| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第14-15页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 1.4 本文主要工作及安排 | 第17-20页 |
| 第二章 基于投影和聚类的长非编码RNA与疾病的关系预测 | 第20-30页 |
| 2.1 预测方法的基本框架 | 第20页 |
| 2.2 基于投影的矩阵分解算法 | 第20-26页 |
| 2.2.1 非负矩阵分解 | 第20-22页 |
| 2.2.2 基于推荐系统的矩阵分解 | 第22-24页 |
| 2.2.3 基于模式表示的非负矩阵分解 | 第24-25页 |
| 2.2.4 基于核函数的矩阵分解方法 | 第25-26页 |
| 2.3 聚类方法 | 第26-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第30-44页 |
| 3.1 实验平台 | 第30页 |
| 3.2 实验数据 | 第30页 |
| 3.3 基于投影的矩阵分解算法实验 | 第30-35页 |
| 3.3.1 算法参数的选择 | 第30-33页 |
| 3.3.2 三维图显示分解数据 | 第33-35页 |
| 3.4 Fisher判别函数确定聚类类数 | 第35-36页 |
| 3.5 聚类结果分析与性能比较 | 第36-43页 |
| 3.5.1 性能评价指标的描述 | 第36-38页 |
| 3.5.2 双聚类结果分析 | 第38页 |
| 3.5.3 层次聚类结果分析及算法比较 | 第38-43页 |
| 3.6 本章小结 | 第43-44页 |
| 第四章 长非编码RNAs的功能分析 | 第44-54页 |
| 4.1 功能分析的基本框架 | 第44-45页 |
| 4.2 长非编码RNA与基因的靶定关系 | 第45-46页 |
| 4.3 DAVID数据库基因注释 | 第46-47页 |
| 4.4 长非编码RNAs的功能分析结果及其与疾病的关联 | 第47-52页 |
| 4.4.1 长非编码RNAs的功能分析 | 第47-51页 |
| 4.4.2 长非编码RNAs的功能与疾病的关联 | 第51-52页 |
| 4.5 本章小结 | 第52-54页 |
| 第五章 总结与展望 | 第54-56页 |
| 5.1 总结 | 第54-55页 |
| 5.2 展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |
| 作者简介 | 第62-63页 |