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利用RNA干扰抑制MCF-7细胞中CTCF基因的表达

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
第一部分 引言第8-15页
   ·CTCF介绍第8-11页
   ·RNAi介绍第11-15页
第二部分 siRNA转染载体的构建第15-23页
   ·材料第15页
     ·质粒、载体、序列第15页
     ·工具酶与试剂第15页
     ·LB培养基第15页
     ·实验仪器第15页
   ·方法第15-20页
     ·几种敲除CTCF基因mRNA发夹(SiRNA)的设计思路第16-17页
     ·几种发夹结构寡核苷酸模板引物的设计结果第17-18页
     ·合成的寡核苷酸SiRNA模板进行退火第18页
     ·退火后的寡核苷酸siRNA模板与_pSilencer载体连接第18-19页
     ·转化大肠杆菌感受态细胞DH5a第19页
     ·质粒提取、琼脂糖凝胶电泳与测序第19-20页
     ·敲除质粒双酶切反应第20页
   ·结果第20-22页
     ·阳性克隆的鉴定第20-22页
   ·结果讨论第22-23页
     ·质粒提取时需要注意几点第22页
     ·敲除质粒双酶切结果分析第22页
     ·提取质粒送去测序结果分析第22-23页
第三部分 稳定转染干扰CTCF基因质粒的细胞系的建立第23-31页
     ·材料第23页
     ·细胞培养、转染及加压筛选试剂第23页
     ·待转染质粒第23页
     ·仪器及试剂第23页
   ·方法第23-25页
     ·G418的最佳筛选浓度的确定第24页
     ·稳定转染pEGFP质粒的细胞的筛选第24-25页
     ·稳定转染敲除质粒的细胞筛选第25页
   ·结果第25-29页
     ·G418的最佳筛选浓度的选择第26页
     ·稳定转染pEGFP质粒的细胞的获得第26-27页
     ·4种敲除质粒转染时阳性对照质粒24小时后的转染效率第27-29页
     ·敲除效率阳性对照组实验结果第29页
   ·结果讨论第29-31页
     ·筛选之前G418浓度的确定第29-30页
     ·G418的最佳筛选浓度的确定结果分析第30页
     ·转染效率分析第30页
     ·敲除效率分析第30-31页
第四部分 CTCF干扰效率分析第31-55页
   ·材料第31-35页
     ·试剂第31-34页
     ·仪器第34-35页
   ·方法第35-43页
     ·蛋白免疫印迹对CTCF在敲除和野生型MCF-7细胞中表达量差异性分析第35-39页
     ·Real-Time PCR对CTCF在敲除和野生型MCF-7细胞中表达差异性分析第39-43页
   ·结果第43-52页
     ·BCA法测定蛋白标准曲线结果第43-44页
     ·蛋白浓度测定结果第44页
     ·蛋白免疫印迹对CTCF在敲除和野生型细胞中表达差异性分析结果第44-46页
     ·细胞总RNA核酸电泳图第46-47页
     ·几种c DNA定量结果第47页
     ·Real-Time PCR对CTCF在敲除细胞(MCF-7/siCTCF3)和野生型细胞中表达量差异性分析结果第47-49页
     ·Real-Time PCR对CTCF在敲除细胞(MCF-7/siCTCF4)和野生型MCF-7细胞中表达量差异性分析结果第49-51页
     ·Real-Time PCR对CTCF在敲除细胞(MCF-7/siCTCFl、MCF-7/siCTCF2)和野生型MCF-7细胞中表达量差异性分析结果第51-52页
   ·结果讨论第52-55页
     ·提取细胞总RNA时注意几点第52-53页
     ·蛋白含量的测定(BCA蛋白定量试剂盒)原理第53页
     ·Real Time PCR结果分析第53页
     ·Western Blot结果分析第53页
     ·Western Blot和Real Time PCR二者之间结果分析第53-54页
     ·CTCF敲除效率分析第54-55页
第五部分 CTCF基因拯救载体的构建第55-63页
   ·材料第55页
     ·工具酶及载体第55页
     ·试剂盒第55页
   ·方法第55-61页
     ·突变掉敲除位点后的CTCF-cDNA扩增第55-58页
     ·载体p~(IRESPURO3)和CTCF-cDNA分别进行单酶切纯化、连接第58-61页
   ·结果第61-62页
     ·上下游扩增产物及重构后的CTCF-cDNA琼脂糖凝胶电泳结果第61-62页
     ·构建好的拯救载体测序验证第62页
   ·结果讨论第62-63页
结论第63-65页
参考文献第65-70页
附录第70-79页
致谢第79-80页
攻读硕士学位期间研究成果第80-81页
稿件录用函第81-82页

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