| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略语表 | 第8-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-25页 |
| 1.1 蓝藻概述 | 第13页 |
| 1.2 集胞藻 PCC6803 的演化和生物学特性 | 第13-15页 |
| 1.3 S2P 级联调节基因表达 | 第15-17页 |
| 1.3.1 ECF σ因子 | 第15-16页 |
| 1.3.2 抗σ因子 | 第16页 |
| 1.3.3 S2P 蛋白酶 | 第16-17页 |
| 1.3.4 S2P 级联 | 第17页 |
| 1.4 集胞藻 PCC 6803 的胁迫响应研究现状 | 第17-23页 |
| 1.4.1 葡萄糖混合营养胁迫 | 第17-19页 |
| 1.4.2 冷胁迫 | 第19-20页 |
| 1.4.3 盐胁迫 | 第20-21页 |
| 1.4.4 渗透胁迫 | 第21-22页 |
| 1.4.5 高光胁迫 | 第22-23页 |
| 1.5 本论文立题背景，研究内容和意义 | 第23-25页 |
| 1.5.1 立题背景和意义 | 第23-24页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第24-25页 |
| 第二章 集胞藻 PCC6803 基因组重测序 | 第25-45页 |
| 2.1 引言 | 第25页 |
| 2.2 材料和仪器 | 第25-26页 |
| 2.2.1 主要材料 | 第25-26页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第26页 |
| 2.3 实验方法 | 第26-30页 |
| 2.3.1 集胞藻 PCC6803 培养 | 第26-27页 |
| 2.3.2 基因组 DNA 提取 | 第27页 |
| 2.3.3 基因组 DNA 浓度检测 | 第27-28页 |
| 2.3.4 菌种鉴定 | 第28-29页 |
| 2.3.5 基于 Illumina Hiseq2000 基因组重测序 | 第29页 |
| 2.3.6 生物信息学分析流程 | 第29-30页 |
| 2.4 实验结果 | 第30-44页 |
| 2.4.1 基因组 DNA 提取 | 第30-31页 |
| 2.4.2 菌种鉴定 | 第31-32页 |
| 2.4.3 原始测序数据质控和剪切 | 第32页 |
| 2.4.4 原始测序数据统计 | 第32-33页 |
| 2.4.5 比对统计结果 | 第33页 |
| 2.4.6 GT-C-WT 中突变位点检测 | 第33-43页 |
| 2.4.7 GT-C-0643 中突变位点检测 | 第43-44页 |
| 2.5 本章小结 | 第44-45页 |
| 第三章 葡萄糖混养下集胞藻△SLR0643 突变体生理分析 | 第45-60页 |
| 3.1 引言 | 第45页 |
| 3.2 材料和仪器 | 第45-47页 |
| 3.2.1 主要材料 | 第45-46页 |
| 3.2.2 主要仪器 | 第46-47页 |
| 3.3 实验方法 | 第47-49页 |
| 3.3.1 葡萄糖混养条件下生长曲线 | 第47页 |
| 3.3.2 糖中间代谢物毒性分析 | 第47页 |
| 3.3.3 全细胞吸收光谱 | 第47页 |
| 3.3.4 叶绿素含量的测定 | 第47-48页 |
| 3.3.5 相对藻蓝蛋白含量的测定 | 第48页 |
| 3.3.6 低温叶绿素荧光 | 第48页 |
| 3.3.7 藻细胞粒度测定 | 第48页 |
| 3.3.8 糖类似物点板实验 | 第48页 |
| 3.3.9 上清中葡萄糖含量的测定 | 第48页 |
| 3.3.10 糖原含量的测定 | 第48-49页 |
| 3.3.11 糖代谢相关基因的表达 | 第49页 |
| 3.4 实验结果 | 第49-59页 |
| 3.4.1 葡萄糖混养条件下生长曲线 | 第49-50页 |
| 3.4.2 糖代谢中间产物毒性分析 | 第50-52页 |
| 3.4.3 全细胞吸收光谱 | 第52-53页 |
| 3.4.4 叶绿素和藻蓝蛋白含量的测定 | 第53-54页 |
| 3.4.5 低温叶绿素荧光 | 第54页 |
| 3.4.6 藻细胞粒度 | 第54-55页 |
| 3.4.7 糖类似物点板 | 第55-56页 |
| 3.4.8 上清中葡萄糖含量的测定 | 第56-57页 |
| 3.4.9 上清中糖原含量的测定 | 第57-58页 |
| 3.4.10 糖代谢相关基因的表达 | 第58-59页 |
| 3.5 本章小结 | 第59-60页 |
| 第四章 葡萄糖混养下转录组测序分析 | 第60-80页 |
| 4.1 引言 | 第60页 |
| 4.2 材料和仪器 | 第60-61页 |
| 4.2.1 主要材料 | 第60-61页 |
| 4.2.2 主要仪器 | 第61页 |
| 4.3 实验方法 | 第61-64页 |
| 4.3.1 集胞藻 PCC6803 总 RNA 提取 | 第61-62页 |
| 4.3.2 RNA 样品中去 DNA | 第62页 |
| 4.3.3 RNA 质量检测 | 第62页 |
| 4.3.4 转录组测序 | 第62-63页 |
| 4.3.5 信息分析流程 | 第63-64页 |
| 4.4 实验结果 | 第64-79页 |
| 4.4.1 实验设计和 RNA 质量检测 | 第64-66页 |
| 4.4.2 转录组整体质量评估 | 第66-67页 |
| 4.4.3 原始数据统计和比对 | 第67-68页 |
| 4.4.4 差异表达分析 | 第68-79页 |
| 4.5 本章小结 | 第79-80页 |
| 第五章 S2P 同源蛋白在多种胁迫下的表达谱分析 | 第80-93页 |
| 5.1 引言 | 第80页 |
| 5.2 材料和仪器 | 第80-81页 |
| 5.2.1 主要材料 | 第80-81页 |
| 5.2.2 主要仪器 | 第81页 |
| 5.3 实验方法 | 第81-83页 |
| 5.3.1 各种胁迫条件简介 | 第81-82页 |
| 5.3.2 集胞藻 PCC6803 总 RNA 提取 | 第82页 |
| 5.3.3 RNA 样品中去 DNA | 第82页 |
| 5.3.4 引物设计与合成 | 第82-83页 |
| 5.3.5 RT-PCR 反应 | 第83页 |
| 5.3.6 RT-PCR 反应 | 第83页 |
| 5.4 实验结果 | 第83-91页 |
| 5.4.1 集胞藻 PCC6803 总 RNA 提取 | 第83-84页 |
| 5.4.2 高光胁迫 | 第84-86页 |
| 5.4.3 渗透胁迫 | 第86-87页 |
| 5.4.4 葡萄糖混养 | 第87-88页 |
| 5.4.5 冷胁迫 | 第88-90页 |
| 5.4.6 盐胁迫 | 第90-91页 |
| 5.5 本章小结 | 第91-93页 |
| 结论与展望 | 第93-95页 |
| 1. 结论 | 第93-94页 |
| 2. 创新点 | 第94页 |
| 3. 展望 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-104页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 附件 | 第106页 |
