| 摘要 | 第11-14页 |
| Abstract | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-39页 |
| 1.1 恶苗病相关研究进展 | 第17-22页 |
| 1.1.1 恶苗病研究概况 | 第17-18页 |
| 1.1.2 水稻恶苗病菌相关研究 | 第18-19页 |
| 1.1.3 水稻恶苗病抗性遗传研究及抗源的挖掘 | 第19-22页 |
| 1.2 转录组学研究进展 | 第22-26页 |
| 1.2.1 转录组学概况 | 第22-23页 |
| 1.2.2 基因芯片技术 | 第23页 |
| 1.2.3 RNA-Seq技术 | 第23-25页 |
| 1.2.4 植物抗病转录组学研究进展 | 第25-26页 |
| 1.3 蛋白质组学研究进展 | 第26-31页 |
| 1.3.1 蛋白质组学的产生 | 第26-27页 |
| 1.3.2 蛋白质组学研究的技术 | 第27-28页 |
| 1.3.3 定量蛋白质组学 | 第28-29页 |
| 1.3.4 植物响应生物胁迫的蛋白质组学研究 | 第29-31页 |
| 1.4 水稻抗病的转录组学和蛋白质组学联合研究 | 第31-32页 |
| 1.5 QTL原理及定位方法 | 第32-36页 |
| 1.5.1 QTL定位作图群体 | 第33-34页 |
| 1.5.2 QTL定位方法 | 第34-35页 |
| 1.5.3 植物抗病QTL的定位研究 | 第35-36页 |
| 1.6 杂交水稻多抗聚合育种的必要性 | 第36-37页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第37-39页 |
| 第二章 水稻响应恶苗病菌侵染的表达谱分析 | 第39-55页 |
| 2.1 材料与方法 | 第39-42页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第39页 |
| 2.1.2 恶苗病菌的采集、培养和菌液的配制 | 第39-40页 |
| 2.1.3 恶苗病菌接种处理 | 第40页 |
| 2.1.4 RNA提取、cDNA文库构建和测序 | 第40-41页 |
| 2.1.5 测序数据分析及差异表达基因鉴定 | 第41页 |
| 2.1.6 聚类分析和功能注释 | 第41页 |
| 2.1.7 RNA-Seq结果的qRT-PCR验证 | 第41-42页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第42-54页 |
| 2.2.1 9311和日本晴接种F.fujikuroi病菌后的表型差异分析 | 第42-43页 |
| 2.2.2 测序结果分析 | 第43-45页 |
| 2.2.3 水稻和恶苗病菌互作的差异表达基因鉴定分析 | 第45-49页 |
| 2.2.4 RNA-Seq数据的GO分析 | 第49-51页 |
| 2.2.5 两个品种中和防御相关的差异表达基因解析 | 第51-53页 |
| 2.2.6 各染色体上差异表达基因占总基因的比例分析 | 第53-54页 |
| 2.3 结论 | 第54-55页 |
| 第三章 水稻响应恶苗病菌侵染的蛋白质组定量分析 | 第55-67页 |
| 3.1 材料与方法 | 第55-58页 |
| 3.1.1 材料 | 第55页 |
| 3.1.2 蛋白质提取 | 第55页 |
| 3.1.3 蛋白质浓度检测 | 第55-56页 |
| 3.1.4 TMT标记 | 第56-57页 |
| 3.1.5 强阳离子交换色谱样品分级 | 第57页 |
| 3.1.6 蛋白质鉴定信息统计 | 第57-58页 |
| 3.1.7 Cluster聚类分析 | 第58页 |
| 3.1.8 GO和PATHWAY信号通路注释和富集 | 第58页 |
| 3.2 结果与分析 | 第58-64页 |
| 3.2.1 蛋白鉴定及蛋白定量 | 第58-59页 |
| 3.2.2 Cluster聚类 | 第59页 |
| 3.2.3 GO和PATHWAY信号通路的注释和富集分析 | 第59-61页 |
| 3.2.4 蛋白组与转录组的关联分析 | 第61-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-67页 |
| 第四章 恶苗病抗性的QTL定位 | 第67-75页 |
| 4.1 材料与方法 | 第67-69页 |
| 4.1.1 实验材料和图谱构建 | 第67-68页 |
| 4.1.2 恶苗病菌的分离和培养 | 第68页 |
| 4.1.3 恶苗病菌的接种 | 第68页 |
| 4.1.4 恶苗病抗性相关性状的调查 | 第68页 |
| 4.1.5 数据分析和QTL定位 | 第68-69页 |
| 4.2 结果与分析 | 第69-72页 |
| 4.2.1 亲本及RIL群体的抗恶苗病的性状表现 | 第69-70页 |
| 4.2.2 徒长比率和苗重比率的相关性分析 | 第70-72页 |
| 4.2.3 以徒长比率为表型值进行抗恶苗病QTL的检测 | 第72页 |
| 4.2.4 以苗重比率为表型值进行抗恶苗病QTL的检测 | 第72页 |
| 4.3 讨论 | 第72-75页 |
| 第5章 聚合抗病虫基因改良杂交水稻恢复系 | 第75-85页 |
| 5.1 材料与方法 | 第75-78页 |
| 5.1.1 实验材料和育种策略 | 第75-76页 |
| 5.1.2 MAS技术 | 第76-78页 |
| 5.1.3 白叶枯病、稻瘟病和褐飞虱抗性水平的鉴定 | 第78页 |
| 5.1.4 气象数据的搜集 | 第78页 |
| 5.2 结果分析 | 第78-83页 |
| 5.2.1 不同抗性基因在新品系中的聚合 | 第78-80页 |
| 5.2.2 新品系两年的抗病和抗褐飞虱水平的评价 | 第80-82页 |
| 5.2.3 气候变化对抗性水平的影响 | 第82-83页 |
| 5.3 讨论 | 第83-85页 |
| 第6章 结论与创新点 | 第85-88页 |
| 6.1 结论 | 第85-86页 |
| 6.2 主要创新点 | 第86-87页 |
| 6.3 下一步计划 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 攻读博士学位期间发表的文章 | 第104页 |
