| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 研究背景 | 第10-25页 |
| 1.1 杂交概述 | 第10-11页 |
| 1.2 生殖隔离 | 第11-16页 |
| 1.2.1 生殖隔离方式 | 第11-12页 |
| 1.2.2 生殖隔离的遗传基础 | 第12-16页 |
| 1.3 杂交带 | 第16-19页 |
| 1.3.1 杂交带定义 | 第16页 |
| 1.3.2 杂交带的形成与变化 | 第16-17页 |
| 1.3.3 杂交带生殖隔离研究 | 第17-18页 |
| 1.3.4 杂交带对基因流的影响 | 第18-19页 |
| 1.4 种间基因流影响群体基因组分化 | 第19-21页 |
| 1.5 杨属简介 | 第21-23页 |
| 1.6 本研究的科学问题 | 第23-25页 |
| 第二章 研究方法 | 第25-36页 |
| 2.1 样品采集与全基因组测序 | 第25-26页 |
| 2.2 全基因组遗传变异分析 | 第26-27页 |
| 2.2.1 测序质量评估及过滤 | 第26页 |
| 2.2.2 全基因组序列比对 | 第26页 |
| 2.2.3 遗传变异鉴定 | 第26-27页 |
| 2.3 群体基因组学分析 | 第27-30页 |
| 2.3.1 个体亲缘关系鉴定 | 第27页 |
| 2.3.2 系统发育分析 | 第27页 |
| 2.3.3 主成分分析 | 第27-28页 |
| 2.3.4 群体结构分析 | 第28页 |
| 2.3.5 群体遗传多态性计算 | 第28-29页 |
| 2.3.6 种间单倍型共享分析(Identical by descent haplotype,IBD) | 第29页 |
| 2.3.7 群体重组率计算 | 第29-30页 |
| 2.3.8 连锁不平衡分析及近交分析 | 第30页 |
| 2.4 群体历史重建 | 第30-31页 |
| 2.5 杂种遗传组成及杂交不相容分析 | 第31页 |
| 2.6 群体分化分析 | 第31-32页 |
| 2.7 正选择分析(Positive Selection) | 第32-33页 |
| 2.8 基因流分析 | 第33-36页 |
| 2.8.1 ABBA-BABA分析 | 第33页 |
| 2.8.2 相对单倍型共享分析(rIBD) | 第33-34页 |
| 2.8.3 Gmin分析 | 第34页 |
| 2.8.4 渐渗基因单倍型Network图构建 | 第34-36页 |
| 第三章 研究结果 | 第36-88页 |
| 3.1 样品采集及测序结果 | 第36-44页 |
| 3.2 群体基因组学研究 | 第44-51页 |
| 3.2.1 系统发育分析 | 第44-46页 |
| 3.2.2 主成分分析 | 第46-47页 |
| 3.2.3 群体结构分析 | 第47页 |
| 3.2.4 群体遗传学参数 | 第47-49页 |
| 3.2.5 单倍型共享分析 | 第49-51页 |
| 3.3 群体历史重建 | 第51-57页 |
| 3.4 银灰杨遗传组成及其亲本种杂交不相容分析 | 第57-59页 |
| 3.5 群体分化研究 | 第59-64页 |
| 3.6 正选择分析 | 第64-77页 |
| 3.7 基因流分析 | 第77-88页 |
| 3.7.1 ABBA-BABA分析 | 第77-78页 |
| 3.7.2 相对单倍型共享分析(rIBD) | 第78-79页 |
| 3.7.3 Gmin分析 | 第79-86页 |
| 3.7.4 渐渗基因Network图构建 | 第86-88页 |
| 第四章 讨论 | 第88-94页 |
| 4.1 银白杨的近亲繁殖 | 第88页 |
| 4.2 杂交带维持及种间杂交不相容 | 第88-90页 |
| 4.3 种间基因流对群体遗传分化的影响 | 第90-91页 |
| 4.4 银白杨与欧洲山杨基因流 | 第91-92页 |
| 4.5 展望 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-107页 |
| 附录 | 第107-112页 |
| 在学期间的研究成果 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |