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饭豆根尖早期铝应答基因的鉴定与功能分析

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 文献综述第16-31页
    1.1 植物Al毒害第16-17页
    1.2 植物耐Al机制第17-18页
    1.3 有机酸分泌是大多数植物主要的耐Al机制第18-29页
        1.3.1 有机酸分泌种类第18页
        1.3.3 有机酸分泌模式第18-29页
            1.3.3.1 有机酸转运蛋白第19-20页
            1.3.3.2 转运蛋白基因上游序列调节因子第20-21页
            1.3.3.3 转运蛋白基因拷贝数第21-22页
            1.3.3.4 转录因子第22-24页
            1.3.3.5 蛋白可逆磷酸化第24-25页
            1.3.3.6 有机酸合成代谢第25-26页
            1.3.3.7 能量代谢第26-28页
            1.3.3.8 质膜H~+-ATPase第28页
            1.3.3.9 其它第28-29页
    1.4 组学在植物耐Al中的研究第29-30页
    1.5 本研究的目的意义及主要内容第30-31页
2 饭豆早期Al应答基因的鉴定与分析第31-68页
    2.1 材料与方法第31-38页
        2.1.1 材料与试剂第31-32页
        2.1.2 相对根伸长的测量与Evans blue染色第32页
        2.1.3 总RNA的提取第32页
        2.1.4 双链cDNA合成第32-33页
        2.1.5 抑制差减cDNA文库的构建第33-35页
            2.1.5.1 双链cDNA的酶切消化与产物回收第33页
            2.1.5.2 接头连接第33页
            2.1.5.3 cDNA杂交第33-34页
            2.1.5.4 PCR扩增与纯化第34页
            2.1.5.5 克隆载体的连接与转化第34页
            2.1.5.6 重组子PCR扩增第34-35页
        2.1.6 反向Northern杂交筛选cDNA文库第35-36页
            2.1.6.1 探针标记第35页
            2.1.6.2 重组子PCR产物转膜第35页
            2.1.6.3 杂交第35页
            2.1.6.4 洗膜第35-36页
            2.1.6.5 免疫检测第36页
            2.1.6.6 显色第36页
        2.1.7 DNA测序与序列分析第36页
        2.1.8 实时定量PCR分析第36-38页
    2.2 结果与分析第38-59页
        2.2.1 Al胁迫对饭豆根伸长的影响第38-40页
        2.2.2 RNA的提取LD-PCR循环数的确定第40-41页
        2.2.3 酶切与接头连接第41-43页
        2.2.4 PCR抑制差减杂交第43-44页
        2.2.5 重组子PCR鉴定第44-45页
        2.2.6 差异表达cDNA的鉴定第45-50页
        2.2.7 SSH数据的验证第50-52页
        2.2.8 序列装配和EST注释第52-54页
        2.2.9 差异表达基因的功能分类第54-57页
        2.2.10 两个Al处理浓度SSH文库中共同鉴定的基因第57页
        2.2.11 信号转导和转录相关基因第57页
        2.2.12 转运子相关基因第57-58页
        2.2.13 胁迫/防御相关基因第58页
        2.2.14 代谢与能量相关基因第58页
        2.2.15 细胞壁结构与修饰相关基因第58-59页
        2.2.16 其它生物学进程相关基因第59页
    2.3 讨论第59-68页
3 饭豆VuSTOP1转录因子基因的克隆与功能研究第68-92页
    3.1 材料与方法第68-76页
        3.1.1 实验材料第68-69页
        3.1.2 培养条件第69页
        3.1.3 RNA和DNA提取第69页
        3.1.4 RACE技术扩增基因全长第69-70页
        3.1.5 生物信息学分析第70页
        3.1.6 Southern杂交第70-71页
        3.1.7 载体构建第71-72页
        3.1.8 亚细胞定位第72页
        3.1.9 转录激活实验第72-73页
        3.1.10 VuSTOP1在饭豆中的表达分析第73页
        3.1.11 拟南芥stop1突变体鉴定第73-74页
        3.1.12 拟南芥转化第74页
        3.1.13 回复株系根伸长实验第74页
        3.1.14 回复株系基因表达分析第74-76页
    3.2 结果与分析第76-89页
        3.2.1 VuSTOP1的克隆与生物信息学分析第76-81页
        3.2.2 VuSTOP1表达模式分析第81-83页
        3.2.3 VuSTOP1基本特性分析第83-85页
        3.2.4 拟南芥stop1突变体及回复株系鉴定第85-86页
        3.2.5 VuSTOP1回复拟南芥stop1表型分析第86页
        3.2.6 VuSTOP1回复株系基因表达分析第86-89页
    3.3 讨论第89-92页
4 结论与展望第92-94页
5 参考文献第94-110页
6 附表第110-130页
7 致谢第130-132页
8 攻读博士期间发表的论文第132页

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