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固氮施氏假单胞菌一般胁迫反应蛋白RpoS的鉴定和作用机制研究

摘要第1-7页
Abstract第7-17页
第一章 文献综述第17-41页
   ·前言第17页
   ·σS 基因表达调控功能的研究第17-22页
     ·σ~S 的发现及其主要特征第17-18页
     ·受σ~S 调控的基因第18-19页
     ·σ~S 识别的启动子区保守序列第19-20页
     ·Eσ~S 和Eσ70 识别的启动子的不同特征第20-22页
   ·细胞内σ~S 水平的控制第22-32页
     ·rpoS 转录的调控第22-24页
     ·rpoS 翻译的调控第24-27页
     ·σ~S 蛋白水解的调控第27-29页
     ·RpoS 活性的调控第29-30页
     ·ArcB/ArcA/RssB “三组份”系统与RpoS 的表达和降解第30-32页
   ·σ~S 在大肠杆菌和假单胞菌中的调控差异第32-36页
     ·在假单胞菌和大肠杆菌中RpoS-依赖的调控第32-33页
     ·rpoS 的启动子和转录调控证据第33-36页
   ·限制性培养基中RpoS 的全局性调控作用第36-39页
   ·立题依据第39-41页
第二章 施氏假单胞菌A1501 中rpoS 基因突变株和互补株的构建第41-53页
   ·材料第41-43页
     ·菌株和质粒第41-42页
     ·培养基第42-43页
     ·酶和化学试剂第43页
     ·主要仪器第43页
   ·方法第43-47页
     ·碱裂解法小量提取细菌质粒第43-44页
     ·基因的PCR 扩增第44-45页
     ·PCR 产物的纯化第45-46页
     ·琼脂糖凝胶中 DNA 片段的回收第46页
     ·酶切及连接反应第46页
     ·连接产物的转化第46页
     ·高效率转化感受态细胞的制备第46-47页
     ·大肠杆菌电激转化第47页
     ·三亲结合实验第47页
   ·结果分析第47-52页
     ·rpoS 缺失突变株的构建第47-50页
     ·功能互补菌株的构建第50-52页
   ·讨论第52-53页
第三章 rpoS 突变株抗逆及固氮等生理生化表型鉴定第53-64页
   ·材料第53-54页
     ·菌株和质粒第53页
     ·培养基第53-54页
     ·酶和化学试剂第54页
     ·主要仪器第54页
   ·方法第54-57页
     ·基因的PCR 扩增第54-55页
     ·生长曲线的测定第55页
     ·固氮酶活性的测定第55-56页
     ·考马斯亮蓝法测定全细胞的蛋白含量第56页
     ·逆境胁迫实验第56页
     ·biolog 分析野生型与突变株对碳源的利用情况第56-57页
   ·结果分析第57-62页
     ·P. stutzeri A1501 菌 rpoS 与其它菌中同源基因的进化分析第57页
     ·野生型、突变株及功能互补菌株生长曲线的测定第57-58页
     ·rpoS 突变对固氮酶活性的影响第58-59页
     ·rpoS 基因缺失对盐胁迫耐受性的影响第59-60页
     ·多种胁迫条件下rpoS 野生型与突变株的生长状况第60-61页
     ·Biolog 分析野生型与突变株对多种碳源的利用情况第61-62页
   ·讨论第62-64页
第四章 RpoS 在一般胁迫反应中的作用机制第64-87页
   ·材料第64-67页
     ·菌株和质粒第64-65页
     ·培养基第65页
     ·酶与化学试剂第65页
     ·主要仪器第65页
     ·常用溶液第65-67页
   ·方法第67-76页
     ·基因的PCR 扩增第67页
     ·细菌基因组RNA 的提取第67-68页
     ·RNA 反转录为cDNA第68-69页
     ·A1501 基因组的提取第69页
     ·实时荧光定量PCR 实验第69-71页
     ·RpoS 蛋白表达载体的选择与融合载体的构建第71页
     ·RpoS 蛋白的诱导表达条件的选择第71页
     ·SDS-PAGE 电泳(采用垂直式电泳槽装置)第71-72页
     ·用2ml Chitin 亲合柱进行蛋白纯化第72-73页
     ·DEAE52 阴离子交换层析纯化蛋白第73-74页
     ·蛋白的脱盐与浓缩第74页
     ·凝胶阻滞实验第74-75页
     ·启动子截短实验第75-76页
   ·结果与分析第76-85页
     ·施氏假单胞菌 A1501 中受 σ~S 调控基因的预测及分析第76页
     ·RNA 的提取第76-77页
     ·qRT-PCR 分析验证受σ~S 调控的下游基因第77-78页
     ·RpoS 表达载体的构建第78-80页
     ·RpoS 蛋白的表达第80页
     ·RpoS 蛋白的纯化第80-83页
     ·凝胶阻滞实验分析基因与蛋白的结合第83-84页
     ·启动子截短实验分析蛋白在启动子区的结合部位第84-85页
   ·讨论第85-87页
第五章 结论第87-88页
参考文献第88-99页
致谢第99-100页
作者简历第100页

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