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青枯雷尔氏菌FJAT-91全基因组分析及胞外多糖功能研究

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 前言第13-20页
    1.1 青枯雷尔氏菌概况第13-14页
        1.1.1 青枯病的发生与危害第13页
        1.1.2 青枯雷尔氏菌侵染特性第13-14页
        1.1.3 植物发病症状第14页
    1.2 青枯雷尔氏菌全基因组学第14-15页
    1.3 青枯雷尔氏菌致病机理第15-16页
    1.4 青枯雷尔氏菌的致病因子第16-18页
        1.4.1 胞外多糖第16-17页
        1.4.2 Ⅲ型分泌系统第17页
        1.4.3 细胞壁降解酶第17-18页
    1.5 植物青枯病的防治第18-19页
        1.5.1 农业防治第18页
        1.5.2 化学防治第18页
        1.5.3 生物防治第18-19页
    1.6 本研究的目的及意义第19-20页
2 材料与方法第20-30页
    2.1 实验材料第20-22页
        2.1.1 菌株与质粒第20页
        2.1.2 植物材料第20页
        2.1.3 培养基第20-21页
        2.1.4 试剂与仪器第21-22页
        2.1.5 引物第22页
    2.2 青枯雷尔氏菌FJAT-91基因组测序与分析第22-23页
        2.2.1 基因组DNA的提取第22-23页
        2.2.2 基因组DNA质量检测第23页
        2.2.3 基因组测序及组装第23页
        2.2.4 基因组功能注释第23页
        2.2.5 比较基因组学第23页
    2.3 重组质粒载体的构建第23-26页
        2.3.1 质粒DNA提取第23-24页
        2.3.2 PCR扩增DNA片段第24页
        2.3.3 DNA片段/质粒载体双酶切第24页
        2.3.4 DNA片段和质粒载体连接第24-25页
        2.3.5 重组质粒转化感受态大肠杆菌DH5α第25页
        2.3.6 阳性克隆的PCR验证第25页
        2.3.7 阳性克隆的酶切验证第25-26页
    2.4 epsD缺失突变株的构建第26-27页
        2.4.1 青枯雷尔氏菌感受态的制备第26页
        2.4.2 电转化第26页
        2.4.3 突变株的筛选第26-27页
    2.5 epsD回复突变株构建第27页
    2.6 青枯雷尔氏菌弱化指数测定第27页
    2.7 青枯雷尔氏菌菌体形态第27页
    2.8 青枯雷尔氏菌生长曲线测定第27-28页
    2.9 青枯雷尔氏菌胞外多糖含量测定第28页
    2.10 高效离子交换色谱分离青枯雷尔氏菌第28-29页
    2.11 青枯雷尔氏菌运动性检测第29页
    2.12 青枯雷尔氏菌定殖能力测定第29页
    2.13 青枯雷尔氏菌致病性生物测定第29-30页
3 结果与分析第30-51页
    3.1 青枯雷尔氏菌基因组第30-36页
        3.1.1 DNA质量分析第30页
        3.1.2 基因组基本特征第30-32页
        3.1.3 基因注释第32-35页
        3.1.4 比较基因组学研究第35页
        3.1.5 epsD基因生物信息学分析第35-36页
    3.2 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株的构建第36-41页
        3.2.1 epsD基因重组质粒的构建第36-39页
        3.2.2 epsD基因缺失突变株的构建第39-41页
    3.3 青枯雷尔氏菌epsD回复突变株的构建第41-42页
    3.4 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株弱化指数变化第42-43页
    3.5 青枯雷尔氏菌菌体形态变化第43-44页
    3.6 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株生长速率变化第44页
    3.7 胞外多糖含量测定第44-45页
    3.8 高效离子交换色谱分离第45-46页
    3.9 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株运动能力变化第46-48页
    3.10 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株定殖能力变化第48-49页
    3.11 青枯雷尔氏菌epsD缺失突变株致病力变化第49-51页
4 讨论与展望第51-55页
    4.1 小结第51页
    4.2 讨论第51-54页
    4.3 展望第54-55页
5 参考文献第55-61页
攻读学位期间的学术论文与研究成果第61-62页
致谢第62页

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