| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1.1 植物叶色突变体的研究概况 | 第13-19页 |
| 1.1.1 植物叶色突变体的来源 | 第13-14页 |
| 1.1.2 植物叶色突变体的分类 | 第14页 |
| 1.1.3 植物叶色突变的生理机制 | 第14-15页 |
| 1.1.4 植物叶色突变的分子机制 | 第15-19页 |
| 1.2 EMS诱变技术 | 第19-20页 |
| 1.2.1 EMS诱变的原理 | 第19页 |
| 1.2.2 EMS诱变的特点 | 第19-20页 |
| 1.3 植物功能基因组学的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.3.1 基因组学 | 第20页 |
| 1.3.2 植物功能基因组学 | 第20页 |
| 1.3.3 植物功能基因组学的主要研究技术 | 第20-22页 |
| 1.4 研究的目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 大白菜叶片黄化突变体lcm3的光合生理特性分析 | 第23-29页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-25页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23页 |
| 2.1.2 生长参数的测定 | 第23页 |
| 2.1.3 光合色素含量的测定 | 第23-24页 |
| 2.1.4 光合作用参数的测定 | 第24页 |
| 2.1.5 叶绿素荧光参数的测定 | 第24页 |
| 2.1.6 叶绿体超微结构观察 | 第24-25页 |
| 2.2 结果与分析 | 第25-28页 |
| 2.2.1 突变体lcm3的形态特征 | 第25页 |
| 2.2.2 突变体lcm3生长曲线的绘制 | 第25-26页 |
| 2.2.3 突变体lcm3光合色素含量分析 | 第26页 |
| 2.2.4 突变体lcm3光合作用参数分析 | 第26页 |
| 2.2.5 突变体lcm3叶绿素荧光参数分析 | 第26-27页 |
| 2.2.6 突变体lcm3叶绿体超微结构观察 | 第27-28页 |
| 2.3 小结 | 第28-29页 |
| 第三章 大白菜叶片黄化突变基因lcm3的克隆 | 第29-37页 |
| 3.1 材料与方法 | 第29-33页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第29页 |
| 3.1.2 遗传分析 | 第29页 |
| 3.1.3 定位群体的构建 | 第29页 |
| 3.1.4 DNA的提取及检测 | 第29-30页 |
| 3.1.5 全基因组重测序 | 第30页 |
| 3.1.6 数据质量控制 | 第30-32页 |
| 3.1.7 利用改进的MutMap方法克隆候选基因 | 第32页 |
| 3.1.8 候选基因的进一步验证 | 第32-33页 |
| 3.2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 3.2.1 突变体lcm3的遗传分析 | 第33页 |
| 3.2.2 测序质量评估 | 第33-34页 |
| 3.2.3 候选基因预测 | 第34-36页 |
| 3.2.4 候选基因的进一步验证 | 第36页 |
| 3.3 小结 | 第36-37页 |
| 第四章 大白菜叶片黄化突变体lcm3的转录组测序分析 | 第37-52页 |
| 4.1 材料与方法 | 第37-40页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第37页 |
| 4.1.2 总RNA的提取与检测 | 第37-38页 |
| 4.1.3 构建cDNA文库及Illumina测序 | 第38-39页 |
| 4.1.4 数据基本分析 | 第39页 |
| 4.1.5 基因表达水平定量 | 第39页 |
| 4.1.6 差异表达基因筛选 | 第39页 |
| 4.1.7 GO富集分析 | 第39页 |
| 4.1.8 Pathway富集分析 | 第39-40页 |
| 4.2 结果与分析 | 第40-50页 |
| 4.2.1 测序质量评估 | 第40-42页 |
| 4.2.2 与参考基因组的比对 | 第42-43页 |
| 4.2.3 与参考基因的比对 | 第43-44页 |
| 4.2.4 基因覆盖度分析 | 第44-45页 |
| 4.2.5 Reads随机性 | 第45页 |
| 4.2.6 基因差异表达分析 | 第45-46页 |
| 4.2.7 与叶绿素代谢和光合作用相关的差异表达基因分析 | 第46-47页 |
| 4.2.8 差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第47-49页 |
| 4.2.9 差异表达基因的Pathway功能显著性富集分析 | 第49-50页 |
| 4.3 小结 | 第50-52页 |
| 讨论 | 第52-55页 |
| 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
