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环状非编码RNA circTNFRSF11A通过let7g/CDK2通路调节胃癌发生、发展的分子机制研究

中文摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
英文缩略词表第10-16页
第一章 文献综述第16-33页
    1.1 胃癌的最新流行病学现状第16-17页
    1.2 circRNAs:肿瘤发生发展研究的新视角第17-27页
        1.2.1 circRNAs的来源第17-19页
        1.2.2 circRNAs的生物功能第19-23页
        1.2.3 circRNAs与肿瘤第23-25页
        1.2.4 circRNAs数据平台第25-27页
    1.3 整合组学数据分析方法学研究进展第27-33页
        1.3.1 组学数据的获取第27-28页
        1.3.2 组学数据分析中常用的计算生物学技术第28-30页
        1.3.3 多组学数据整合分析的方法学进展第30-33页
第二章 胃癌中以circRNAs为核心的分子调控网络分析第33-70页
    2.1 前言第33-34页
    2.2 胃癌组织中circRNAs分子表达谱检测第34-49页
        2.2.1 实验材料第34-36页
        2.2.2 实验方法第36-41页
        2.2.3 实验结果第41-49页
    2.3 circRNAs/miRNAs/mRNAs分子功能调控网络建模及circRNAs核心功能调控模块提取分析第49-64页
        2.3.1 实验材料第49-50页
        2.3.2 实验方法第50-51页
        2.3.3 实验结果第51-64页
    2.4 以circTNFRSF11A为中心的促癌调节功能模块提取及功能分析第64-68页
        2.4.1 实验材料第64页
        2.4.2 实验方法第64-65页
        2.4.3 实验结果第65-68页
    2.5 讨论第68-70页
第三章 circTNFRSF11A促进胃癌发生、发展的作用机制研究第70-107页
    3.1 前言第70-71页
    3.2 circTNFRSF11A在胃癌组织、细胞系中的表达水平验证第71-80页
        3.2.1 实验材料第71-73页
        3.2.2 实验方法第73-79页
        3.2.3 实验结果第79-80页
    3.3 circTNFRSF11A表达促进胃癌细胞增殖、侵袭并影响胃癌细胞周期第80-94页
        3.3.1 实验材料第80-82页
        3.3.2 实验方法第82-85页
        3.3.3 实验结果第85-94页
    3.4 circTNFRSF11A通过let7g/CDK2通路影响胃癌的发生与发展第94-105页
        3.4.1 实验材料第94-96页
        3.4.2 实验方法第96-101页
        3.4.3 实验结果第101-105页
    3.5 讨论第105-107页
第四章 结论第107-108页
参考文献第108-127页
附录第127-137页
    附录1 circRNAs表达数据标准化及差异表达分析R语言脚本第127-128页
    附录2 差异表达Volcano Plot绘制R语言脚本第128-130页
    附录3 差异表达circRNAs Heatmap Plot绘制R语言脚本第130-131页
    附录4 基因GO功能注释分析、KEGG代谢通路富集分析及疾病相关分析R语言脚本第131-134页
    附录5 基因GO功能注释分析、KEGG代谢通路富集分析及疾病相关分析结果的可视化展示柱状图、气泡图以及代谢通路图绘制R语言脚本第134-137页
附表1 显著性差异表达circRNAs信息第137-149页
附表2 circRNAs分子调控网络节点分子的GO功能注释生物过程(Biological Process)分析结果列表第149-165页
附表3 circRNAs分子调控网络节点分子的GO功能注释细胞组分(Cellular Component)分析结果列表第165-168页
附表4 circRNAs分子调控网络节点分子的GO功能注释分子功能(Molecular Function)分析结果列表第168-170页
作者简介第170-173页
致谢第173页

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