制剂的共转染 | 第110-111页 |
| 5.2.5 双荧光素酶活性的检测 | 第111-112页 |
| 5.2.6 MiRNA-模拟物/抑制剂的转染 | 第112-113页 |
| 5.2.7 细菌和细胞共培养 | 第113页 |
| 5.2.8 细胞总蛋白的提取 | 第113页 |
| 5.2.9 Western blot检测靶基因蛋白的表达 | 第113页 |
| 5.2.10 统计学分析 | 第113页 |
| 5.3 结果 | 第113-118页 |
| 5.3.1 Hsa-mir-29a-3p靶基因的预测 | 第113-114页 |
| 5.3.2 靶位点荧光素酶报告载体的构建和鉴定 | 第114-115页 |
| 5.3.3 Hsa-mir-29a-3p与靶基因 3'UTR结合位点的鉴定 | 第115-116页 |
| 5.3.4 Hsa-mir-29a-3p对靶基因蛋白表达的影响作用 | 第116-117页 |
| 5.3.5 Hsa-mir-29a-3p-靶基因在H.pylori感染中的表达关系的验证 | 第117-118页 |
| 5.4 讨论 | 第118-122页 |
| 第六章 Hsa-mir-29a靶基因在幽门螺杆菌感染致病中的作用初探 | 第122-140页 |
| 6.1 材料 | 第122-124页 |
| 6.1.1 菌株和质粒 | 第122-123页 |
| 6.1.2 细胞株 | 第123页 |
| 6.1.3 临床标本 | 第123页 |
| 6.1.4 主要试剂 | 第123-124页 |
| 6.1.5 相关试剂及溶液的配制 | 第124页 |
| 6.1.6 主要仪器及耗材 | 第124页 |
| 6.2 方法 | 第124-129页 |
| 6.2.0 Western blot检测不同感染细胞模型中靶基因蛋白的表达 | 第124-125页 |
| 6.2.1 临床胃黏膜标本中靶基因转录及蛋白水平的表达 | 第125-126页 |
| 6.2.2 靶基因的基因沉默和过表达 | 第126-127页 |
| 6.2.3 细胞总RNA的提取和逆转录反应 | 第127页 |
| 6.2.4 QRT-PCR验证相关指标表达水平 | 第127-128页 |
| 6.2.5 IF检测NF-κB (p65/p50) 核转位 | 第128页 |
| 6.2.6 ELISA检测相关指标表达水平 | 第128-129页 |
| 6.2.7 统计学分析 | 第129页 |
| 6.3 结果 | 第129-136页 |
| 6.3.1 靶基因A20在不同胃黏膜细胞感染模型中的表达情况 | 第129-130页 |
| 6.3.2 靶基因A20在临床胃黏膜标本中的表达 | 第130-131页 |
| 6.3.3 靶基因A20敲减和过表达效果验证 | 第131-132页 |
| 6.3.4 靶基因A20对NF-κB p65和Phospho-NF-κB p65表达的影响 | 第132页 |
| 6.3.5 靶基因A20对NF-κB p65/p50核转位的影响 | 第132-133页 |
| 6.3.6 靶基因A20对NF-κB下游炎症因子表达的影响 | 第133-134页 |
| 6.3.7 靶基因A20对H.pylori感染诱导的炎症因子表达的影响 | 第134-135页 |
| 6.3.8 靶基因A20对H.pylori感染诱导的基质金属蛋白酶表达的影响 | 第135-136页 |
| 6.4 讨论 | 第136-140页 |
| 第七章 主要结论、展望及研究不足 | 第140-142页 |
| 7.1 主要结论 | 第140-141页 |
| 7.2 展望 | 第141页 |
| 7.3 研究不足 | 第141-142页 |
| 参考文献 | 第142-152页 |
| 致谢 | 第152-154页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文和参加的课题 | 第154页 |
| 发表的论文 | 第154页 |
| 参加的课题 | 第154页 |
