基于集成智能的膜蛋白受体结构与功能研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-18页 |
| ·研究背景及意义 | 第12-15页 |
| ·论文的研究内容和创新点 | 第15-16页 |
| ·论文的章节安排 | 第16-18页 |
| 第二章 膜蛋白受体智能识别的研究 | 第18-39页 |
| ·引言 | 第18-21页 |
| ·背景和相关工作 | 第21-27页 |
| ·人工神经网络 | 第22-23页 |
| ·遗传算法 | 第23-24页 |
| ·支持向量机 | 第24-26页 |
| ·其它方法 | 第26页 |
| ·集成智能 | 第26-27页 |
| ·在线服务器 | 第27页 |
| ·材料与方法 | 第27-33页 |
| ·研究数据集 | 第27-29页 |
| ·蛋白质一阶签名模型 | 第29-30页 |
| ·二进制粒子群算法 | 第30-31页 |
| ·模糊K近邻分类器 | 第31-32页 |
| ·基于集成智能的预测 | 第32-33页 |
| ·结果与分析 | 第33-36页 |
| ·G蛋白偶联受体WEB服务器的构建 | 第36-37页 |
| ·构建步骤 | 第36页 |
| ·使用步骤 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-39页 |
| 第三章 膜蛋白受体相互作用的识别研究 | 第39-48页 |
| ·引言 | 第39-40页 |
| ·背景及相关工作 | 第40-41页 |
| ·BOOSTING算法 | 第41-42页 |
| ·材料与方法 | 第42-45页 |
| ·数据集 | 第42-43页 |
| ·自适应免疫算法 | 第43-44页 |
| ·改进型LogitBoost分类器 | 第44-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第四章 膜蛋白受体与药物相互作用网络研究 | 第48-62页 |
| ·引言 | 第48-50页 |
| ·半监督学习简介 | 第50-52页 |
| ·SEMIBOOST原理 | 第52-55页 |
| ·网络的构建与分析 | 第55-60页 |
| ·数据集 | 第55页 |
| ·相似度矩阵构建 | 第55-56页 |
| ·网络的构建 | 第56页 |
| ·方法对比及评估 | 第56-58页 |
| ·膜蛋白受体与药物相互作用网络的预测 | 第58-60页 |
| ·本章小结 | 第60-62页 |
| 第五章 凋谢蛋白亚细胞定位算法的研究 | 第62-76页 |
| ·引言 | 第62-63页 |
| ·背景及相关工作 | 第63-65页 |
| ·蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究 | 第63-64页 |
| ·凋谢蛋白亚细胞定位的生物信息学研究 | 第64-65页 |
| ·基于近似熵和免疫遗传优化的改进型伪氨基酸模型 | 第65-70页 |
| ·伪氨基酸组成模型 | 第65-66页 |
| ·近似熵理论 | 第66-67页 |
| ·疏水氨基酸对模式 | 第67-69页 |
| ·免疫遗传算法 | 第69-70页 |
| ·改进的伪氨基酸组成模型 | 第70页 |
| ·ADABOOST分类器原理及应用 | 第70-72页 |
| ·结果与分析 | 第72-74页 |
| ·本章小结 | 第74-76页 |
| 第六章 基于基因协同调控的转录调节蛋白网络研究 | 第76-98页 |
| ·引言 | 第76-77页 |
| ·无标度复杂网络的生物信息学意义 | 第77-79页 |
| ·基因协同表达与协同调控关系的探讨 | 第79-86页 |
| ·数据集的选取和整理 | 第79-80页 |
| ·启动子组学矩阵(P-matrix)模型 | 第80-81页 |
| ·计算结果和讨论 | 第81-83页 |
| ·基因协同调控模拟算法 | 第83-85页 |
| ·仿真结果与分析 | 第85-86页 |
| ·转录调节蛋白网络的构建与优化 | 第86-90页 |
| ·基于协同调控的转录调节蛋白网络构建 | 第86-87页 |
| ·PCIT算法简介 | 第87-88页 |
| ·RIF参数简介 | 第88-89页 |
| ·集成RIF和PCIT的网络优化 | 第89-90页 |
| ·转录调节蛋白网络的生物信息学分析 | 第90-96页 |
| ·网络节点的模块预测 | 第90-92页 |
| ·基于网络集成熵的网络功能结构指数分析 | 第92-94页 |
| ·核心子网络的生物学意义探讨 | 第94-96页 |
| ·本章小结 | 第96-98页 |
| 第七章 总结与展望 | 第98-101页 |
| ·总结 | 第98-99页 |
| ·展望 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-120页 |
| 致谢 | 第120-122页 |
| 附录 | 第122-125页 |
| 附录A 攻读博士学位期间完成的学术成果 | 第122-124页 |
| 附录B 攻读博士学位期间所参与的项目 | 第124-125页 |
| 附录C 攻读博士学位期间获得的奖励和荣誉 | 第125页 |
