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拟南芥温度胁迫和红光响应基因XCT表观遗传机理探究

符号说明第4-9页
中文摘要第9-11页
Abstract第11-12页
1 引言第13-32页
    1.1 表观遗传学第13-14页
        1.1.1 表观遗传学发展现状及主要研究内容第13-14页
    1.2 DNA甲基化与去甲基化第14-18页
        1.2.1 植物DNA甲基化的特点第14-16页
        1.2.2 植物DNA甲基转移酶第16-17页
        1.2.3 植物DNA去甲基化过程第17页
        1.2.4 DNA甲基化基因表达调控的机制第17-18页
    1.3 RNA介导的DNA甲基化第18-20页
        1.3.1 siRNA的形成第18-19页
        1.3.2 RdDM的作用机理第19-20页
    1.4 表观遗传调控植物响应非生物胁迫第20页
    1.5 低温胁迫第20-27页
        1.5.1 低温胁迫对植物的伤害第20-21页
        1.5.2 冷胁迫信号第21-22页
        1.5.3 转录调节第22-26页
        1.5.4 转录后调节第26-27页
    1.6 植物抗高温研究进展第27-29页
        1.6.1 高温胁迫对植物的损伤第27-28页
        1.6.2 植物对高温胁迫的响应机制第28-29页
    1.7 光信号反应第29-30页
        1.7.1 光信号反应的介绍第29-30页
        1.7.2 光反应的光受体调节第30页
    1.8 本实验的目的意义第30-32页
2 材料与方法第32-49页
    2.1 实验材料第32-37页
        2.1.1 植物材料第32页
        2.1.2 菌株与质粒第32页
        2.1.3 酶与各种生化试剂第32-33页
        2.1.4 引物第33-35页
        2.1.5 网络信息资源第35-37页
    2.2 实验方法第37-49页
        2.2.1 植物全基因组的提取第37页
        2.2.2 载体构建第37-39页
        2.2.3 PCR鉴定突变体纯合植株第39页
        2.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第39-41页
        2.2.5 农杆菌感受态细胞的制备和转化第41页
        2.2.6 拟南芥转化及转基因植株鉴定第41-42页
        2.2.7 RNA的提取纯化与反转录第42-43页
        2.2.8 实时定量PCR第43-44页
        2.2.9 亚硫酸氢盐处理基因组第44-45页
        2.2.10 miRcute miRNA Isolation Kit提取sRNA第45-46页
        2.2.11 siRNA的定量检测第46-48页
        2.2.12 亚硫酸盐测序PCR(Bisulfite Sequencing PCR, BSP)第48页
        2.2.13 幼苗红光处理第48-49页
3 结果与分析第49-68页
    3.1 拟南芥温度胁迫相关表观遗传调控分析第49-64页
        3.1.1 生物信息学方法筛选拟南芥温度诱导的表观遗传调控相关基因第49-57页
            3.1.1.1 拟南芥温度胁迫诱导基因的筛选第49-50页
            3.1.1.2 拟南芥温度胁迫基因启动子DNA甲基化和组蛋白修饰分析第50-54页
            3.1.1.3 拟南芥温度胁迫候选基因启动子区域的24-nt siRNA靶向分析第54-56页
            3.1.1.4 候选基因的启动子DNA甲基化测序引物设计第56-57页
        3.1.2 拟南芥中温度诱导且表观遗传调控相关候选基因验证第57-59页
        3.1.3 候选基因的超表达植株、T-DNA插入突变体和RNAi植株的表型及功能鉴定第59-64页
            3.1.3.1 候选基因的超表达植、T-DNA插入突变体和RNAi植株的获得第59-61页
            3.1.3.2 温度胁迫下AT2G21150 T-DNA插入突变体植株的表型鉴定第61-64页
    3.2 XCT(XAP5 circadian timekeeper)基因表观遗传调控机理研究第64-68页
        3.2.1 XCT基因启动子区域的表观遗传学修饰分析第64页
        3.2.2 XCT基因的红光响应实验验证第64-66页
        3.2.3 XCT基因启动子区域的24-nt siRNA分析第66页
        3.2.4 XCT基因启动子区域的24-nt siRNA积累量检测第66-68页
4 讨论第68-70页
5 结论第70-71页
参考文献第71-83页
致谢第83-84页
攻读学位期间发表论文情况第84页

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