| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词说明 | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-19页 |
| 1.1 地衣细菌及其次生代谢产物研究概况 | 第12-13页 |
| 1.2 稀有放线菌及其次生代谢产物研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3 细菌全基因组测序技术 | 第14-15页 |
| 1.4 次生代谢产物预测 | 第15-16页 |
| 1.5 次生代谢产物的提取、分离与鉴定 | 第16-18页 |
| 1.6 本课题的研究目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 地衣放线菌菌株9846a全基因组测序分析 | 第19-42页 |
| 2.1 菌株活化和鉴定 | 第19-22页 |
| 2.1.1 材料和方法 | 第19-21页 |
| 2.1.1.1 实验材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1.2 实验方法 | 第20-21页 |
| 2.1.2 结果与分析 | 第21-22页 |
| 2.1.2.1 菌株培养 | 第21页 |
| 2.1.2.2 菌株鉴定 | 第21-22页 |
| 2.2 菌株9846a全基因组测序、组装评估及功能注释 | 第22-33页 |
| 2.2.1 材料和方法 | 第22-26页 |
| 2.2.1.1 实验材料 | 第22-23页 |
| 2.2.1.2 实验方法 | 第23-26页 |
| 2.2.2 结果与分析 | 第26-33页 |
| 2.2.2.1 数据产出及质量控制 | 第26-30页 |
| 2.2.2.2 蛋白编码基因的序列比对 | 第30页 |
| 2.2.2.3 蛋白编码基因的GO注释 | 第30-31页 |
| 2.2.2.4 蛋白编码基因的eggNOG注释 | 第31-32页 |
| 2.2.2.5 蛋白编码基因的KEGG注释 | 第32-33页 |
| 2.3 菌株9846a基因组功能预测分析 | 第33-40页 |
| 2.3.1 实验方法 | 第33-36页 |
| 2.3.2 结果与分析 | 第36-40页 |
| 2.3.2.1 非编码RNA预测 | 第36页 |
| 2.3.2.2 CRISPRs预测 | 第36-37页 |
| 2.3.2.3 原噬菌体预测 | 第37页 |
| 2.3.2.4 抗生素抗性分析 | 第37-38页 |
| 2.3.2.5 次生代谢产物预测 | 第38-40页 |
| 2.4 讨论 | 第40-41页 |
| 2.5 本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 地衣放线菌菌株9846a次生代谢产物分析 | 第42-57页 |
| 3.1 材料和方法 | 第42-47页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第42-43页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第43-47页 |
| 3.2 结果与分析 | 第47-56页 |
| 3.2.1 发酵液的制备 | 第47页 |
| 3.2.2 生物活性分析 | 第47页 |
| 3.2.3 次生代谢产物分析 | 第47-56页 |
| 3.3 讨论 | 第56页 |
| 3.4 本章小结 | 第56-57页 |
| 第四章 全文总结 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-69页 |
| 附录 | 第69-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |