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瑞氏木霉内质网蛋白折叠因子突变株的构建及性质分析

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
缩略词(Abbreviation)第14-15页
第一章 绪论第15-31页
    1.1 纤维素第16-17页
        1.1.1 纤维素分子结构与性质第16-17页
        1.1.2 纤维素的生物降解第17页
    1.2 纤维素酶第17-23页
        1.2.1 纤维素酶的来源及微生物降解纤维素的策略第18-19页
        1.2.2 纤维素酶的组成第19-20页
        1.2.3 纤维素酶的分子结构第20-22页
            1.2.3.1 催化结构域(CD)第21页
            1.2.3.2 结合结构域(CBD)第21-22页
            1.2.3.3 Linker区第22页
        1.2.4 纤维素酶的应用前景及存在的问题第22-23页
    1.3 蛋白折叠与内质网质量控制(endoplasmic reticulum quality control,ERQC)第23-28页
        1.3.1 内质网质量控制及其意义第23-25页
        1.3.2 Calnexin/Calreticulin循环第25-28页
    1.4 瑞氏木霉纤维素酶的分泌及研究进展第28-29页
    1.5 论文的立题依据及工作内容第29-31页
第二章 瑞氏木霉中参与蛋白质折叠的内质网因子缺失菌的构建及性状分析第31-56页
    2.1 实验材料及试剂第32-34页
        2.1.1 菌株和质粒第32页
        2.1.2 主要试剂第32页
        2.1.3 培养基第32-33页
            2.1.3.1 瑞氏木霉培养基第32-33页
            2.1.3.2 大肠杆菌LB培养基第33页
        2.1.4 本章中用到的引物及序列第33-34页
    2.2 实验方法第34-46页
        2.2.1 菌种保藏技术第34-35页
        2.2.2 大肠杆菌感受态细胞的制备第35页
        2.2.3 大肠杆菌转化第35-36页
        2.2.4 质粒提取第36页
        2.2.5 瑞氏木霉的培养第36-37页
        2.2.6 引物设计与PCR扩增第37页
        2.2.7 Gateway敲除系统第37-39页
        2.2.8 BP Clone反应第39页
        2.2.9 真菌转化第39-40页
        2.2.10 真菌基因组DNA的提取第40-41页
        2.2.11 酶活测定第41-42页
            2.2.11.1 pNP标准曲线的制作第41页
            2.2.11.2 pNPC酶活测定第41页
            2.2.11.3 pNPG酶活测定第41-42页
            2.2.11.4 CMC酶活测定第42页
            2.2.11.5 Avicel酶活测定第42页
        2.2.12 Southern blot第42-46页
            2.2.12.1 基因组提取第42-43页
            2.2.12.2 酶切基因组第43页
            2.2.12.3 乙醇沉淀酶切后的基因组第43-44页
            2.2.12.4 标记探针第44页
            2.2.12.5 电泳第44页
            2.2.12.6 转膜第44-45页
            2.2.12.7 固定第45页
            2.2.12.8 预杂交与杂交第45页
            2.2.12.9 Strigency Washes第45页
            2.2.12.10 免疫检测第45-46页
    2.3 结果与讨论第46-54页
        2.3.1 cne1、prpA敲除载体的构建第46-47页
            2.3.1.1 cne1、prpA上下游同源臂的扩增第46-47页
            2.3.1.2 BP Clone反应及转化子的挑选第47页
        2.3.2 真菌转化及Δcne1及ΔprpA菌株的验证第47-49页
        2.3.3 Southern blot验证第49-50页
        2.3.4 缺失菌性质检测第50-53页
            2.3.4.1 Δcne1与ΔprpA菌株在不同碳源上的生长第50-51页
            2.3.4.2 Δcne1、ΔprpA菌株在羧甲基纤维素钠(CMC-Na)平板上水解圈第51-52页
            2.3.4.3 Δcne1、ΔprpA菌株pNPC酶活测定第52-53页
        2.3.5 Δcne1菌株酶活性质的测定第53-54页
    2.4 小结与讨论第54-56页
第三章 △cne1菌株纤维素外切酶CBHI的产生、分泌动力学及稳定性分析第56-65页
    3.1 实验材料及试剂第56-58页
        3.1.1 菌种第56页
        3.1.2 瑞氏木霉MA培养基第56-57页
        3.1.3 主要试剂第57页
        3.1.4 缓冲液的配制第57页
        3.1.5 蛋白电泳第57-58页
            3.1.5.1 SDS-PAGE胶的配制第57-58页
            3.1.5.2 蛋白电泳第58页
            3.1.5.3 蛋白考马斯亮蓝染色第58页
    3.2 实验方法第58-60页
        3.2.1 胞内全蛋白的提取第58-59页
        3.2.2 蛋白胞内生成和胞外分泌情况分析第59页
        3.2.3 CBHI胞内及胞外稳定性分析第59页
        3.2.4 Western blot检测第59-60页
    3.3 结果与分析第60-64页
        3.3.1 胞内CBHI产生情况分析第60-61页
        3.3.2 胞外CBHI分泌情况分析第61页
        3.3.3 胞内蛋白稳定性测定第61-63页
        3.3.4 胞外蛋白稳定性分析第63-64页
    3.4 小结与讨论第64-65页
第四章 发酵液中CBHI的分离纯化第65-76页
    4.1 实验材料第65-66页
        4.1.1 菌种第65页
        4.1.2 瑞氏木霉MA培养基第65页
        4.1.3 主要仪器及试剂第65-66页
        4.1.4 缓冲液及配制第66页
    4.2 实验方法第66-68页
        4.2.1 发酵液的收集第66页
        4.2.2 发酵液的浓缩第66-67页
        4.2.3 硫胺沉淀及浓缩后除盐第67页
        4.2.4 超滤离心更换蛋白样品的缓冲液第67页
        4.2.5 DEAE阴离子交换层析层析柱的装配第67-68页
        4.2.6 蛋白电泳第68页
        4.2.7 pNPC水解酶活性测定第68页
    4.3 结果与讨论第68-74页
        4.3.1 发酵液中蛋白的浓缩第68-69页
        4.3.2 DEAE阴离子交换层析第69-71页
        4.3.3 Mono Q阴离子交换层析第71-73页
        4.3.4 样品及各洗脱峰pNPC酶活的测定第73页
        4.3.5 发酵液中全蛋白分析第73-74页
    4.4 小结与讨论第74-76页
第五章 瑞氏木霉内质网中参与CBHI折叠相关分子伴侣的分离第76-93页
    5.1 材料和方法第76-79页
        5.1.1 菌株和质粒第76-77页
        5.1.2 瑞氏木霉培养基和培养条件第77页
        5.1.3 大肠杆菌LB培养基第77页
        5.1.4 主要试剂第77页
        5.1.5 本章用到的蛋白缓冲液及其配方第77-78页
        5.1.6 本章中用到的引物第78-79页
    5.2 实验方法第79-81页
        5.2.1 菌种保藏技术第79页
        5.2.2 瑞氏木霉的培养第79页
        5.2.3 大肠杆菌感受态的制备、大肠转化及质粒提取第79页
        5.2.4 真菌转化及真菌基因组提取第79页
        5.2.5 Western blot检测第79页
        5.2.6 蛋白银染第79页
        5.2.7 蛋白浓缩—三氯乙酸(TCA)沉淀第79-80页
        5.2.8 微粒体(microsome)的提取第80页
        5.2.9 免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)第80-81页
    5.3 结果与分析第81-91页
        5.3.1 CBHI抗体的合成及其免疫沉淀反应第81-82页
        5.3.2 CBHI加标签菌株的构建第82-88页
            5.3.2.1 同源替换盒的构建第83页
            5.3.2.2 加标签菌株的验证第83-85页
            5.3.2.3 CBHI加标签菌株(CBHI Tag)的改造第85-88页
        5.3.3 CBHI内质网折叠相关分子伴侣的分离第88-91页
            5.3.3.1 微粒体(microsome)的分离分析第88-89页
            5.3.3.2 免疫共沉淀第89-91页
    5.4 小结与分析第91-93页
全文总结与展望第93-94页
参考文献第94-102页
致谢第102-103页
附件第103页

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