基于改进遗传算法的DNA序列设计
摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-12页 |
引言 | 第12-14页 |
1 绪论 | 第14-18页 |
·DNA计算的优点 | 第14页 |
·DNA计算取得的进展 | 第14-16页 |
·DNA计算模型 | 第14-15页 |
·DNA计算实现方式 | 第15页 |
·模拟四则运算系统 | 第15页 |
·DNA大规模数据库 | 第15-16页 |
·DNA编码问题 | 第16页 |
·本文主要内容 | 第16-17页 |
·本文的创新之处 | 第17-18页 |
2 分子生物学基础介绍 | 第18-31页 |
·DNA分子的组成及其结构 | 第18-20页 |
·DNA分子的组成 | 第18-19页 |
·DNA分子的结构 | 第19-20页 |
·DNA分子的变性和复性 | 第20-21页 |
·DNA分子的复制 | 第21-22页 |
·DNA计算中常用的生物操作 | 第22-28页 |
·DNA分子的合成 | 第22-23页 |
·DNA分子的切割、连接和粘贴 | 第23-24页 |
·DNA重组技术 | 第24-26页 |
·DNA分子的PCR扩增 | 第26页 |
·DNA分子的分离和提取 | 第26-28页 |
·DNA计算的Adleman实现方式 | 第28-30页 |
·小结 | 第30-31页 |
3 DNA编码问题 | 第31-38页 |
·引言 | 第31-32页 |
·DNA编码的定义及其意义 | 第32页 |
·DNA编码定义 | 第32页 |
·DNA编码的意义 | 第32页 |
·DNA编码的约束条件 | 第32-35页 |
·化学自由能变化ΔG | 第33页 |
·解链温度T_m | 第33页 |
·GC含量 | 第33页 |
·生物酶 | 第33-34页 |
·编码距离 | 第34-35页 |
·DNA计算编码研究方法 | 第35-38页 |
·最小长度子串方法 | 第35-36页 |
·模板—映射方法 | 第36页 |
·算法搜索 | 第36页 |
·模板框 | 第36-37页 |
·编码的热力学性质 | 第37-38页 |
4 遗传算法概述 | 第38-42页 |
·遗传算法的原理 | 第38页 |
·遗传算法的特点 | 第38-40页 |
·遗传算法的优点 | 第38-39页 |
·遗传算法的不足 | 第39-40页 |
·遗传算子 | 第40-42页 |
·选择算子 | 第40-41页 |
·交叉算子 | 第41页 |
·变异算子 | 第41-42页 |
5 基于改进遗传算法的DNA编码质量优化 | 第42-47页 |
·DNA编码质量优化研究现状 | 第42页 |
·应用的DNA编码的约束条件 | 第42-43页 |
·汉明距离约束 | 第42页 |
·汉明逆距离约束 | 第42-43页 |
·汉明逆补距离约束 | 第43页 |
·连续性约束 | 第43页 |
·GC含量约束 | 第43页 |
·适应度函数 | 第43页 |
·算法设计 | 第43-44页 |
·仿真以及实验结果 | 第44-45页 |
·仿真结果 | 第44页 |
·实验结果 | 第44-45页 |
·小结 | 第45-47页 |
6 DNA序列的集合设计 | 第47-58页 |
·相关定义及概念 | 第47页 |
·研究意义 | 第47页 |
·研究现状 | 第47-48页 |
·理论研究 | 第48页 |
·算法研究 | 第48页 |
·算法设计及其实验结果分析 | 第48-56页 |
·遗传算法及其实验室结果分析 | 第48-50页 |
·改进的遗传算法及其实验室结果分析 | 第50-53页 |
·动态遗传算法及其实验室结果分析 | 第53-56页 |
·小结 | 第56-58页 |
7 总结与展望 | 第58-60页 |
·总结 | 第58页 |
·展望 | 第58-60页 |
·DNA信息存储 | 第59页 |
·DNA密码 | 第59页 |
·DNA智能领域 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-66页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第66-67页 |
致谢 | 第67页 |