| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 集群建模算法和多元线性集群建模算法 | 第7-23页 |
| 1.1 集群建模简介 | 第7-15页 |
| 1.1.1 背景介绍 | 第7-8页 |
| 1.1.2 集群建模简介 | 第8-9页 |
| 1.1.3 集群建模的应用 | 第9-15页 |
| 1.2 多元线性集群建模简介 | 第15-17页 |
| 1.2.1 背景介绍 | 第15页 |
| 1.2.2 MLRMPA算法介绍 | 第15-17页 |
| 1.3 MLRMPA算法的实现工具——R语言 | 第17-19页 |
| 1.3.1 R语言简介 | 第17-18页 |
| 1.3.2 R语言与化学计量学 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究目的和意义 | 第19页 |
| 1.5 论文研究内容 | 第19-20页 |
| 参考文献 | 第20-23页 |
| 第二章 HIV-1 NNRTIs的多元线性集群建模研究 | 第23-43页 |
| 2.1 研究背景 | 第23-25页 |
| 2.2 数据和方法 | 第25-30页 |
| 2.2.1 数据 | 第25-28页 |
| 2.2.2 描述符的产生和选择 | 第28-29页 |
| 2.2.3 方法 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第30-40页 |
| 2.3.1 Codessa计算描述符HM建模 | 第30-32页 |
| 2.3.2 Dragon计算描述符和HM建模 | 第32-34页 |
| 2.3.3 Dragon计算描述符和MLRMPA建模 | 第34-40页 |
| 2.4 结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-43页 |
| 第三章 MLRMPA程序包 | 第43-59页 |
| 3.1 研究背景 | 第43-44页 |
| 3.2 程序包的编写 | 第44-47页 |
| 3.2.1 Rtools工具软件的安装 | 第44-45页 |
| 3.2.2 R脚本的准备 | 第45页 |
| 3.2.3 程序包的准备文件 | 第45-46页 |
| 3.2.4 程序包的编译 | 第46-47页 |
| 3.2.5 程序包的发布 | 第47页 |
| 3.3 程序包MLRMPA | 第47-48页 |
| 3.4 程序包使用范例 | 第48-53页 |
| 3.5 结果及讨论 | 第53-56页 |
| 3.6 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-59页 |
| 第四章 总结与展望 | 第59-61页 |
| 4.1 总结 | 第59页 |
| 4.2 展望 | 第59-61页 |
| 在学期间的研究成果 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 附录 | 第63-72页 |