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OsHMGB1基因在水稻与白叶枯病菌互作中的功能研究

中文摘要第12-14页
Abstract第14-15页
1 引言第16-40页
    1.1 水稻白叶枯病的研究第16-19页
        1.1.1 水稻白叶枯病的发生症状和分布第16页
        1.1.2 水稻白叶枯病菌的研究第16-17页
        1.1.3 白叶枯病菌的致病性第17-18页
        1.1.4 稻黄单胞菌的III型分泌蛋白第18-19页
    1.2 水稻抗白叶枯病基因的研究进展第19-21页
        1.2.1 LRR结构的抗病基因第19-20页
        1.2.2 R基因类型的白叶枯病抗性基因第20页
        1.2.3 细胞壁相关激酶基因Xa第20-21页
        1.2.4 隐性抗病基因第21页
    1.3 植物免疫系统第21-25页
        1.3.1 病原相关分子模式和模式识别受体第22-23页
        1.3.2 效应蛋白抑制植物的抗性反应第23页
        1.3.3 R蛋白介导抗性第23-24页
        1.3.4 抗病基因的作用机理第24-25页
            1.3.4.1 基因对基因第24页
            1.3.4.2 防卫假说第24-25页
            1.3.4.3 捕获模型第25页
    1.4 植物MtN3/saliva/SWEET蛋白家族第25-32页
        1.4.1 植物MtN3/saliva/SWEET家族蛋白的结构特征和分类第25-26页
        1.4.2 植物MtN3/saliva/SWEET家族蛋白的生理功能第26-28页
            1.4.2.1 MtN3/saliva/SWEET家族蛋白的糖转运功能第26-27页
            1.4.2.2 MtN3/saliva/SWEET家族蛋白参与植物的发育过程第27页
            1.4.2.3 MtN3/saliva/SWEET家族基因参与植物与病原的互作第27-28页
        1.4.3 MtN3/saliva/SWEET第三亚族蛋白在水稻与白叶枯病菌互作中的功能第28-32页
    1.5 高迁移率族蛋白HMG第32-36页
        1.5.1 哺乳动物HMGB蛋白研究进展第33页
        1.5.2 植物HMGB蛋白家族研究进展第33-35页
        1.5.3 HMGB蛋白在植物与病原互作中的作用第35-36页
    1.6 植物钙调素介导的信号转导系统第36-38页
        1.6.1 Ca~(2+)/CaM信号与蛋白质的磷酸化作用第37页
        1.6.2 Ca~(2+)/CaM信号与基因转录调控第37页
        1.6.3 Ca~(2+)/CaM信号与活性氧代谢第37-38页
        1.6.4 CaM/CML与植物免疫作用第38页
    1.7 本研究的目的意义第38-40页
2 材料与方法第40-51页
    2.1 植物材料与来源第40页
    2.2 菌株与载体第40-41页
    2.3 核酸操作第41-43页
        2.3.1 植物基因组DNA抽提第41页
        2.3.2 植物总RNA抽提第41页
        2.3.3 质粒抽提第41页
        2.3.4 DNA纯化及回收第41-42页
        2.3.5 PCR产物连接反应第42页
        2.3.6 通过PCR方法对克隆载体或转基因植株进行阳性鉴定第42页
        2.3.7 RT-PCR和定量PCR分析第42-43页
    2.4 蛋白质操作第43页
        2.4.1 植物总蛋白的提取第43页
        2.4.2 蛋白质免疫印迹分析第43页
    2.5 原核表达和GSTpull-down分析第43-44页
        2.5.1 蛋白表达载体的构建第43-44页
        2.5.2 融合蛋白的诱导表达第44页
        2.5.3 GSTpull-down实验第44页
    2.6 双分子荧光互补和免疫共沉淀第44-45页
    2.7 酵母双杂交第45-47页
        2.7.1 载体构建第45页
        2.7.2 Bait的转录激活活性检测第45-46页
        2.7.3 BaitOsHMGB1的自激活和毒性验证第46页
        2.7.4 酵母双杂交文库的筛选第46页
        2.7.5 酵母互作验证第46-47页
    2.8 水稻基因的克隆与转化第47-48页
        2.8.1 植物表达载体的构建第47页
        2.8.2 CRISPR/Cas9载体的构建第47页
        2.8.3 农杆菌介导的遗传转化第47-48页
        2.8.4 转基因植株的阳性检测第48页
    2.9 病原菌的接种、病情调查第48页
    2.10 转录组测序和分析第48-51页
        2.10.1 测序样品准备第48-49页
        2.10.2 转录组测序数据的可用性评估第49页
        2.10.4 差异基因的GO富集分析第49页
        2.10.5 差异基因的pathway富集分析第49-51页
3 结果与分析第51-87页
    3.1 OsHMGB1-RNAi植株对多个白叶枯病菌小种具备抗性第52-55页
        3.1.1 中花11背景下抑制OsHMGB1的植株对白叶枯病菌的广谱抗性分析第52-54页
        3.1.2 IRBB13背景下抑制OsHMGB1的植株对白叶枯病菌的广谱抗性分析第54-55页
    3.2 水稻第三亚族多个SWEET蛋白通过羧基端与OsHMGB1互作第55-59页
        3.2.1 通过酵母双杂交验证CladeIIIOsSWEET蛋白与OsHMGB1互作第55-56页
        3.2.2 通过GSTpull-down验证CladeIIIOsSWEET蛋白与OsHMGB1互作第56-57页
        3.2.3 双分子荧光互补验证OsHMGB1与CladeIIIOsSWEET蛋白互作第57-58页
        3.2.4 通过Co-IP验证OsHMGB1与CladeIIIOsSWEET蛋白互作第58-59页
    3.3 OsSWEET12~15能够互补OsSWEET11对白叶枯病的感病功能第59-63页
        3.3.1 OsSWEET14在水稻对白叶枯病的感病中能够互补OsSWEET11的功能第60-62页
        3.3.2 OsSWEET12~15在对白叶枯病的感病中均能互补OsSWEET11的功能第62-63页
    3.4 水稻中OsHMGB1同源基因OsHMGB710的功能研究第63-71页
        3.4.1 病原接种后OsHMGB家族基因的表达模式分析第65-66页
        3.4.2 OsHMGB710基因在水稻与白叶枯病菌互作中的功能研究第66-70页
            3.4.2.1 超量表达OsHMGB710增强了水稻对白叶枯病的抗性第66-68页
            3.4.2.2 oshmgb710突变体对水稻白叶枯病抗性能力减弱第68-70页
        3.4.3 oshmgb1oshmgb710双突变体的获得第70-71页
    3.5 OsHMGB1互作蛋白OsCML3功能研究第71-75页
        3.5.1 OsHMGB1不具有转录激活作用第71页
        3.5.2 BaitOsHMGB1的自激活验证和毒性检测第71-72页
        3.5.3 利用酵母双杂交筛选与OsHMGB1互作的水稻蛋白第72-73页
        3.5.4 OsHMGB1与OsCML3的相互作用第73页
        3.5.5 OsCML3基因在水稻与白叶枯病菌互作中的功能研究第73-75页
            3.5.5.1 OsCML3表达模式分析第73-74页
            3.5.5.2 oscml3功能缺失突变体的获得第74-75页
    3.6 OsHMGB1-RNAi植株和amiXa13植株的转录组分析第75-87页
        3.6.1 转录组测序样品的制备第76页
        3.6.2 转录组测序基本信息分析第76-77页
        3.6.3 amiXa13/MH63差异基因GO富集分析第77-78页
        3.6.4 ZDH/ZH11差异基因GO功能富集第78-80页
        3.6.5 差异基因的pathway富集分析第80-85页
            3.6.5.1 参与细胞响应的基因富集第82-83页
            3.6.5.2 参与植物与病原菌互作过程的基因分析第83-85页
        3.6.6 Ca~(2+)/CaM和Ca~(2+)/CML信号相关基因表达分析第85-87页
4 讨论第87-93页
    4.1 OsSWEET11羧基端介导新的信号传递机制第87-88页
    4.2 OsHMGB1介导多个OsSWEET蛋白对水稻免疫反应的负调控作用第88-89页
    4.3 OsHMGB1是植物免疫信号中重要作用因子第89-90页
    4.4 OsHMGB1可能通过负调控其同源基因OsHMGB710的表达参与对水稻免疫反应的调控过程第90页
    4.5 OsHMGB1可能偶联Ca~(2+)/CML信号第90-91页
    4.6 OsHMGB1介导多个SWEET蛋白负调控水稻免疫反应的作用模型第91-93页
5 结论第93-94页
    5.1 OsHMGB1介导多个SWEET蛋白对水稻免疫反应的负调控作用第93页
    5.2 OsHMGB1可能通过偶联Ca~(2+)信号参与水稻的防卫反应第93页
    5.3 OsHMGB710正调控水稻对白叶枯病的防御反应第93-94页
参考文献第94-113页
附录Ⅰ:本研究所用引物第113-115页
附录Ⅱ:酵母感受态制备以及PEG/LiAc介导的酵母转化法第115-117页
致谢第117-118页
攻读学位期间发表论文情况第118页

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