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Nur77和Dax1相互作用的结构生物学研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 前言第12-25页
    1.1 核受体家族第12-16页
        1.1.1 核受体的分类第13-15页
        1.1.2 核受体LBD的结构第15-16页
    1.2 孤儿核受体Nur77第16-20页
        1.2.1 Nur77 LBD的结构第16-18页
        1.2.2 Nur77的生理功能第18页
        1.2.3 Nur77和肺癌第18-19页
        1.2.4 Nur77和前列腺癌第19-20页
        1.2.5 Nur77的功能特性小结第20页
    1.3 孤儿核受体Daxl第20-23页
        1.3.1 Dax1的结构第20-21页
        1.3.2 Dax1的生理功能第21-22页
        1.3.3 Dax1和泛素化第22-23页
        1.3.4 Dax1和肿瘤第23页
    1.4 Nur77和Dax1第23-24页
    1.5 本文研究目的和意义第24-25页
第二章 X射线晶体学第25-36页
    2.1 X射线晶体学的发展第25-26页
    2.2 晶体制备第26-30页
        2.2.1 pH对蛋白结晶的影响第26-27页
        2.2.2 温度对蛋白结晶的影响第27页
        2.2.3 结晶动力学第27-28页
        2.2.4 不良晶体的形成第28-29页
        2.2.5 晶核种植第29-30页
        2.2.6 浸泡法和共晶法第30页
    2.3 几何晶体学第30-32页
        2.3.1 晶格理论第30-31页
        2.3.2 点群和空间群第31页
        2.3.3 衍射群第31-32页
    2.4 晶体衍射及衍射数据处理第32-35页
        2.4.1 X射线衍射原理第32-33页
        2.4.2 衍射数据处理第33页
        2.4.3 相位获取第33-34页
        2.4.4 模型搭建和精修第34页
        2.4.5 模型评估第34-35页
    2.5 本文涉及到的结构生物学方法第35-36页
第三章 实验材料和方法第36-49页
    3.1 实验材料第36-38页
        3.1.1 主要仪器第36-37页
        3.1.2 主要试剂第37-38页
        3.1.3 菌株和质粒第38页
    3.2 实验相关试剂配制第38-42页
        3.2.1 感受态制备相关试剂第38页
        3.2.2 SDS-PAGE电泳相关试剂第38-39页
        3.2.3 核酸电泳试剂第39-40页
        3.2.4 蛋白表达纯化主要试剂第40-41页
        3.2.5 Western Blot相关试剂第41页
        3.2.6 细菌培养相关试剂第41-42页
    3.3 实验方法第42-49页
        3.3.1 感受态的制备第42-43页
        3.3.2 LIC(不依赖连接酶的克隆)和转化步嫌第43页
        3.3.3 亲和层析步骤第43-44页
        3.3.4 GST pull down和Western Blot步骤第44-45页
        3.3.5 质粒提取和胶回收第45页
        3.3.6 部分克隆引物设计第45-46页
        3.3.7 IPTG诱导表达系统和重组蛋白的表达纯化第46-47页
        3.3.8 FortoBio检测分子间相互作用第47-48页
        3.3.9 动态光分析第48-49页
第四章 结果与讨论第49-69页
    4.1 重组质粒的构建第49页
        4.1.1 Nur77 LBD相关克隆第49页
        4.1.2 Dax1相关克隆第49页
    4.2 重组蛋白表达与纯化第49-54页
        4.2.1 pET-22b-Nur77 LBD的表达纯化第51-52页
        4.2.2 pGEX-4T-1-Nur77 LBD的表达纯化第52页
        4.2.3 Dax1的其他载体的表达纯化结果第52-53页
        4.2.4 pET-MBP-Dax1的表达纯化第53-54页
        4.2.5 Dax1小肽的表达情况第54页
    4.3 Dax1的稳定性检测和结构分析第54-57页
    4.4 Dax1小肽和Nur77 LBD相互作用的研究第57-62页
        4.4.1 核心小肽的发现第57-61页
        4.4.2 FortBio实验第61-62页
    4.5 Dax1小肽和Nur77 LBD的晶体复合物筛选第62-64页
        4.5.1 原条件下晶体复合物的筛选第62-64页
        4.5.2 晶体复合物的二次筛选第64页
    4.6 复合物结构模拟和预测第64-65页
    4.7 Dax1(201-225)小肽和其他蛋白的相互作用第65-68页
        4.7.1 Dax1(201-225)小肽和β-Catenin的相互作用第65-67页
        4.7.2 Dax1(201-225)小肽和Alien的相互作用第67页
        4.7.3 Dax1(201-225)小肽和LRH-1之间的相互作用第67-68页
    4.8 结果分析与展望第68-69页
参考文献第69-80页
致谢第80页

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