| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第1章 引言 | 第13-27页 |
| 1.1 趋磁细菌的发现和应用前景 | 第13-14页 |
| 1.2 趋磁细菌和磁小体的特性 | 第14-18页 |
| 1.3 趋磁细菌纯培养的限制和发展 | 第18-19页 |
| 1.4 趋磁细菌遗传操作系统的发展 | 第19-20页 |
| 1.5 磁小体合成的机制研究 | 第20-25页 |
| 1.6 磁小体合成的高氧抑制 | 第25页 |
| 1.7 本课题研究背景 | 第25-26页 |
| 1.8 本课题研究目的意义 | 第26-27页 |
| 第2章 材料和方法 | 第27-35页 |
| 2.1 磁螺菌ME-1菌株的培养 | 第27页 |
| 2.2 CTAB/NaCl方法提取ME-1基因组DNA | 第27页 |
| 2.3 ME-1基因组测序、拼接以及基因组步移 | 第27-28页 |
| 2.4 ME-1基因组注释和分析 | 第28-29页 |
| 2.5 ME-1进化分析以及比较基因组学分析 | 第29-30页 |
| 2.6 ME-1微耗氧和耗氧培养 | 第30页 |
| 2.7 ME-1微耗氧和耗氧细胞的透射电子显微镜检测 | 第30页 |
| 2.8 微耗氧和耗氧ME-1胞内外的铁含量 | 第30-31页 |
| 2.9 ME-1微耗氧和耗氧的TotalRNA提取 | 第31页 |
| 2.10 ME-1转录组测序和分析 | 第31页 |
| 2.11 实时荧光定量PCR | 第31-32页 |
| 2.12 调控因子的预测和调控网络的构建 | 第32页 |
| 2.13 遗传操作系统实验 | 第32-34页 |
| 2.14 统计分析方法 | 第34页 |
| 2.15 序列号 | 第34-35页 |
| 第3章 结果与讨论 | 第35-82页 |
| 3.1 磁螺菌ME-1的基因组特征和同源进化关系分析 | 第35-40页 |
| 3.2 磁螺菌ME-1的碳素代谢 | 第40-43页 |
| 3.3 磁螺菌ME-1的氮素代谢 | 第43-44页 |
| 3.4 磁螺菌ME-1的磁小体合成基因岛 | 第44-48页 |
| 3.5 磁螺菌ME-1呼吸代谢系统及相关基因 | 第48-56页 |
| 3.5.1 磁螺菌ME-1呼吸链复合体 | 第48-51页 |
| 3.5.2 磁螺菌ME-1呼吸相关蛋白 | 第51-53页 |
| 3.5.3 磁螺菌ME-1氢化酶 | 第53-56页 |
| 3.6 磁螺菌ME-1的胁迫耐受机制及相关基因 | 第56-59页 |
| 3.7 氧胁迫ME-1的生长和磁小体的合成 | 第59-61页 |
| 3.8 磁螺菌ME-1在微耗氧和耗氧培养条件下的转录组表达差异 | 第61-62页 |
| 3.9 磁螺菌ME-1在微耗氧和耗氧培养条件下的qRT-PCR分析 | 第62-63页 |
| 3.10 氧对磁螺菌ME-1铁利用的影响 | 第63-64页 |
| 3.11 磁螺菌ME-1的磁小体基因岛的氧响应表达 | 第64-66页 |
| 3.12 磁螺菌ME-1的耗氧呼吸生长和氧化损伤修复 | 第66-72页 |
| 3.13 磁螺菌ME-1耗氧生长假定的调控网络 | 第72-74页 |
| 3.14 磁螺菌ME-1遗传操作系统的初步建立 | 第74-82页 |
| 3.14.1 磁螺菌ME-1电转化系统 | 第74-79页 |
| 3.14.2 磁螺菌ME-1接合转移系统 | 第79-82页 |
| 第4章 总结与展望 | 第82-86页 |
| 4.1 总结 | 第82-84页 |
| 4.2 展望 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-112页 |
| 附录 | 第112-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 作者简介及攻读学位期间发表的学术论文与研究结果 | 第131页 |
