| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 目录 | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-45页 |
| ·环境微生物学及研究发展趋势 | 第12-14页 |
| ·传统环境微生物研究方法的局限 | 第13页 |
| ·环境微生物研究的新发展 | 第13-14页 |
| ·分子生态学技术基本概况 | 第14-43页 |
| ·分子生物学概述 | 第14-17页 |
| ·分子生态技术简介 | 第17-43页 |
| ·课题研究背景及主要研究内容 | 第43-45页 |
| ·课题研究背景 | 第43-44页 |
| ·主要研究内容 | 第44-45页 |
| 第二章 不同氮浓度条件下土壤微生物群落与功能基因研究 | 第45-89页 |
| ·材料与方法 | 第45-57页 |
| ·样品采集地描述 | 第45-51页 |
| ·样品中DNA的抽提、纯化和定量 | 第51-52页 |
| ·功能基因芯片杂交 | 第52-56页 |
| ·图像处理 | 第56页 |
| ·数据分析与处理 | 第56-57页 |
| ·结果与讨论 | 第57-88页 |
| ·功能基因芯片结果及数据初步处理 | 第57-60页 |
| ·添加氮肥对植物生长的影响 | 第60-61页 |
| ·24个样品功能基因芯片的整体分析 | 第61-66页 |
| ·碳、氮、硫和磷循环功能基因分析 | 第66-75页 |
| ·与氮循环相关的关键基因分析 | 第75-83页 |
| ·外界因素与样品中微生物群落结构之间的关系 | 第83-88页 |
| ·本章小结 | 第88-89页 |
| 第三章 施肥时间长短对土壤微生物群落及功能基因的影响 | 第89-111页 |
| ·材料与方法 | 第89-90页 |
| ·样品描述 | 第89-90页 |
| ·样品中DNA的抽提、纯化和定量 | 第90页 |
| ·功能基因芯片杂交及扫描 | 第90页 |
| ·数据分析与处理 | 第90页 |
| ·结果与讨论 | 第90-110页 |
| ·功能基因芯片结果及数据初步处理 | 第90-91页 |
| ·八个样品中功能基因芯片的整体分析 | 第91-96页 |
| ·参与碳、氮、硫和磷循环作用相关功能基因分析 | 第96-103页 |
| ·与氮循环相关关键功能基因分析 | 第103-110页 |
| ·本章小结 | 第110-111页 |
| 第四章 矿山酸性废水中微生物生态多样性研究 | 第111-131页 |
| ·材料与方法 | 第112-119页 |
| ·采样点描述及样品收集 | 第112-114页 |
| ·地理化学参数分析 | 第114页 |
| ·群落基因组DNA的提取、纯化 | 第114-115页 |
| ·细菌和古菌16S rDNA的扩增 | 第115-116页 |
| ·感受态制备、基因克隆与RFLP酶切 | 第116-118页 |
| ·序列测定及系统发育分析 | 第118-119页 |
| ·核苷酸序列登录号 | 第119页 |
| ·结果与讨论 | 第119-129页 |
| ·样品的地理化学性质分析结果 | 第119页 |
| ·RFLP结果 | 第119-124页 |
| ·两样品中细菌16S rDNA片断RFLP饱和度分析及测序 | 第124-127页 |
| ·云浮硫铁矿两样品中细菌16S rDNA基因比较 | 第127-129页 |
| ·本章小结 | 第129-131页 |
| 第五章 结论 | 第131-133页 |
| 参考文献 | 第133-146页 |
| 博士期间发表论文、申请专利及获奖情况 | 第146-149页 |
| 致谢 | 第149页 |